Lipothrixviridae

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Lipothrixviridae

Beta- undDeltalipothrixvirus,dazwischenCaptovirus(ehemalsGammalipothrixvirus,jetzt Fam.Ungulaviridae)

Systematik
Klassifikation: Viren
Realm: Adnaviria[1]
Reich: Zilligvirae
Phylum: Taleaviricota
Klasse: Tokiviricetes
Ordnung: Ligamenvirales
Familie: Lipothrixviridae
Taxonomische Merkmale
Genom: dsDNA linear
Baltimore: Gruppe 1
Symmetrie: helikal
Hülle: vorhanden
Wissenschaftlicher Name
Lipothrixviridae
Links
ICTVTaxon History: 201901529
NCBITaxonomy: 10477
ViralZone(Expasy,SIB): 143

Die VirusfamilieLipothrixviridae(gr. λἷπος: Fett, θρίξ: Haar) umfasst drei Gattungen vonBakteriophagenmit linearem, doppelsträngigemDNA-Genom(dsDNA). DieLipothrixviridaebesitzen ein sehr langes, helikalesKapsid,das von einer sehr eng anliegendenVirushülleumgeben ist.

SchemazeichnungAlphalipothrixvirus
Schemazeichnung eines AFV-3-Virions(Betal­ipothrix­virus) im Detail
SchemazeichnungBetalipothrixvirus
Schemazeichnung eines AFV-2-Virions(Delta­lipothrix­virus) im Detail
SchemazeichnungDelta­lipothrix­virus

DieViruspartikel(Virionen) derLipothrixviridaehaben je nach Virusart eine Dicke von 24 bis 38 nm im Durch­messer und eine Länge von 410 bis 2200 nm. DieLipothrixviridaebesitzen an ihren Enden komplexe, teil­weise halbmondförmige Proteinstrukturen. Die Gat­tungen dieser faden­förmigen (filamen­tösen) Viren werden schon mor­pho­logisch anhand ihrer Flexibilität bzw. Bieg­sam­keit unterschieden: wenig flexible (Beta­lipo­thrix­virus) oder sehr flexible Fila­men­te (ehem.Gamma­lipo­thrix­virus,jetztCapto­virusin der Fam.Ungula­viridae).

Das Genom innerhalb der Familie besteht aus einem einzigen DNA-Molekül mit Größen zwischen 15,9 und 56kBp.Die Enden des Genoms sind gegen­über einem Abbau durchExo­nukleasenäußerst stabil, was durch eine noch unbekannte chemische Modifikation verursacht wird.

Eine gewisse Verwandtschaft besitzt die FamilieLipothrixviridaezu denRudiviridae,die jedoch keine Hülle besitzen. Die Vertreter beider Virus­familien haben einen ähnlichen Genomaufbau, ein filamentöses Kapsid und infizieren extremthermophileArchaeender AbteilungCrenarchaeota.

Die Wirte derLipothrixviridaesind z. B.Sulfolobus islandicus;bei AFV-1 die extrem thermophilen ArchaeenAcidianus hospitalisundAcidianus infernus,die vorwiegend an vulkanischen Quellen undGeysirenzu finden sind.

Aufgrund erweiterter Sequenzanalysen kann ein gemeinsamer evolutionärer Ursprung der beiden FamilienRudiviridaeundLipothrixviridaeangenommen werden, weshalb sie seit 2012 zu einer neuen, gemeinsamen OrdnungLigamenviraleszusammengefasst sind.

Der ehemals größte Vertreter, das Thermoproteus-tenax-Virus 1 (en.Thermoproteus tenax virus 1,TTV-1, SpeziesBetatristromavirus TTV1), mit 38×2200 nm eine der größten bekannten Virusspezies überhaupt, wurde inzwischen jedoch der FamilieTristromaviridaezugeschlagen. Zwischen dieser Spezies (TTV-1) und den Betalipothrixviren bestehen keine Übereinstimmungen oder Ähnlichkeiten in der Genomsequenz, ihre Filamente sind nicht flexibel.

Die früher alsGammalipothrixvirusbezeichnete Gattung (mit Acidianus-filamentous-Virus 1, engl.Acidianus filamentous virus 1,AFV-1) wurde inzwischen mit neuem NamenCaptovirusin eine eigene FamilieUngulaviridaeausgelagert.

Systematik

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EM-Aufnahme von SIFV-Virionen(GattungBeta­lipothrix­virus). Balken 100nm.

Systematik nachICTVStand Mitte März 2021, ergänzt um einige Vorschläge in doppelten Anführungszeichen (wo nicht anders angegeben nach NCBI):[2]

  • FamilieLipothrixviridae
  • SpeziesAlphalipothrixvirus SBFV2(SBFV-2)
  • Subtyp Sulfolobales Beppu filamentous virus 2
  • SpeziesAlphalipothrixvirus SFV1(SFV-1)
  • Subtyp Sulfolobus filamentous virus 1
  • Subtyp Sulfolobales Beppu filamentous virus 1[4]
  • SpeziesAcidianus-filamentous-Virus 3(en.Acidianus filamentous virus 3,AFV-3)
  • SpeziesAcidianus-filamentous-Virus 6(en.Acidianus filamentous virus 6,AFV-6)
  • SpeziesAcidianus-filamentous-Virus 7(en.Acidianus filamentous virus 7,AFV-7)
  • SpeziesAcidianus-filamentous-Virus 8(en.Acidianus filamentous virus 8,AFV-8)
  • SpeziesAcidianus-filamentous-Virus 9(en.Acidianus filamentous virus 9,AFV-9)
  • SpeziesSulfolobus-islandicus-filamentous-Virus(en.Sulfolobus islandicus filamentous virus,SIFV)
  • Spezies „Desulfurolobus-ambivalens-filamentous-Virus“(en. „Desulfurolobus ambivalens filamentous Virus“,DAFV)[6][7]
  • Spezies „Thermoproteus-Tenax-Virus 2“(en. „Thermoproteus Tenax Virus 2“,TTV-2)[6][7]
  • Spezies „Thermoproteus-Tenax-Virus 3“(en. „Thermoproteus Tenax Virus 3“,TTV-3)[6][7]
EM-Aufnahme eines AFV-2-Virions(GattungDelta­lipothrix­virus). Balken 100nm.
  • SpeziesAcidianus-filamentous-Virus 2(en.Acidianus filamentous virus 2,AFV-2)
  • SpeziesDeltalipothrixvirus SBFV3
  • Subtyp Sulfolobales Beppu filamentous virus 3

Literatur

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  • C. M. Fauquet, M. A. Mayoet al.:Eighth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses,London, San Diego, 2004
  • David M. Knipe,Peter M. Howleyet al.(Hrsg.):Fields´ Virology,4. Auflage, Philadelphia 2001
  • D. Prangishvili, T. Basta, R. A. Garrett:Crenarcheal Viruses: Morphotypes and Genomes.In: Brian W. J. Mahy und Marc H. van Regenmortel (Hrsg.):Encyclopedia of Virology,3. Auflage, San Diego 2008, Band 1, S. 587 ffISBN 978-0-12-373935-3
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Wikispecies:Lipothrixviridae– Artenverzeichnis

Einzelnachweise

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  1. ↑ICTV:ICTV Master Species List 2020.v1,New MSL including all taxa updates since the 2019 release, March 2021 (MSL #36)
  2. ↑ICTV:Master Species List (#33) vom Herbst 2018(MementodesOriginalsvom 14. März 2019 imInternet Archive)Info:Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäßAnleitungund entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/talk.ictvonline.org
  3. ↑SIB:Alphalipothrixvirus,auf: ViralZone
  4. ↑NCBI:Sulfolobales Beppu filamentous virus 1(species)
  5. ↑SIB:Betalipothrixvirus,auf: ViralZone
  6. ↑abcDavid Prangishvili:Taxonomic Proposal to the ICTV Executive Committee: Creating Species in an existing genus:Betalipothrixvirus,Vorschlag 2008.005B.U (mit EM-Aufnahmen und Genom)
  7. ↑abcICTV:dsDNA Viruses: Lipothrixviridae(MementodesOriginalsvom 23. Juli 2021 imInternet Archive)Info:Der Archivlink wurde automatisch eingesetzt und noch nicht geprüft. Bitte prüfe Original- und Archivlink gemäßAnleitungund entferne dann diesen Hinweis.@1@2Vorlage:Webachiv/IABot/talk.ictvonline.org,ICTV 9th Report (2011)
  8. ↑SIB:Deltalipothrixvirus,auf: ViralZone
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