Bamfordvirae

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Bamfordvirae

EM-Aufnahme einesVirions(Virusteilchens) desMimivirus

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Varidnaviria[1][2]
Reich: Bamfordvirae[1]
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA
Baltimore: Gruppe 1
Wissenschaftlicher Name
Bamfordvirae
Kurzbezeichnung
DJRV
Links
ICTVTaxon History: 201908707
NCBITaxonomy: 2732005
Das genetische Netzwerk, das verschiedene Gruppen derBamfordviraeundeigennützige genetische Elemente(selfish genetic elements) verbindet. Die Verbindungen zwischen den Knoten sind farblich durch das Gen gekennzeichnet, dessenSequenzhomologiedie Verbindung herstellt.[A. 1][7]

Bamfordviraebezeichnet einReichvonViren.[8] DiesesTaxonist gekennzeichnet durch Hauptkapsidproteine (englischmajor capsid proteins) mit „double jelly roll“-Struktur (DJR-Viren).[9][10] Vor der offiziellen Bestätigung durch dasInternational Committee on Taxonomy of Viruses(ICTV)war diese Gruppe alsPRD1-Adenovirus-Liniebezeichnet worden.[11] Das Taxon ist nachDennis H. Bamfordbenannt, der zuerst die evolutionäre Verwandtschaft aller Viren DJR-Hauptkapsidproteinen postulierte.[12][13][11]

Systematik

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Adenoviren imTEM
VirophageMavirus(unten links) und das zugehörigeRiesenvirusCroV[14]

Vermutlich haben sich aus den kleineren Viren des PhylumsPreplasmiviricotadieRiesenvirendes PhylumsNucleocytoviricotaentwickelt (in diesem Fall wäre das PhylumPreplasmiviricotaparaphyletisch). Auch wenn es sich bei denPreplasmiviricotatatsächlich um ein paraphyletischesTaxonhandeln sollte, wird es für dieTaxonomieder Viren verwendet, da die zugehörigen Taxa miteinander verwandt sind und charakteristische Merkmale aufweisen, die sie von Riesenviren unterscheiden.[9][15][16][17][18]

Zu denBamfordviraegehören derzeit (mit Stand Ende April 2023) folgende vom ICTV bestätigten Mitglieder:[19]

Anmerkungen

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  1. ↑Legende zum genetischen Netzwerk:
    Knoten: Verbindungen:

Einzelnachweise

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  1. ↑abICTV:ICTV Master Species List 2019.v1,New MSL including all taxa updates since the 2018b release, March 2020 (MSL #35)
  2. ↑ICTV:ICTV Master Species List 2020.v1,New MSL including all taxa updates since the 2019 release, March 2021 (MSL #36)
  3. ↑ IPR000305: GIY-YIG endonuclease.Auf: InterPro: Classification of protein families.
  4. ↑ Joshua Pajak, Rockney Atz, Brendan J. Hilbert, Marc C. Morais, Brian A. Kelch, Paul J. Jardine, Gaurav Arya:Viral packaging ATPases utilize a glutamate switch to couple ATPase activity and DNA translocation.In:PNAS,Band 118, Nr. 17, 27. April 2021, e2024928118;doi:10.1073/pnas.2024928118,PMID 33888587,PMC 8092589(freier Volltext) (englisch).
  5. ↑ FOLLICULIN; FLCN.Auf: omim.org
  6. ↑ Bernhard Zondek:Über das Schicksal des Follikelhormons (Folliculin) im Organismus.In:Hormone des Ovariums und des Hypophysenvorderlappens,Springer Berlin, Heidelberg 1935, S. 124–153;ISBN 978-3-642-90600-8;doi:10.1007/978-3-642-92458-3_16,OnlineISBN 978-3-642-92458-3.Sowie Lancet 227, 356 (1934). - Skand. Arch. Physiol. (Berl. u. Lpz.) 70, 133 (1934).
  7. ↑ Natalya Yutin,Didier Raoult,Eugene V. Koonin:Virophages, polintons, and transpovirons: a complex evolutionary network of diverse selfish genetic elements with different reproduction strategies.In:Virology Journal.10. Jahrgang,Nr.1,2013,S.158,doi:10.1186/1743-422X-10-158,PMID 23701946,PMC 3671162(freier Volltext) – (englisch).
  8. ↑Virus Taxonomy: 2019 Release.In:talk.ictvonline.org.International Committee on Taxonomy of Viruses, März 2020,abgerufen am 25. April 2020(englisch).
  9. ↑ab Eugene V. Koonin,Valerian V. Dolja, Mart Krupovič, Arvind Varsani, Yuri I. Wolf, Natalya Yutin, M. Zerbini, Jens H. Kuhn:Create a megataxonomic framework, filling all principal taxonomic ranks, for DNA viruses encoding vertical jelly roll-type major capsid proteins.In:ICTV Proposal (Taxoprop).Oktober 2019,S.2019.003G,doi:10.13140/RG.2.2.14886.47684(englisch,researchgate.net).
  10. ↑ Kathryn M. Kauffman, Fatima A. Hussain, Joy Yang, Philip Arevalo, Julia M. Brown, William K. Chang, David VanInsberghe, Joseph Elsherbini, Radhey S. Sharma, Michael B. Cutler, Libusha Kelly, Martin F. Polz:A major lineage of non-tailed dsDNA viruses as unrecognized killers of marine bacteria.In:Nature,Band 554, S. 118–122, 24. Januar 2018;doi:10.1038/nature25474(englisch).
  11. ↑ab Mart Krupovič, Dennis H. Bamford:Virus evolution: how far does the double β-barrel viral lineage extend?In:Nature Reviews Microbiology.6. Jahrgang,Nr.12,Dezember 2008,S.941–948,doi:10.1038/nrmicro2033,PMID 19008892(englisch).
  12. ↑ Dennis H. Bamford, R. M. Burnett, D. I. Stuart:Evolution of viral structure.In:Theoretical Population Biology.61. Jahrgang,Nr.4,2002,S.461–470,doi:10.1006/tpbi.2002.1591,PMID 12167365(englisch).
  13. ↑ Dennis H. Bamford:Do viruses form3lineages across different domains of life?In:Research in Microbiology.154. Jahrgang,Nr.4,2003,S.231–236,doi:10.1016/S0923-2508(03)00065-2,PMID 12798226(englisch).
  14. ↑ S. Duponchel, M. G. Fischer:Viva lavidaviruses! Five features of virophages that parasitize giant DNA viruses.In:PLoS pathogens,Band 15, Nr. 3, 2019;doi:10.1371/journal.ppat.1007592(englisch).
  15. ↑ Natalya Yutin, Yuri I. Wolf,Eugene V. Koonin:Origin of giant viruses from smaller DNA viruses not from a fourth domain of cellular life.In:Virology,Band 466–467, Oktober 2014, S. 38–52;doi:10.1016/j.virol.2014.06.032,PMID 25042053,PMC 4325995(freier Volltext),ResearchGate(englisch).
  16. ↑ Jonathan Filée:Route of NCLDV evolution: the genomic accordion.In:Current Opinion in Virology,Band 3, Nr. 5, Oktober 2013, S. 595–599;doi:10.1016/j.coviro.2013.07.003(englisch).
  17. ↑ David Moreira, Céline Brochier-Armanet:Giant viruses, giant chimeras: The multiple evolutionary histories of Mimivirus genes.In:BMC Ecology and Evolution:Evolutionary Biology,Band 8, Nr. 12, 18. Januar 2008;doi:10.1186/1471-2148-8-12,PMID 18205905,PMC 2263039(freier Volltext) (englisch).
  18. ↑ Tom Williams, T. Martin Embley, Eva Heinz:Informational Gene Phylogenies Do Not Support a Fourth Domain of Life for Nucleocytoplasmic Large DNA Viruses.In:PLoS ONE,Band 6, Nr. 6, 16. Juni 2011, S. e21080;doi:10.1371/journal.pone.0021080,ResearchGate(englisch).
  19. ↑ICTV:Master Species Lists.§ ICTV Master Species List 2022 MSL38 v1 (xlsx).
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