住院二次报销在社保局或医院办理。
在申请二次报销时，需要携带下面这些材料办理相关手续：
1.新农合补偿结算单；
2.居民身份证患者户籍原件、参合证（卡）原件；
3.医疗机构费用发票，或者加盖原件收存单位公章复印件；
4.费用清单、出院结算单或者盖原件收取单位公章的复印件；
5.持有特殊慢性病患者提供的慢性病证，或者二级以上医疗机构出具的特殊慢性病诊断证明以及门诊病历；
6.患者本人或者与患者有关系证明的关系人银行汇款账号。
二次报销”就是城镇居民医保或新农合的居民，如果去年看病有高额费用，除了正常报销之外，还能再报一次大病保险，而且不设封顶线。
找法网提醒您，新农合医疗报销比例：
1.新农合大病报销比例：
(1)门诊统筹乡、村补助比例分别提高到65%、75%。
(2)一级医疗机构住院费用在400元以下者，不设起付线，
(3)二级医疗机构补助比例提高到75%~80%，
(4)三级医疗机构补助比例提高到55%~60%。
(5)省三级医疗机构补助比例提高到55%。
(6)儿童先心病等8种大病新农合补助病种定额的70%，肺癌等12种大病，新农合补助病种定额力争达到70%。
2.新农合门诊报销比例：
(1)村卫生室、卫生所报销比例60%。
(2)镇卫生院报销比例40%。
(3)二级医院搏小比例30%。
(4)三级医院报销比例20%。
(5)镇级合作医疗门诊报销限额5000元/年。
3.新农合住院报销比例：
(1)新脑电图、X光透视、拍片、化验、理疗、针灸、CT、核磁共振等辅助检查项目限额报销200元。
(2)手术费起付线1000元内按照国家标准报销，超过1000元按照1000元报销。
(3)60岁以上老年人住院治疗费及护理费每天可报销10元，限额200元。
(4)各级医院报销比例为：镇卫生院报销60%，二级医院报销40%，三级医院报销30%。
农村合作医疗一般交上去一般1个月左右能报销下来。新型农村合作医疗报销范围为：
1.参加人员在统筹期内因病在定点医院住院诊治所产生的药费、检查费、化验费、手术费、治疗费、护理费等符合城镇职工医疗保险报销范围的部分；
2.新型农村合作医疗基金支付设立起付标准和最高支付限额。医院年起付标准以下的住院费用由个人自付。
