Idi na sadržaj

GPA33

S Wikipedije, slobodne enciklopedije
GPA33
Identifikatori
AliasiGPA33
Vanjski ID-jeviOMIM:602171MGI:1891703HomoloGene:4245GeneCards:GPA33
Lokacija gena (čovjek)
Hromosom 1 (čovjek)
Hrom.Hromosom 1 (čovjek)[1]
Hromosom 1 (čovjek)
Genomska lokacija za GPA33
Genomska lokacija za GPA33
Bend1q24.1Početak167,052,836bp[1]
Kraj167,166,479bp[1]
Lokacija gena (miš)
Hromosom 1 (miš)
Hrom.Hromosom 1 (miš)[2]
Hromosom 1 (miš)
Genomska lokacija za GPA33
Genomska lokacija za GPA33
Bend1 H2.3|1 73.49 cMPočetak165,957,807bp[2]
Kraj165,994,079bp[2]
ObrazacRNK ekspresije
Više referentnih podataka o ekspresiji
Ortolozi
VrsteČovjekMiš
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (mRNK)

NM_005814

NM_021610
NM_001360925
NM_001360926

RefSeq (bjelančevina)

NP_005805

NP_067623
NP_001347854
NP_001347855

Lokacija (UCSC)Chr 1: 167.05 – 167.17 MbChr 1: 165.96 – 165.99 Mb
PubMedpretraga[3][4]
Wikipodaci
Pogledaj/uredi – čovjekPogledaj/uredi – miš

ĆelijskopovršinskiantigenA33jestproteinkoji je kodljudikodirangenomGPA33sahromosoma 1.[5][6][7]

Aminokiselinska sekvenca[uredi|uredi izvor]

Dužinapolipeptidnoglanca je 319aminokiselina,amolekulska težina35.632Da.[8]

1020304050
MVGKMWPVLWTLCAVRVTVDAISVETPQDVLRASQGKSVTLPCTYHTSTS
SREGLIQWDKLLLTHTERVVIWPFSNKNYIHGELYKNRVSISNNAEQSDA
SITIDQLTMADNGTYECSVSLMSDLEGNTKSRVRLLVLVPPSKPECGIEG
ETIIGNNIQLTCQSKEGSPTPQYSWKRYNILNQEQPLAQPASGQPVSLKN
ISTDTSGYYICTSSNEEGTQFCNITVAVRSPSMNVALYVGIAVGVVAALI
IIGIIIYCCCCRGKDDNTEDKEDARPNREAYEEPPEQLRELSREREEEDD
YRQEEQRSTGRESPDHLDQ

Funkcija[uredi|uredi izvor]

Glikoproteinkodiran ovim genom jeantigenćelijske površine koji je eksprimiran u više od 95% ljudskihkarcinom debelog crijeva.Otvoreni okvir čitanjakodira polipeptid od 319 aminokiselina koji ima navodnu sekretornusignalnu sekvencui tri potencijalna mjestaglikozilacije.Predviđeni zreli protein ima vanćelijsku regiju od 213 aminokiselina, jedantransmembranski domeni unutarćelijski rep od 62 aminokiseline. Sekvenca vanćelijskog regiona sadrži dva domena karakteristična za CD2 podgrupu natporodiceimunoglobulina(Ig).[7]

Reference[uredi|uredi izvor]

  1. ^abcGRCh38: Ensembl release 89: ENSG00000143167-Ensembl,maj 2017
  2. ^abcGRCm38: Ensembl release 89: ENSMUSG00000000544-Ensembl,maj 2017
  3. ^"Human PubMed Reference:".National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  4. ^"Mouse PubMed Reference:".National Center for Biotechnology Information, U.S. National Library of Medicine.
  5. ^Heath JK, White SJ, Johnstone CN, Catimel B, Simpson RJ, Moritz RL, Tu GF, Ji H, Whitehead RH, Groenen LC, Scott AM, Ritter G, Cohen L, Welt S, Old LJ, Nice EC, Burgess AW (Mar 1997)."The human A33 antigen is a transmembrane glycoprotein and a novel member of the immunoglobulin superfamily".Proc Natl Acad Sci U S A.94(2): 469–74.Bibcode:1997PNAS...94..469H.doi:10.1073/pnas.94.2.469.PMC19536.PMID9012807.
  6. ^Ritter G, Cohen LS, Nice EC, Catimel B, Burgess AW, Moritz RL, Ji H, Heath JK, White SJ, Welt S, Old LJ, Simpson RJ (Sep 1997). "Characterization of posttranslational modifications of human A33 antigen, a novel palmitoylated surface glycoprotein of human gastrointestinal epithelium".Biochem Biophys Res Commun.236(3): 682–6.doi:10.1006/bbrc.1997.6966.PMID9245713.
  7. ^ab"Entrez Gene: GPA33 glycoprotein A33 (transmembrane)".
  8. ^"UniProt, Q99795"(jezik: en.).Pristupljeno 11. 12. 2021.CS1 održavanje: nepoznati jezik (link)

Dopunska literatura[uredi|uredi izvor]

Vanjski linkovi[uredi|uredi izvor]

GPA33detalji ljudskog genoma uUCSC Genome Browser.