建设工程合同纠纷有：勘察、设计、施工、监理合同纠纷；工程合同的效力纠纷；合同无效结算纠纷；黑白合同纠纷；工程款结算采取何种标准纠纷；造价司法鉴定范围纠纷；工程质量、工期、农民工利益纠纷。
法律依据：
《中华人民共和国民法典》第七百九十六条
【建设工程监理】建设工程实行监理的，发包人应当与监理人采用书面形式订立委托监理合同。发包人与监理人的权利和义务以及法律责任，应当依照本编委托合同以及其他有关法律、行政法规的规定。
找法网提醒您，建设工程施工合同的基本内容有：
1.建设工程施工工程的名称和地点；
2.工程的范围和内容；
3.开工、竣工日期；
4.质量保修期及保修条件；
5.造价；
6.工程价款的支付、结算及交工验收办法；
7.设计文件；
8.设备的供应和进场期限；
9.协作事项；
10.违约责任。
建设工程合同诉讼时效是三年，自纠纷产生之日起计算。法律规定，向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。
《中华人民共和国民法典》第一百八十八条
【普通诉讼时效、最长权利保护期间】向人民法院请求保护民事权利的诉讼时效期间为三年。法律另有规定的，依照其规定。
诉讼时效期间自权利人知道或者应当知道权利受到损害以及义务人之日起计算。法律另有规定的，依照其规定。但是，自权利受到损害之日起超过二十年的，人民法院不予保护，有特殊情况的，人民法院可以根据权利人的申请决定延长。
