Thymin

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Strukturformel
Strukturformel von Thymin
Allgemeines
Name Thymin
Andere Namen
  • 5-Methyluracil
  • 2,4-Dioxo-5-methylpyrimidin (IUPAC)
  • 5-Methyl-2,4(1H,3H)-pyrimidindion
  • THYMINE(INCI)[1]
Summenformel C5H6N2O2
Kurzbeschreibung

weißer, kristalliner Feststoff[2]

Externe Identifikatoren/Datenbanken
CAS-Nummer 65-71-4
EG-Nummer 200-616-1
ECHA-InfoCard 100.000.560
PubChem 1135
ChemSpider 1103
DrugBank DB03462
Wikidata Q171973
Eigenschaften
Molare Masse 126,04 g·mol−1
Aggregatzustand

fest

Dichte

1,46 g·cm−3[3]

Schmelzpunkt

316–317°C[2]

Löslichkeit

schwer löslich in kaltem Wasser, löslich in heißem Wasser und verdünntenAlkalihydroxid-Lösungen[4]

Sicherheitshinweise
GHS-Gefahrstoffkennzeichnung[2]
keine GHS-Piktogramme

H- und P-Sätze H:keine H-Sätze
P:keine P-Sätze[2]
Soweit möglich und gebräuchlich, werdenSI-Einheitenverwendet.
Wenn nicht anders vermerkt, gelten die angegebenen Daten beiStandardbedingungen(0 °C, 1000 hPa).

Thymin(T, Thy, 5-Methyluracil) ist eine der vierNukleinbasenin derDNA,zusammen mitAdenin,CytosinundGuanin.In derRNAsteht an seiner StelleUracil.Es ist eineheterocyclischeorganische Verbindungmit einemPyrimidingrundgerüst und dreiSubstituenten(Sauerstoffatomean den Positionen 2 und 4,Methylgruppean Position 5). DieNukleosidevon Thymin sind dasDesoxythymidinin der DNA und das selteneRibothymidinin der RNA (z. B. in dertRNA). In der Watson-Crick-Basenpaarungbildet es zweiWasserstoffbrückenmit Adenin.

Darstellung und Gewinnung

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Eine Isolierung kann aus Rinderhirnen oder Kabeljau-Rogen erfolgen.[5][6]

Eine synthetische Darstellung gelingt durch Cyclisierung von N-Ethoxycarbonyl-3-methoxy-2-methylacrylamid in wässriger Ammoniaklösung.[7]

Thyminsynthese

Eine weitere Synthese geht von3-Methyläpfelsäureaus, welche in rauchenderSchwefelsäuredecarboxyliertund mitHarnstoffkondensiert wird.[8]

Thyminsynthese aus 3-Methyläpfelsäure und Harnstoff

Physikalische Eigenschaften

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Thymin bildet glänzende, bitter schmeckende, nadelförmige oder prismenförmige Kristalle[9],die bei 335–337 °C unter Zersetzung schmelzen.[10]Die Verbindung löst sich gut in heißem Wasser, in Alkohol und Ether ist die Löslichkeit gering.[9]In alkalischen Medien löst es sich unter Salzbildung infolge einer Enolatbildung abgeleitet von der Enolform 5-Methyl-2,4-pyrimidindiol.[10]

Chemische Eigenschaften

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Prinzipiell kann Thymin in sechstautomerenStrukturen vorliegen. Die Lactamform (1) wird aber gegenüber den Enolformen bevorzugt.[11]

Tautomere des Thymins

Geschichte und biologische Bedeutung

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1893 berichtete der spätere NobelpreisträgerAlbrecht Kosselvon einer Entdeckung. Aus den Thymusdrüsen des Kalbes hatte er mit dem Assistenten Albert Neumann Nukleinsäure gewonnen und mit Schwefelsäure behandelt. Es bildete sich ein gut kristallisiertes Spaltprodukt, für das – abgeleitet von der Thymusdrüse – der Name Thymin vorgeschlagen wurde.[12][13]

Thymin kann Bestandteil der DNA oder verschiedenerNukleosideundNukleotidesein.

Über das N1-Atom des Ringes kann Thymin an das C1-Atom derDesoxyriboseN-glycosidischgebunden werden; man spricht dann von einemNukleosid,demDesoxythymidin.Bei der Bindung anRiboseentsteht das NukleosidRibothymidin.

Desoxythymidin,dT Ribothymidin,T

Über diePhosphorylierungdes Thymidins am C5-Atom der Ribose gelangt man zu den wichtigenNukleotidenDesoxythymidinmonophosphat(dTMP),Desoxythymidindiphosphat(dTDP) undDesoxythymidintriphosphat(dTTP).

Strukturformel von dTTP

Bestandteil der DNA

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In der DNA-Doppelhelixbildet Thymin über die 4-Oxogruppe und die N3–H-Gruppe zweiWasserstoffbrückenmit der zugehörigen Adenin-Base des komplementären Stranges aus.

Strukturformel eines A-T-Basenpaars

Vergleich von Thymin und Uracil

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In der DNA tritt Thymin an die Stelle vonUracil.Uracil kann relativ einfach durchDesaminierungundHydrolyseausCytosinentstehen, wodurch dann dieBasensequenzgeändert (mutiert) und die in der Nukleotidsequenzgenetisch codierteInformation womöglich verändert wird.

Desaminierung von Cytosin zu Uracil

Thymin hingegen unterscheidet sich vom Uracil durch eine zusätzliche Methylgruppe und kann so auch nicht ohne weiteres aus Cytosin entstehen. In der DNA vorhandenes Uracil kann somit als Mutation erkannt und durchBasenexzisionsreparaturgegen Cytosin ausgetauscht werden.

Bei Thymindimeren handelt es sich um eineDNA-Mutation,welche durchUV-Strahlunginduziert wird. Dabei verbinden sich zwei auf einemDNA-StrangnebeneinanderliegendeThymin-Basenüber eine[2+2]-Cycloadditionkovalent zu einem Dimer, das ein relativ stabilesCyclobutan-Derivat ist.[14]

Bildung eines Thymindimers[15]

Besonders anfällig für eine solche Mutation sind Hautzellen, die dem Sonnenlicht ausgesetzt sind. Aus diesem Grund werden Thymindimere als eine wesentliche Ursache für die Entstehung vonHautkrebsdiskutiert.[16]

Thymin dient als Ausgangsstoff für einigeArzneistoffewie z. B.Zidovudin,TelbivudinundClevudin.

Verwandte Verbindungen

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Uracil 3-Methyluracil
Commons:Thymin– Sammlung von Bildern, Videos und Audiodateien
  • Eintrag zuThyminein derHuman Metabolome Database (HMDB),abgerufen am 18. November 2013.
  1. Eintrag zuTHYMINEin derCosIng-Datenbankder EU-Kommission, abgerufen am 28. Dezember 2020.
  2. abcdDatenblattThyminbeiAlfa Aesar,abgerufen am 23. November 2013(Seite nicht mehr abrufbar).
  3. K. Ozeki, N. Sakabe, J. Tanaka: „The crystal structure of thymine “, in:Acta Cryst.,1969,B25,S. 1038 (doi:10.1107/S0567740869003505).
  4. Europäisches Arzneibuch 10.0.Deutscher Apotheker Verlag, 2020,ISBN 978-3-7692-7515-5,S.941.
  5. Shimizu:Biochem. Zeitschrift,1921,117,S. 262.
  6. König, Grossfeld:Biochem. Zeitschrift,1913,54,S. 371.
  7. G. Shaw, R. N. Warrener: „33. Purines, pyrimidines, and glyoxalines. Part VIII. New syntheses of uracils and thymines “, in:J. Chem. Soc.,1958,S. 157–161 (doi:10.1039/jr9580000157).
  8. H. W. Scherp: „Convenient Syntheses of Thymine and 5-Methylisocytosine “, in:J. Am. Chem. Soc.,1946,68,S. 912–913 (doi:10.1021/ja01209a510).
  9. abBrockhaus ABC Chemie,Verlag Harri Deutsch Frankfurt/Main und Zürich 1965.
  10. abEintrag zuThymin.In:Römpp Online.Georg Thieme Verlag, abgerufen am 9. Dezember 2014.
  11. S. Hauptmann, J. Gräfe, H. Remane:Lehrbuch der organischen Chemie,VEB Deutscher Verlag der Grundstoffindustrie, Leipzig 1980, S. 556.
  12. Kossel, A. und A. Neumann:Über das Thymin, ein Spaltungsproduct der Nucleinsäure.In:Berichte der Deutschen Chemischen Gesellschaft,Band 26, 1893, S. 2753
  13. Kossel, A. und A. Neumann:Darstellung und Spaltungsproducte der Nucleinsäure (Adenylsäure).Vortrag in:Berichte der Deutschen Chemischen Gesellschaft,Band 27, 1894, S. 2215.
  14. Durbeej, B.; Eriksson, L.A.:Reaction mechanism of thymine dimer formation in DNA induced by UV lightin J. Photochem. Photobiol. A: Chem. 152 (2002) 95–101,doi:10.1016/S1010-6030(02)00180-6.
  15. K. Peter C. Vollhardt,Neil E. Schore:Organische Chemie,4. Auflage, Wiley-VCH, Weinheim 2005,ISBN 3-527-31380-X,S. 181.
  16. Alberts,Bray, Johnson, Lewis:Lehrbuch der molekularen Zellbiologie,2. korrigierte Auflage, Wiley-VCH, Weinheim 2001,ISBN 3-527-30493-2.