云门寺源于云门文偃。文偃轿浆兰(864汗府循击-949)，俗姓张，嘉兴(今浙江)人。出茅几家后到各地参学。 初参睦州道，后参义存，堡谅获得印可。禅宗六祖惠能圆寂后，嗣法 弟子有湖南南岳怀让和江西青原行思两个法系。 到唐末五代间，南岳一系形成沩仰和临济二宗，青原一享循淋枣碑系分出曹洞、云门、欢戏捆法眼三宗，合称宙颂犁禅宗五家。 云门宗的传承 是：青原山行思--道悟--崇信--宣鉴--义存--文偃。
文偃在福州象骨山雪峰广福院得义存印可后，就来到韶州云门山，修复残破的光泰禅院，开创了自成 一系的云门宗禅风。其说教方式独特，被称作"云门三句"。 据《五灯会元》曰："我有三句话，示汝诸人。一句函盖乾坤，一句截断众流，一句随波逐浪。"悟此 三句便可入道。 
广东云门寺在虚云法师的努力下，1943年至1951年，历时10年，先后修建了殿堂楼阁300余间，雕塑佛菩萨圣像100余尊，并安禅传戒，演教弘宗，使梵宇重光，钟鼓重鸣，宗风重振。 从1953年起，虚云法师的入室弟子佛源继任云门大觉寺方丈，实行农禅并重，以寺养寺。"文革"中停止佛教活动。 1983年国务院确定大觉寺为汉地佛教全国重点寺院，受到政府的重视和保护。大觉寺交给佛教界管理使用，佛源法师回到云门，重修寺庙，再塑佛像，恢复佛教活动。 1986年农历十月十五日至十七日，大觉寺举行传戒法会，有800多人分别受出家和在家二众的戒律。云门寺住持佛源法师、广州光孝寺住持本焕法师、香港大屿山宝莲寺住持圣一法师分别担任传戒师。 由于云门寺在文革期间遭到严重破坏，1984年，在政府的支持和海内外信徒的资助下，又再次对云门寺进行了大规模的重建工作。 修复后的云门寺，主要建筑有天王殿、大雄宝殿、法堂、藏经楼、客堂、钟楼、功德堂、鼓楼、伽蓝殿、延寿堂、祖师殿、禅堂，还新建了虚云和尚纪念堂、舍利塔、山门、佛经流通处、凉亭等，殿堂内塑造了佛像，其中大雄宝殿内释迦牟尼像前两尊一立一卧的佛像，为纯正的缅甸汉白玉雕成；镶嵌在四壁的大型彩瓷佛面，下为十八罗汉，上是二十四天神，这在国内的佛殿中都是非常罕见的。 云门大觉寺共维修改建2600多平方米，新建9800多平方米。
这次重建后的云门寺，占地1.2万平方米，建筑面积7000多米，门、厅、殿、堂、舍等风格独特。寺里办有佛学院。 可从韶关乘车至乳源县汽车站后（距云门寺约2公里），打出租车或摩托车前往。 或者在汽车站大门右边等云门寺——大东的公交车，票价3元，大概1小时左右一辆。
云门寺位于粤北乳源瑶族自治县城东北6公里的云门山下，公元923年由云门宗始祖六祖惠能九传弟子文偃禅师所建，位于乳源县城北面6公里的慈云峰下，是我国佛教禅宗五大支派之一云门宗的发祥地，也是全国重点寺庙之一。 [1] 云门寺占地面积12000平方米，整座建筑物庄严雅静，风格独特，寺庙香火鼎盛，除放生池外，殿厅堂楼等共180余处连成一体。寺内保留着一批国家重点保护文物，较为著名的有距今1000多年的《大汉韶州云门光泰禅寺院故匡真大师实性碑铭并序》。
主要建筑有山门、天王殿、大雄宝殿、法堂、钟楼、禅堂、斋堂、教学楼、功德堂、延寿堂等。常住僧众约一百五十人，日常上殿、过堂、坐香、出坡等佛事尊丛林制，如法如律，是“农禅并重”的禅宗道场。 在大雄宝殿释迦牟尼的前面，有2尊小型的汉白玉佛像，一立一卧，是缅甸佛教徒于1798年赠的，用纯正的缅甸汉白玉雕刻而成，通体细滑，看上去具有强烈的质感，如真人肌肤一般，为云门寺珍宝。 殿内三面壁上是用陶瓷烧成的大型彩瓷佛画，长24米、高4米，是我国当前佛寺中的巨型彩色陶瓷壁画。 它生动地刻画十八罗汉、24诸天王42个人物，画面下层是十八罗汉，上层是二十四诸天像。 开设的课程有：佛法概论、佛教史、百法、八识、戒律、习禅初要、童蒙止观、禅宗大意、成佛之道、遗教经、天台宗纲要、三论玄义、起信论、金刚经、六祖坛经、圆觉经，以及丛林规范、古代汉语、写作、书法、唱念等。 该院院长兼云门寺老方丈佛源大和尚， [2]2009年87岁病故，老人历任：中国佛教协会咨议委员会副主席、中国佛教协会常务理事，广东省佛教协会副会长，广东南华寺、云门寺、湖南南岳祝圣寺、益阳栖霞寺等寺院方丈。 现任监院明严法师，湖南益阳人。 
