Jakoba

*Jakoba*
(Rodutaksonu Excavata)
Jakoba; (RodutaksonuExcavata)
	Četirijakobidnevrste, sa utorima i bičevima:Jakoba libera(ventralo),Stygiellaincarcerata(ventralno),Reclinomonas americana(dorzalno) iHistiona aroides(vanjski izgled)
Sistematika
Domena	Eukarioti
Razred	Jakobea
Red	Jakobida
Porodica	Jakobidae; Patterson 1990
Rod	Jakoba; Patterson 1990
Vrste
	Jakoba libera(Ruinen 1938) Patterson 1990;
Sinonimi
	Cryptobia liberaRuinen 1938;

Jakobajerodutaksonu Excavata^[1]i ima samo jednu opisanu vrstu,Jakoba libera.(Ranije opisanaJakoba incarceratapreimenovano je uAndalucia incarcerata,aJakoba bahamensis/Jakoba bahamiensisnije formalno opisana).^[2]

Opis

Jakobaje mala bakterivorna morskazooflagellata(jakobid),^[3]nađena i u hipersalinskom okruženju.^[2].One su slobodne plivajuće trofičke ćelije s dvabičai dužine između pet i deset mikrometara. Okreću se duž svoje uzdužne osi kako bi omogućile plivanje u pravim linijama^[3]osim ako se zbog kompresije u krhotinama ne dogodi deformacija i „škljocanje “. Za vrijeme hranjenja, bakterije se izlaze iz vodenog stuba strujom koju stvara zadnjibič.Ova struja uzrokuje da se bakterije sakupe u brazdi^[4]on the right ventral side of the cell^[3]– pomažući u gutanju i stvaranju hranjivevakuole.^[4]

Ultrastrultura

Ćelijske komponente kodJakobanisu naročito jedinstvene. Sadrže jednojedrokoje se nalazi u blizini bazebiča,jednoGolgijevo tijelo,amitohondrijske organelesu spljoštene.

Međutim,mitohondrijekodJakobaposebno su evolucijski zanimljive zbog jedinstvenebakteriolikosti– poputmitohondrijskog genoma.Utvrđeno je da njihovi mitohondrijskigenomisadrže znatno više funkcionalnihgenadrugiheukariotskihgrupa i čini se da su zadržali eubakterijsku predačkuRNK polimerazu,koja je zamijenjena polimerazom virusa tipa u svim ostalim mitohondrijskim eukariotima. Sve u svemu,jakobidni mitohondrijski genomisu primitivno složeni po tome što više nalikuju svojim proteobakterijskim precima nego što je to kod bilo kojih drugihmitohondrija.^[5]

Životni ciklus

Jakobekarakteriziraaseksualna reprodukcijaputembinarne fisije.Nije primijećenaspolna reprodukcijaili stvaranjecista.^[3]

Molekulske sekvence

Kružni mitohondrijski genomJakoba liberaATCC 50422 veličine je 96.6 kbp. Sekvenciranje je gotovo završeno. Dosad je identificirano 77 gena, od kojih nijedan nije uključivaointron.Intergenične regije čine ~ 30% genoma i sadrže nakupine tandemskih ponavljanja čija je jedinična dužina ~ 20 bp. Transkribirani geni nalaze se na oba lancanukleotidauDNK.Zatranslacijukoristi se standardnigenetički kod.

Enkodirani geni uključuju one koji se obično nalaze umtDNK,uključujući gene koji kodiraju proteine iznad 1,2,2,4,4L, 5,6, cob, cox1,2,3 i atp 6,8,9. kao velike podjedinice (rnl) i male podjedinice (rns) rRNK geni i >22 gema zatRNK.Prisutni su i brojni proteinski geni tipski zaprotist,ali ne i životinjske ili gljivičnemtDNK.Oni uključuju nad7,9,11, atp1, rpl2,5,6,14,16 i rps2-4,11-14,19. Mnogo jedinstvenih ORF-ova je također kodirano smtDNKuJ. libera.

Nekolikomitohondrijskih genaJ. liberasu rijetki ili ih nema u drugim mitohondrijskim genima, ali su prisutni ubakterijama.Među tim rijetkim ili jedinstvenim kodirajućimmtDNKgenima su dpo, rpoB, C, rrn5, rnpB, tufA, yejU-W i nekoliko genaribosomskogproteina.

Poređenje sekvenci gena umtDNKJ. liberapokazuje klastere koji se inače ne nalaze ubakterijama,ali koji su se očito pojavili tokom evolucije mitohondrijskog genoma, nakon divergencije protomitohondrija iz bakterijske loze. Primjeri su klasteri dpo, rpoB,C, rrn5, rnpB, tufA, yejU-W.^[6]

Kulture

Danas su dostupne tri kultivirane linije „Jakoba libera “. Ne mogu se uzgajati posebno, već se lahko uzgajaju u minimalnom mediju s dodatkom bakterija (Klebsiella aerogene)^[3]

Slični rodovi

Jakobids(JakobidailiJakobea)

Histiona:2-3 vrste
Reclinomonas:1 vrsta^[7]

Malawimonas:1 opisana vrsta.

Retortamonade:

Retortamonas
Chilomastix^[3]

Carpediemonas-liki organizmi:

Također pogledajte

Excavata

Reference

^Rodriquez-Ezpeleta, Naiara; Henner Brinkmann; Gertraud Burger; Andrew J. Roger; Michael W. Gray; Herve Philippe; B. Franz Lang (august 2007). "Toward Resolving the Eukaryotic Tree: The Phylogenetic Positions of Jakobids and Cercozoans".Current Biology.17(16): 1420–1425.doi:10.1016/j.cub.2007.07.036.PMID 17689961.
^^a ^b"Jakoba libera".The Tree of Life Web Project. Arhivirano soriginala,27. 9. 2011.Pristupljeno 3. 4. 2012.
^^a ^b ^c ^d ^e ^f"Jakoba".Protist Image Database. Arhivirano soriginala,22. 9. 2006.Pristupljeno 3. 4. 2012.
^^a ^b"Jakoba libera".Encyclopedia of Life.Pristupljeno 3. 4. 2012.
^"Jakobida".The Tree of Life Web Project. Arhivirano soriginala,29. 11. 2019.Pristupljeno 10. 2. 2020.
^"Jakoba libera Mitochondria genome organization, gene content, genetic code".Pristupljeno 3. 4. 2012.
^"Introduction to the jakobid flagellates".Protist Image Database.Pristupljeno 12. 4. 2012.

Vanjski linkovi

Commons logo

Commonsima datoteke na temu:Jakoba

[1] Rodriquez-Ezpeleta, Naiara; Henner Brinkmann; Gertraud Burger; Andrew J. Roger; Michael W. Gray; Herve Philippe; B. Franz Lang (august 2007). "Toward Resolving the Eukaryotic Tree: The Phylogenetic Positions of Jakobids and Cercozoans".Current Biology.17(16): 1420–1425.doi:10.1016/j.cub.2007.07.036.PMID 17689961.

[Jakoba_libera_-Tree_Life-2] "Jakoba libera".The Tree of Life Web Project. Arhivirano soriginala,27. 9. 2011.Pristupljeno 3. 4. 2012.

[Jakoba._Protist_Image_Database-3] "Jakoba".Protist Image Database. Arhivirano soriginala,22. 9. 2006.Pristupljeno 3. 4. 2012.

[Jakoba_libera-Encyclopedia_of_Life-4] "Jakoba libera".Encyclopedia of Life.Pristupljeno 3. 4. 2012.

[April_3,_2012-5] "Jakobida".The Tree of Life Web Project. Arhivirano soriginala,29. 11. 2019.Pristupljeno 10. 2. 2020.

[6] "Jakoba libera Mitochondria genome organization, gene content, genetic code".Pristupljeno 3. 4. 2012.

[7] "Introduction to the jakobid flagellates".Protist Image Database.Pristupljeno 12. 4. 2012.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

[6]

[7]