EMP1
| EMP1 | |||||||||||||||||||||||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| Identifikatori | |||||||||||||||||||||||||
| Aliasi | EMP1 | ||||||||||||||||||||||||
| Vanjski ID-jevi | OMIM:602333MGI:107941HomoloGene:1088GeneCards:EMP1 | ||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
| Ortolozi | |||||||||||||||||||||||||
| Vrste | Čovjek | Miš | |||||||||||||||||||||||
| Entrez | |||||||||||||||||||||||||
| Ensembl | |||||||||||||||||||||||||
| UniProt | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (mRNK) | |||||||||||||||||||||||||
| RefSeq (bjelančevina) | |||||||||||||||||||||||||
| Lokacija (UCSC) | Chr 12: 13.2 – 13.22 Mb | Chr 6: 135.34 – 135.36 Mb | |||||||||||||||||||||||
| PubMedpretraga | [3] | [4] | |||||||||||||||||||||||
| Wikipodaci | |||||||||||||||||||||||||
| |||||||||||||||||||||||||
Epitelni membranski protein 1jeproteinkoji je kodljudikodirangenomEMP1.[5][6][7]
Aminokiselinska sekvenca
[uredi|uredi izvor]Dužinapolipeptidnoglanca je 157aminokiselina,amolekulska težina17.563Da.[8]
| 10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
|---|---|---|---|---|---|---|---|---|
| MLVLLAGIFV | VHIATVIMLF | VSTIANVWLV | SNTVDASVGL | WKNCTNISCS | ||||
| DSLSYASEDA | LKTVQAFMIL | SIIFCVIALL | VFVFQLFTME | KGNRFFLSGA | ||||
| TTLVCWLCIL | VGVSIYTSHY | ANRDGTQYHH | GYSYILGWIC | FCFSFIIGVL | ||||
| YLVLRKK |
- Simboli
C:Cistein
D:Asparaginska kiselina
E:Glutaminska kiselina
F:Fenilalanin
G:Glicin
H:Histidin
I:Izoleucin
K:Lizin
L:Leucin
M:Metionin
N:Asparagin
P:Prolin
Q:Glutamin
R:Arginin
S:Serin
T:Treonin
V:Valin
W:Triptofan
Y:Tirozin
Kloniranje i ekspresija
[uredi|uredi izvor]Ben-Porath i Benvenisty (1996) klonirali sucDNKkoja kodira protein-1 epitelne membrane (EMP1), koji su po njima nazvali TMP, koristećiRT-PCRnaRNKbubregaljudskog embrija.[9]
Ruegg et al. (1996) nezavisno su izolirali cDNK koja kodira EMP1, zvani B4B, koristećiPCRna diferencijalnom zaslonu. Predviđeni protein EMP1 sa 157 aminokiselina sadrži četiritransmembranska domenai dva potencijalnaN-kraj-vezana mjesta glikozilacije u prvoj vanćelijskoj petlji.[10]
Chen et al. (1997.) otkrili su da EMP1, po njima nazvan CL-20, dijeli 39% identiteta aminokiselina s perifernimmijelinskimproteinom-22 (PMP22); konzervirane aminokiseline nalaze se pretežno unutar domena koje pokrivaju membrane. KoristećiNorthern blotanalizu, otkrili su transkript EMP1 od 2,8 kb u većini pregledanih tkiva odraslih, ali ne i u mozgu, jetri, gušterači ili leukocitima periferne krvi. Zbog visokehomologijeaminokiselinskih sekvenci među PMP22, EMP1, EMP2 i EMP3, Ben-Porath i Benvenisty (1996) su predložili da su ti proteini članovi nove porodice. KoristećiRT-PCR,otkrili su ekspresiju EMP1 u embrionskom bubregu, mozgu i crijevima, ali ne i u jetri i timusu. Na temelju predloženih funkcija PMP22, predložili su da je EMP1 uključen u interakcije ćelija-ćelija i kontrolućelijske proliferacije.
Struktura gena
[uredi|uredi izvor]Chen et al (1997) otkrili su da gen EMP1 sadrži petegzonai četiriintrona,te su primijetili da se spojevi egzona/introna nalaze na istim pozicijama kao i PMP22, sugerirajući da su EMP1 i PMP22 nastali duplikacijom zajedničkog predačkog gena.[11] Marvin et al (1995) lokalizirali su gen EMP1 uhromosomu 12pomoću hibridne ploče somatskih ćelija.fluorescentnom hibridizacijomin situ,Chen et al. (1997.) i Ruegg et al. (1996.) mapirali su gen EMP1 na 12p12, odnosno sekvencu 20q12-q13.1. Pomoću FISH -a, hibridizacije somatskih ćelija i hibridne analize zračenjem, Liehr et al. (1999) potvrdili su dodjeljivanje EMP1 gena hromosomu 12p12.3. Ben Porath et al. (1998) mapirali suhomolognigen miša u hromosomu 6.[12][13][14]
Gefitinib je hemoterapeutsko sredstvo koje se natječe zamjesto vezanjaATP-a na EGF receptoru (EGFR; 131550). Za proučavanje rezistencije na gefitinib u tumorima, Jain et al. (2005) razvili su adenokarcinomski ksenotransplant rezistentan na gefitinib kod golih miševa. Dobijanje rezistencije na gefitinib koreliralo je s površinskom ekspresijom Emp1. Ekspresija EMP1 je također u korelaciji sa smanjenim odgovorom na gefitinib u uzorcima pacijenata sakarcinomom pluća,kao i sa kliničkom progresijom do sekundarne rezistencije na gefitinib. Ekspresija EMP1 i rezistencija na gefitinib nisu bili ovisni o mutacijama EGFR-a osjetljivim na gefitinib.[15]
Reference
[uredi|uredi izvor]- ^abcGRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000134531-Ensembl,maj 2017
- ^abcGRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000030208-Ensembl,maj 2017
- ^"Human PubMed Reference:".National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^"Mouse PubMed Reference:".National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
- ^Ben-Porath I, Benvenisty N (Feb 1997). "Characterization of a tumor-associated gene, a member of a novel family of genes encoding membrane glycoproteins".Gene.183(1–2): 69–75.doi:10.1016/S0378-1119(96)00475-1.PMID8996089.
- ^Chen Y, Medvedev A, Ruzanov P, Marvin KW, Jetten AM (maj 1997)."cDNA cloning, genomic structure, and chromosome mapping of the human epithelial membrane protein CL-20 gene (EMP1), a member of the PMP22 family".Genomics.41(1): 40–8.doi:10.1006/geno.1997.4524.PMID9126480.
- ^"Entrez Gene: EMP1 epithelial membrane protein 1".
- ^"UniProt, P54849".Pristupljeno 9. 8. 2021.
- ^Ben-Porath, I., Benvenisty, N. Characterization of a tumor-associated gene, a member of a novel family of genes encoding membrane glycoproteins. Gene 183: 69-75, 1996.PubMed:8996089
- ^Ruegg, C. L., Wu, H., Fagnoni, F. F., Engleman, E. G., Laus, R. B4B, a novel growth-arrest gene, is expressed by a subset of progenitor/pre-B lymphocytes negative for cytoplasmic mu-chain. J. Immun. 157: 72-80, 1996.PubMed:8683158
- ^Chen, Y., Medvedev, A., Ruzanov, P., Marvin, K. W., Jetten, A. M. cDNA cloning, genomic structure, and chromosome mapping of the human epithelial membrane protein CL-20 gene (EMP1), a member of the PMP22 family. Genomics 41: 40-48, 1997. PubMed: 9126480
- ^Marvin, K. W., Fujimoto, W., Jetten, A. M. Identification and characterization of a novel squamous cell-associated gene related to PMP22. J. Biol. Chem. 270: 28910-28916, 1995. PubMed: 7499420
- ^Liehr, T., Kuhlenbaumer, G., Wulf, P., Taylor, V., Suter, U., Van Broeckhoven, C., Lupski, J. R., Claussen, U., Rautenstrauss, B. Regional localization of the human epithelial membrane protein genes 1, 2, and 3 (EMP1, EMP2, EMP3) to 12p12.3, 16p13.2, and 19q13.3. Genomics 58: 106-108, 1999. PubMed: 10331954
- ^Ben Porath, I., Kozak, C. A., Benvenisty, N. Chromosomal mapping of Tmp (Emp1), Xmp (Emp2), and Ymp (Emp3), genes encoding membrane proteins related to Pmp22. Genomics 49: 443-447, 1998.PubMed:9615230
- ^Jain, A., Tindell, C. A., Laux, I., Hunter, J. B., Curran, J., Galkin, A., Afar, D. E., Aronson, N., Shak, S., Natale, R. B., Agus, D. B. Epithelial membrane protein-1 is a biomarker of gefitinib resistance. Proc. Nat. Acad. Sci. 102: 11858-11863, 2005.PubMed:16087880
Dopunska literatura
[uredi|uredi izvor]- Jain A, Tindell CA, Laux I, et al. (2005)."Epithelial membrane protein-1 is a biomarker of gefitinib resistance".Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.102(33): 11858–63.doi:10.1073/pnas.0502113102.PMC1187965.PMID16087880.
- Gerhard DS, Wagner L, Feingold EA, et al. (2004)."The Status, Quality, and Expansion of the NIH Full-Length cDNA Project: The Mammalian Gene Collection (MGC)".Genome Res.14(10B): 2121–7.doi:10.1101/gr.2596504.PMC528928.PMID15489334.
- Wang HT, Kong JP, Ding F, et al. (2003)."Analysis of gene expression profile induced by EMP-1 in esophageal cancer cells using cDNA Microarray".World J. Gastroenterol.9(3): 392–8.doi:10.3748/wjg.v9.i3.392.PMC4621547.PMID12632483.
- Strausberg RL, Feingold EA, Grouse LH, et al. (2003)."Generation and initial analysis of more than 15,000 full-length human and mouse cDNA sequences".Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.99(26): 16899–903.doi:10.1073/pnas.242603899.PMC139241.PMID12477932.
- Wang HT, Liu ZH, Wang XQ, Wu M (2003). "[Effect of EMP-1 gene on human esophageal cancer cell line]".AI Zheng.21(3): 229–32.PMID12451984.
- Liehr T, Kuhlenbäumer G, Wulf P, et al. (1999). "Regional localization of the human epithelial membrane protein genes 1, 2, and 3 (EMP1, EMP2, EMP3) to 12p12.3, 16p13.2, and 19q13.3".Genomics.58(1): 106–8.doi:10.1006/geno.1999.5803.PMID10331954.
- Schiemann S, Rückels M, Engelholm LH, et al. (1997). "Differential gene expression in human mammary carcinoma cells: identification of a new member of a receptor family".Anticancer Res.17(1A): 13–20.PMID9066625.
- Lobsiger CS, Magyar JP, Taylor V, et al. (1997). "Identification and characterization of a cDNA and the structural gene encoding the mouse epithelial membrane protein-1".Genomics.36(3): 379–87.doi:10.1006/geno.1996.0482.PMID8884260.
- Ruegg CL, Wu HY, Fagnoni FF, et al. (1996). "B4B, a novel growth-arrest gene, is expressed by a subset of progenitor/pre-B lymphocytes negative for cytoplasmic mu-chain".J. Immunol.157(1): 72–80.PMID8683158.
- Marvin KW, Fujimoto W, Jetten AM (1996)."Identification and characterization of a novel squamous cell-associated gene related to PMP22".J. Biol. Chem.270(48): 28910–6.doi:10.1074/jbc.270.48.28910.PMID7499420.