InterPro
InterProes una plataforma con acceso abase de datosdefamilias,dominios y sitios funcionales deproteínasen donde las características identificables encontradas en proteínas conocidas pueden ser aplicadas a nuevas secuencias de proteínas.
Fue creada en 1999 tras la formación del InterPro Consortium entre el grupo deSwiss-Proten elInstituto Europeo de Bioinformáticay elInstituto Suizo de Bioinformáticay los miembros fundadores de las bases de datosPfam,PRINTS,PROSITEyProDom.Actualmente integra información de las bases de datos PROSITE, Pfam, PRINTS, ProDom, SMART, TIGRFAMs, PIRSF, SUPERFAMILY, GENE3D y PANTHER.
La base de datos está disponible para búsquedas por texto y basadas en secuencia a través de unservicio web,y para descargas porFTP anónimo.Incluye varios formatos de salida como tablas de texto, documentosXMLy gráficos para facilitar el análisis de sus resultados. Al igual que las otras bases de datos del Instituto Europeo deBioinformática,se encuentra endominio público.
Referencias
[editar]- Mulder NJ, Apweiler R, Attwood TK, Bairoch A, Bateman A, Binns D, Bradley P, Bork P, Bucher P, Cerutti L, Copley R, Courcelle E, Das U, Durbin R, Fleischmann W, Gough J, Haft D, Harte N, Hulo N, Kahn D, Kanapin A, Krestyaninova M, Lonsdale D, Lopez R, Letunic I, Madera M, Maslen J, McDowall J, Mitchell A, Nikolskaya AN, Orchard S, Pagni M, Ponting CP, Quevillon E, Selengut J, Sigrist CJ, Silventoinen V, Studholme DJ, Vaughan R, Wu CH (2005). «InterPro, progress and status in 2005».Nucleic Acids Res.33(Database issue): D201-5.PMID15608177.doi:10.1093/nar/gki106.
- Quevillon E, Silventoinen V, Pillai S, Harte N, Mulder N, Apweiler R, Lopez R (2005). «InterProScan: protein domains identifier».Nucleic Acids Res.33(Web Server issue): W116-20.PMID15980438.doi:10.1093/nar/gki442.
Enlaces externos
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Datos:Q3047275