Bakterid

Bakterid
Escherichia coliehk soolekepike, suurendatud 25 000 korda
Taksonoomia
Riik	Bakterid

Bakterid(vanakreeka keelesβακτήριονbaktērion'kepp, pulk, sau') on (koosarhedega) kõige väiksemad (mikroskoopilised)üherakulisedeeltuumsedorganismid, kes suudavad iseseisvalt paljuneda ja kasvada.

Bakterid moodustavad fülogeneetiliselt suureprokarüootsete mikroorganismidedomeeni. Nad on keskmiselt 1–5mikromeeterisuurused, kuigi olenevalt bakteri liigist võivad rakud olla ka väga erineva suurusega, näiteks bakterilThiomargarita namibiensison raku läbimõõt kuni 750 µm. Rakusisesel parasiitsel bakterilMycoplasma genitalium'il on see aga 0,2–0,3 µm. Nad on kujult üsna sarnased, tavaliselt kerakujulised või ka pulkjate või spiraalsete vormidega. Bakterid olid ühed esmastest Maal tekkinud eluvormidest. Nende elupaigad on väga mitmekesised. Baktereid leidub nii pinnases, vees, happelistes kuumavee allikates kui ka radioaktiivsetes jäätmetes.Neid võib leida ka sügavalt Maa koorest, loomade seedekulglatest, taimedest, mehitatud kosmosesõidukitestja veel paljudest teistest kohtadest.

Ühes grammis mullas leidub tüüpiliselt 40 miljonit bakterirakku ja ühes milliliitris vees keskmiselt miljon bakterit. Kogu Maal on ligikaudselt 5×10³⁰bakterit,ületades biomassilt kõiki taimi ja loomi kokku.Bakterid on väga olulisedaineringes,näiteks surnud orgaanilise ainelagundajatenajalämmastikusidujatena atmosfäärist (mügarbakterid) jm. Bakterid tagavad elu säilimise ka veealuste külma- ja kuumaveeallikate lõõride ümbrust asustavatele bioomidele, muundades sealset vees lahustunud vesiniksulfiidi ja metaani organismidele eluks vajalikeks toite- ja energiaallikateks.

Baktereid on leitud elamast ka ekstreemsetes keskkonnatingimustes. Näiteks 17. märtsil 2013 teatati avastusest, et maailmamere sügavaim koht,Mariaani süvik,põhimõtteliselt õitseb bakteriaalsest elust.Üks teine samalaadne teade on veel näiteks mikroobidest, keda leiti USA looderanniku lähedalt 2,5 km sügavuselt 580 meetrit allpool merepõhjast sealsetest ookeanipõhja kivimitest.

Enamik baktereid on seni veel teaduslikult kirjeldamata ja paljusid bakteriliike ei ole suudetud veel tehistingimustes (laboris) kasvatada.Näiteks leiti alles 2003. aastal liikGemmatimonas aurantiaca,mis oli niivõrd uudne, et andis alust täiesti uue bakterihõimkonnaGemmatimonadeteskirjeldamiseks.

Kui varem arvati, et inimeses leidub umbes kümme korda rohkem bakterirakke kui tal on enda keharakke, siis viimased uuringud on näidanud, et inimese organismis on bakterite ja keharakkude arv enam-vähem võrdne.Paljud nendest bakteritest leiduvad nahal ja seedetraktis.Suurem osa inimesega seotud bakteritest on inimesele kahjutud, teatud bakteritega võitleb immuunsüsteem ja teatud liiki bakterid on ka kasulikud. Kuid paljud bakteriliigid on kapatogeensed.Näiteks on bakteriaalset päritolu nakkushaigused nagukoolera,süüfilis,antraks,pidalitõbijamuhkkatk.Kõige tavalisemad surmaga lõppevad bakteriaalsed haigused on hingamisteede nakkused. Näitekstuberkuloositõttu sureb aastas 2 miljonit inimest, seda küll enamasti Saharast lõunasse jäävates Aafrika riikides.Arenenud maades kasutatakse bakteriaalsete nakkuste raviksantibiootikume(nii inimestel kui ka koduloomadel). Antibiootikumide kasutamine on põhjustanud haigustekitajate seas ka probleemseantibiootikumiresistentsetetüvede tekke.

Tööstuses on bakteritel tähtis roll reovee käitlemisel ja naftareostuse puhastamisel. Toidutööstuses juustude ja jogurtite tootmisel fermentatsiooni protsesside käigus. Veel kasutatakse baktereid kaevandussektoriskulla, pallaadiumi, vase ja muude metallide tootmisel, maagist väljapuhastamisel. Samuti leiavad bakterid kasutust veel biotehnoloogias, antibiootikumide ja muude kemikaalide tootmisel.

Kuigi algselt hõlmas termin "bakterid" kõiki prokarüoote, muutis 1990. aastatel tehtud avastus bakterite teaduslikku klassifikatsiooni ning prokarüootid, kes on arenenud välja iidsetest ühistest eellastest, jagati1975–1978kahte väga erinevasse organismide rühma, mida kutsutakse arhede domeeniks ja bakterite domeeniks. Algul peeti neid vaheastmeksrakutuumatapärisbakterite ja rakutuumaga päristuumsete organismide vahel. Hiljem näidati, et nad on eristunud väga varasel evolutsioonietapil, mistõttufülogeneetilise süstemaatikaseisukohalt lahutati bakterid arhedest.

Baktereid ja arhesid uurivat teadusharu nimetataksebakterioloogiaks,mis on üksmikrobioloogiaharu.

Bakterite evolutsioon

Bakterid moodustavad ühe kolmest eluslooduse domeenist (teised kaks onarhedjaeukarüoodid).

Praeguste bakterite eelkäijateks on ligikaudu 4 miljardit aastat tagasi tekkinud esmasteks Maa eluvormideks olnud üherakulised mikroorganismid. Umbes 3 miljardi aasta vältel pärast arvatavat elu tekkimise aega on elu Maal olnud mikroorganismide tasemel ning domineerivateks eluvormideks on olnud bakterid ja arhed.Kuigi iidseid baktereid on säilinud kafossiilidena(ntstromatoliidid), on nad morfoloogiliselt omavahel niivõrd sarnased, et fossiilsete andmete põhjal pole eriti võimalik koostada bakterite evolutsioonikäiku või dateerida mõne teatud bakteriliigi tekkeaega. Siiski on võimalik bakteritefülogeneesirekonstrueerida geenijärjestuste abil.

Hoolimata nimetusest "arhed" või "ürgid" on arhebakterid pärisbakteritest siiski evolutsiooniliselt nooremad, olles raku koostiselt ja ehituselt sarnasemad eukarüootsete rakkudega, ning välja arenenud varem olemasolevatest bakterite liinidest.
Lisaks bakterite domeeni arhede/eukarüootide domeenist lahkemisele on bakterid seotud ka ühe teise suure evolutsioonilise lahknemisega – eukarüootite domeeni lahknemisega arhedest.
Üsna tõenäoliselt on eukarüootide rakud tekkinud endosümbioosi käigus, kui eukarüootsete rakkude eellastesse (kes olid tõenäoliselt arhed) sisenesid iidsetest bakteritestendosümbiondid,ning kellest on tekkinud evolutsiooni käigus praeguseaja eukarüootsetes rakkudes leiduvad organellid, näiteksmitokondrid.Lisaks veel, mõned eukarüootsed rakud, kes juba sisaldasid mitokondreid, "neelasid" endasse katsüanobakteritetaolisi mikroorganisme, mis viis praegusaja vetikate ja maismaataimede rakkudes leiduvatekloroplastidetekkimiseni.

Klassifikatsioon ja määramine

Baktereid saab klassifitseerida rakustruktuuride, raku ainevahetuse või raku koostise (DNA,rasvhapped,pigmendid,antigeenid,kinoonid) erinevuste põhjal. Veel saab liigitada baktereid koloonia morfoloogia, kasvukiiruse ja söötmete alusel, millel nad kasvada eelistavad. Kuigi selliste tunnuste põhjal saab määrata ja klassifitseerida eri bakteritüvesid, on kindlam meetod võrrelda nende DNA/geenijärjestusi, mis pole mõjutatudhorisontaalsest geeni ülekandest(rRNA), või määrata ja võrrelda erinevate bakteritüvedeguaniinijatsütosiinisisaldust ning kasutada ka genoomide hübridiseerimist.

Üheks üldlevinud ja esmaseks meetodiks bakterite määratlemisel on ka Grami järgi värvimine. Selle põhjal saab bakterid jagada kahte suurde rühma –grampositiivseteksjagramnegatiivseteks.
Grampositiivsedbakterid värvuvadkristallvioletigatöötlemisel siniseks. Neil on pakspeptidoglükaankihtja värvi pole neist võimalik välja pesta (etanoolivõiatsetoonigalühiajaliselt loputades).
Gramnegatiivsetelbakteritel on õhem rakukest ja neist on võimalik värvi välja pesta. Teistkordsel värvimiselsafraniinigavärvuvad need bakterid punaseks.
Mõned bakterid võivad pärast Grami järgi värvimist olla kagramvarieeruvad– sama bakteriliigi rakud on ühtlasi nii roosad kui ka lillakad. Näiteks perekondadeActinomyces,Arthobacter,Corynebacterium,MycobacteriumjaPropionibacteriumrakud on jagunemise ajal väga õrnad ja võivad kergesti puruneda, mistõttu need grampositiivsed bakterid võivad paista gramnegatiivsetena. Samuti perekondadeBacillus,ButyrivibriojaClostridiumpeptidoglükaanse kihi paksus rakkudes väheneb rakkude vanuse tõustes, mille tulemusena vanemad rakud võivad värvuda gramnegatiivseteks. Üldiselt on kõikide bakterite puhul nii, et mida vanemad on rakud, seda rohkem võib esineda gramvarieeruvust.

Hõimkonnad

Bakterihõimkonnad ja nende lühiiseloomustused:

• Eobacteria
  • Chlorobacteria
    • Chloroflexi(rohelised, hõimkonnas poleväävlibaktereid). Väike hõimkondbakterklorofüllisisaldavaid anoksügeenseid fotosünteesijaid, ehk nad ei tooda fotosünteesil hapnikku. Samuti erineb nende süsiniku kasutamise viis teiste fotosünteesivate bakterite omast. Nad on tüüpiliselt filamentselt kasvavadfakultatiivsed anaeroobid.
    • Thermomicrobia.Väike hõimkond termofiilseid fotosünteesivaid baktereid.
  • Hadobacteria
    • Deinococcus-Thermus.Väike grupp väga vastupidavaid kemo-organotroofseid ekstremofiile. Mõni liik sellest hõimkonnast talub väga kõrgeid temperatuure, mõni aga madalaid. On ka liike, kes taluvad edukalt suurt radioaktiivset kiirgust ja toksilisi ühendeid.
• Glycobacteria
  • Cyanobacteria(sinivetikad). Fotosünteesivatest bakteritest kõige olulisem grupp. Nad onklorofüllisisaldavad oksügeensed fotosünteesijad (toodavad hapnikku). Üherakulised või filamentsed bakterid.
  • Gracilicutes
    • Spirochaetes.Kujult tavaliselt piklikud ja spiraalsed, kruvijalt liikuvad kemoheterotroofsed bakterid. Paljud liigid imetajatel haigustekitajateks.
    • Chlorobi(rohelised väävlibakterid). On väike hõimkondobligaatanaeroobeja bakterklorofülli sisaldavaid fototroofseid baktereid. Nad on ühtlasi ka termofiilsed ja elavad kuumaveeallikates.
    • Bacteroidetes.Suur bakterihõimkond laia ja mitmekesise asurkonnaga. Neid leidub nii pinnases, setetes, merevees kui ka loomade seedekulglas. Heterogeenne grupp, kuhu kuuluvad nii obligaatsed aeroobid kui ka obligaatsed anaeroobid,kommensalistid,parasiididja ka vabalt elavad vormid.
    • Fibrobacteres.Väike hõimkond, kuhu kuuluvad paljud kõhus,vatsas(rumen)tselluloosilagundada aitavad bakterid.
    • Proteobacteria(lillad bakterid ja nende sugulased). See on suuruselt teine ja väga mitmekesine bakterihõimkond. Peaaegu kõik neist on heterotroofsed ja paljud ka haigusetekitajad, kuid mitmed taimede juurtes elavad liigid on taimedele ka kasulikud, aidates neil fikseerida lämmastikku. Lillad bakterid sisaldavad bakterklorofülli.
    • Aquificae.Väike grupp baktereid, kuhu kuulub niikemolitotroofseid,termofiilseid kui ka hüpertermofiilseid liike. Neid leidub kuumaveeallikates, väävlileiukohtades ja hüdrotermilistes piirkondades ookeanis.
    • Deferribacteraceae.Väike grupp anaeroobseid vesikeskkonnas elavaid baktereid.
    • ChrysiogenetesHõimkonda kuulub ainult üks liik kemolitotroofseid baktereid. Nad on unikaalsed sellepoolest, et "hingavad" hapniku asemel hoopisarseeni.
    • Acidobacteria.Väike hõimkond pinnases elavaid happelembeseid ehk atsidofiilseid baktereid. Siia kuuluvad ka bakterirodopsiini sisaldavad fototroofsed bakterid.
    • Planctomycetes.Bakterid, kes elavad mage-, riim- ja merevees. Elutsüklis vahelduvad rakkude sessiilsed (püsipaiksed) ja liikuvad, viburitega vormid. Paljunevad pungumise teel.
    • Chlamydiae.Väike grupp eukarüootide intratsellulaarseid obligaatseid parasiite.
    • Lentisphaerae.Hiljuti on anaeroobsetest elupaikadest, nii merest kui ka maismaalt, avastatud väike bakterigrupp.
    • Verrucomicrobia.Bakterihõimkond, kelle hulka kuuluvad maismaal ja vees elavad liigid. Mõned liigid leiduvad ka eukarüootsetel peremeesorganismidel.
  • Eurybacteria
    • Fusobacteria.Koosneb ainult ühest perekonnast heterotroofsetest anaeroobsetest bakteritest, kes võivad ka olla haigustekitajateks inimesel. Nad on ühtedeks peamisteks bakteriliikideks seedekulgla mikrobioomis.
    • Thermotogae.Hõimkond, kuhu kuuluvad hüpertermofiilsed, obligaatsed anaeroobid ja heterotroofsed fermenteerijad bakterid.
• Posibacteria
  • Endobacteria
    • Dictyoglomi.Hõimkonnas ainult üks liik hüpertermofiilseid, kemo-organotroofseid ja aeroobseid baktereid.
    • Firmicutes.On kõige suurem bakterigrupp, kuhu kuuluvad grampositiivsed väikse GC sisaldusega bakterid. Neid leidub väga mitmekesistes kohtades ja mõned neist on ka patogeensed. Üks perekond,Heliobacteria,saab oma energia fotosünteesilt.
  • Actinobacteria.Suur bakterihõimkond, kuhu kuuluvad grampositiivsed suure GC sisaldusega bakterid. On tavalised pinnases, samuti leidub neid taimedes ja loomades. Mõned on ka patogeensed.

Vanim elusolend

Varem on peetud vanimaks elusolendiks 25–40 miljoni aasta vanust bakterit, kes leitimerevaigusolnudmesilasest.
Kuid on avastatud veelgi vanem, nimelt 250 miljoni aastane bakter, kes leitisoolakristallidest,mis pärinevad 610 meetri sügavuseltNew Mexicosoolakaevandusest.

Rühmal teadlastel õnnestus kasvatada baktereidendospooridest,mis eraldati 250 miljoni aasta vanusest soolakristallist. Senitundmatu liik (praegu kasutatakse selle tähistamiseks numbrikombinatsiooni 2-9-3) kuulub ilmselt perekondaBatsillja teda peetakse vanimaks teadaolevaks organismiks.

Osa teadlasi väidab, et see bakter pole tegelikult nii vana.

Kasvukeskkond

Bakterid erinevad üksteisest eeskätt elukeskkonna, aga ka väliskuju poolest.

Baktereid elabmullas,veesjaõhus,kõikides elusloomades ja taimedes ning surnud organismide jäänustes. 1 gramm mulda sisaldab kuni miljard bakterit, ühes piimatilgas võib neid olla sadu tuhandeid.

Baktereid leidub kõikjal, nad on biokeemiliselt väga aktiivsed ja täidavad looduse aineringes ülitähtsat osa. Loomade seedekulglas võtavad bakterid osaseedimisest,peremeesorganismtarvitab mõningaid bakterite elutegevuses tekkinudvitamiine.Taimedejuurtelelavad bakterid aitavad taimedel toituda.

Bakterite elutegevust mõjutavad temperatuur, soolsus,pH,kiirgus ja muud tegurid. Enamik baktereid eelistab mõõdukat temperatuuri ja soolasust ning neutraalset pH-d. Kiirgus mõjub paljunemisele negatiivselt. Ekstremofiilid on bakterid, kes taluvad hästi äärmuslikke keskkonnatingimusi, neid on palju ka arhede hulgas.

Bakteri mikrokeskkond on organismi lähiümbrus. Bakteritele meeldib kasvada kinnitatuna tahkele pinnale, sest sinna absorbeeruvad toitained ja see soodustab bakterite kasvamist. Seal moodustubbiokile:õhuke kiht, mis koosneb bakteritest. Bakterite kleepumisel tahkele pinnale osalevad piilid ja kapsel. Biokile on näiteks hambakatt.

Bakterid on erakordselt vastupidavad. Nad võivad elutseda praktiliselt igasuguses keskkonnas, alateskuumaveeallikatestkuniarktilisepakaseni.

Paljud bakterid võivad moodustada endospoore. Need on tillukesedkapslid,milles bakter võib eluvõime säilitada aastate kestel, taludes hästi nii kuivamist, suurt kuumust kui kadesinfektsioonivahendeid.

Vaid vähesed tõvestavatest bakteritest moodustavad endospoore.

Suurus, kuju ja ehitus

A.batsill(bacillus) – pulkjad, ka niitjad
B. kokk (coccus) – kerakujulised
C. kerakujulised – parv
D. kerakujulised – paaris
E.spirill(spirillum) – nõrgalt keerdunud
F.vibrioon(vibrio) – komajad

• Vibrioonid, spirillid ja spiroheedid kokku on kruvibakterid
• spiroheet (spirochaetum) – tugevalt keerdunud (keeritsbakterid)

Bakterid on eeltuumsed (prokarüootsed) organismid, sest neil puudub rakutuum.

Bakterid on värvusetud, sinised või punakad, erikujulised, üksikud või ahelatena.

Bakterite keskmine pikkus on mõni mikromeeter (erandlikult kuni 100 μm = 0,1 mm). Bakterirakk on ehituselt lihtsam eukarüootsest rakust, ega sisalda viimasele omaseid membraanseid organelle.

Kuigi bakterirakud on keerukama ehitusega kui viirused, on nad siiski väga lihtsad. Nende ehitus on kindlaks tehtud enam kui tuhandekordse suurendusegaoptilistemikroskoopideja saja tuhande kordse suurendusegaelektronmikroskoopideabil. Kõiki bakterirakke ümbritseb tiherakukest,mistõttu toit saab rakku siseneda ainult lahustunud kujul. Rakukesta ehituse järgi jaotatakse bakterid spetsiaalse värvimise aluselgramnegatiivseteksjagrampositiivseteks.Gramnegatiivsete bakterite ehitus on keerukam kui grampositiivsetel.

Mõnedel bakteritel ümbritseb rakukesta kaitsevlimakestehk kapsel. Sageli on neil üks või mituviburit,mida kasutatakse kulgemiseks. Bakterid liiguvad viburite, lima või looklemise abil.

Kuna bakteritel pole rakutuuma, asendab seda tuumapiirkond, milles paiknebrõngasjaskromosoom.See koosneb ühestDNAmolekulist,millel vabu otsi ei ole. Bakterite DNA koosneb samasugustestnukleotiididestnagutaimedejaloomaderakkudes olev DNA.Päristuumsetelorganismidelon eriliikidelerinevarvkromosoome – see on üks liigi tunnus. Kõigil bakteritel on aga ainult üks kromosoom, millegeenidearv ulatub umbes kuue tuhandeni. Enne bakteri jagunemist rõngaskromosoom kahekordistub – paljunemise järgselt jääb kummassegi tütarrakku endiselt üks kromosoom.

Lisaks rõngaskromosoomile on bakteritsütoplasmasväiksemad DNA rõngad, mida nimetatakseplasmiidideks.Viimastel on põhiliseltainevahetusliktähtsus. Plasmiidid sisaldavad geene, mis on vajalikud bakterikasvukeskkonnaeripärast tulenevateensüümidesünteesiks. Need aitavad lagundada ümbritsevas keskkonnas leiduvaidorgaanilisi aineid.See on vajalik bakteri toitumiseks, aga tihti ka elutegevusele kahjulike ainetelagundamiseksvõi nende toime vältimiseks. Nii näiteks sisaldavad plasmiidid geene, mille põhjal sünteesitud valgud võimaldavad bakteritel eladaantibiootikumidekeskkonnas. Ühes rakus sisalduvate plasmiidide koguarv ja neis asuvate geenide arv ei ole püsiva suurusega. Geenid võivad liikuda rõngaskromosoomist plasmiididesse ja sealt tagasi. Kasutud plasmiidid lagundatakse vastavate ensüümide poolt. Selle tulemusel muutub nii plasmiidide kui ka neis olevate geenide arv.

Prokarüootse, eeltuumse raku sisemuses puuduvad membraanidega ümbritsetud rakuorganellid. Puuduvad tsütoplasmavõrgustik,Golgi kompleks,mitokondrid,tsentrosoomjatsütoskelett.Eukarüootiga samasugusel viisil toimub bakterites valgusünteesribosoomides.Aga bakterite ribosoomid erinevad nii suuruselt kui ka koostiselt eukarüootide omadest. Ribosoomid on kõikides bakterites ja nende arv ühes rakus võib ulatuda tuhandeni. Mõnedes vees elavates bakterites on ka gaasivakuoolid, valgulise membraaniga põiekesed, mis aitavad neil organismidel veekogu pinnale tõusta või selle sügavustesse sukelduda. Mõned bakterid moodustavad ebasoodsate tingimuste üleelamiseksendospoore.

Bakterite liikumine ja viburid

Paljudel bakteritel on üks või mitu viburit. Tavaliselt puuduvad viburid patogeensetel bakteritel.

Bakterite viburite läbimõõt on 20–30 nanomeetrit, pikkus keskmiselt 10 mikromeetrit. Viburid koosnevad erilisest valgust –flagelliinist.Bakteri viburite arv ja paiknemine on väga erinev: eristatakse monotrihhe, monopolaarseid polütrihhe, bipolaarseid polütrihhe ja peritrihhe.

Bakterid võivad liikuda viburitega vedelas, tahkel pinnal (voogamineehkswarming), lima abil, vees üles-alla (gaasivakuloolide abil) või looklemisega. Ehkki üldjuhul on bakteritepiilideülesandeksadhesioon,saavad nad tüüp IV piilide abil liikuda – seda nimetatakse katwitching’iks ehkpiiltõmbumiseks.

Paljunemine

Bakteriraku pooldumine. Esmalt kordistub kromosoom, seejärel pooldub rakk.

Bakterid paljunevad põhiliseltpooldumisega,esineb aga teisigi mooduseid.

Sobivatemperatuurijuures, milleks on enamasti umbes 37 °C, võib pooldumine toimuda iga 20 minuti järel. Teoreetiliselt võib ühest bakterist 24 tunni jooksul tekkida ligikaudu 140 000 000 000 000 bakterit (140 triljonit). Praktikas seda juhtuda ei saa, sest õige pea lõpeksidtoiduvarudja koguneksid mürgisedjääkained,nii et aja möödudes bakterite paljunemine pidurdub.

Kuigi enamik baktereid paljuneb pooldumise teel, on mõnel liigil täheldatud ka omapärast sugulist paljunemist, kusjuures ühe bakteriraku sisu voolab teise rakku. Mitmed tsüanobakterid paljunevadhormogoonideabil, mõnel tsüanobakteril on täheldatud ka paljunemisrakkude ehkgoniidideabil paljunemist, kusjuures alati on neil säilinud ka paljunemine hormogoonide abil.

Mõnel bakterirühmal (ntHyphomicrobium) esinebpungumine.Kuni1999,mil leitiThiomargarita namibiensis,maailma suurimaks bakteriks peetudEpulopiscium fishelsoni’l arenevad tütarrakud emasorganismi sees ja hiljem väljuvad emabakteri piludest. Põhimõtteliselt on tegu sünnitajabakteriga.

Toitumine ja ainevahetustüübid

Bakterid koosnevad 75–85% ulatuses veest ning samadestsüsivesikutest,lipiididest,amino- janukleiinhapetestnagu kõik eukarüoodidki. Kõigis elusolendites toimuvad põhimõtteliselt sarnased biokeemilised ainevahetusereaktsioonid (metabolism).

Toitumine on bakteritel mitmekesisem kuieukarüootidel.Energiaallikatenakasutavad bakteridvalgusenergiatjakeemilist energiat.

Bakterid omastavad väliskeskkonnast vees lahustunud toitaineid kogu raku pinnaga (osmoosselt) ja eritavad rakust välja ainevahetuse jääkprodukte. Bakterid vajavad toitaineid ka selleks, et hankidabiosünteesireaktsioonideksvajaminevat energiat. Täiendavalt kulutab bakter energiat ka liikumiseks ja ainete rakku transportimiseks. Energia salvestatakse rakusATP-na.

Bakteritetoitumistüüpeiseloomustatakse põhiliselt selle järgi, mida nad kasutavadenergiajasüsinikuallikana. ATP sünteesil võib energiaallikaks ollapäikeseenergiaehk valgusenergia või keemiline energia.Süsinikuallikaksvõivad olla kas mitmesugused orgaanilised ained võiCO₂.Samuti on toitumistüüpide jaoks oluline energiat edasikandva elektroni päritolu: see saadakse kas anorgaanilisest ainest (nt veest) või orgaanilisest ainest.

Süsinikuallikad

Vastavalt süsinikuallikale (metaboolsete protsesside järgi) jagatakse bakteridheterotroofideksjaautotroofideks.

Heterotroofidesüsiniku allikaks on orgaanilised ühendid. Sealjuures heterotroofsetest bakteritest enamik saab energiat orgaaniliste ühendite (oksüdatsioonist) (neid nimetatakse siiskemoheterotroofideks). Kemoheterotroofid kasvavad hästi näiteks aminohappeid ja suhkruid sisaldavatel söötmetel. Samuti suudavad nad lagundadanaftat,taimekaitsevahendeidjatselluloosi.Enamik baktereid on heterotroofid.

Autotroofidesüsiniku allikas on süsihappegaas (CO₂). Autotroofideks on bakterite hulgas näiteks rohe-, purpur- jatsüanobakterid.

On leitud ka metanogeenseid ehkmetaanisttoituvaid baktereid. Näiteks2007.aastal avastasidUus-Meremaateadlased uue bakteriliigi, mis elutseb maapinnas 30 cm sügavusel, kus temperatuur on üle 60 °C, koht asub geotermaalse piirkonna Hells Gatesi lähedal Rotorua asulas. Bakteritele anti ladinakeelne nimiMethylokorus infernorum.

Kasutatavad energiaallikad

Välise energiaallika järgi jaotatakse bakteridfototroofideksjakemotroofideks.

Fototroofidkasutavadvalgusenergiat(päikeseenergiat).

Kemotroofidsaavad energiatkeemilise substraadi oksüdeerimisel.

Huvitav rühm bakterimaailmas on autotroofsed kemosünteesijad bakterid ehkkemolitotroofid.Nad saavad energiat anorgaaniliste ühendite oksüdatsioonist ja kasutavad süsinikuallikana süsihappegaasi (väävlibakterid,vesinikubakterid,rauabakterid).

Väävlibakterid elavadkuumaveeallikates,mudasjaseisvates veekogudesning toituvad vees leiduvastväävlist.Väävlibakteritele iseloomulikmädamunalõhntuleneb nende toodetavastväävelvesinikust.

Põllumajanduseson suur tähtsuslämmastikku siduvatelbakteritel, eriti neil, kes muudavadõhulämmastikunitraatideks.Mõni sellistest bakteritest, näiteksRhizobium,elutsebhernejaristikujuurtes.

Kasutatavad elektronidoonorid

Raku energeetilises metabolismis kasutatava elektroni päritolu järgi jaotatakse bakteridlitotroofideksjaorganotroofideks.

Litotroofidkasutavad elektroni andjana anorgaanilisi ühendeid.

Organotroofidkasutavad elektroni andjana orgaanilisi ühendeid.

Orgaanilisest ainest toitumine

Prokarüoodidjaotatakseaeroobideksjaanaeroobideks.Obligatoorsed aeroobidkasutavad hapnikku rakuhingamisel ega saa hapnikuta elada.Fakultatiivsed anaeroobidkasutavad hapniku olemasolul seda rakuhingamisel.

Kui keskkonnas puudub hapnik, toimubkäärimine.Obligatoorsetele anaeroobidele on hapnik mürk. Mõned obligatoorsed anaeroobid on kääritajad, teised liigid saavad energiat anaeroobse hingamisega, mille korral on elektronide lõppaktseptoriks hingamisel hapniku asemel mõni muu anorgaaniline molekul.

Aeroobidvalmistavad orgaanilist ainet ehk bakterid sünteesivad vajalikke toitaineid ise, kasutades selleksklorofülli,nagu seda teevad ka rohelised taimed.

Anaeroobidtoituvad valmis orgaanilisest ainest.

Elukeskkond

Osa baktereid elabparasiitidenataimedesjaloomades,põhjustades mitmesuguseidhaigusi.Neid nimetataksepatogeenseteksehk tõvestavateks bakteriteks.

Paljud bakterid elavadsaprobiontidena,mis tähendab seda, et nad toituvad surnud orgaanilisest ainest.

Bakterid täidavad kõigi elusolendite seisukohalt elulise tähtsusega ülesannet: nad teevad võimalikukshapniku,süsinikdioksiidijalämmastikuühenditevarude korduva kasutamise. Kui bakterid ei põhjustaks surnud organismide kõdunemist, ei jätkuks mullas taimedele enam õige varsti toitu, ilma taimedeta aga ei saaks elada loomad.

Normaalne mikrofloora

Nii taimede, loomade kui kainimestegaelab alati koos palju eri liiki baktereid, mis moodustavad nimetatud organismidenormaalse mikroflooraehk mikrobiotsönoosi ehk mikrobioota.

Etorganismidonavatud süsteemid,satub neisse pidevalt uusi mikroobe, kuid nad kõik ei jää püsima. Vastavalt juurdumisele eristatakse

• organismi residentmikroflooratehk indigeenset ehk sümbiontset floorat (siia kuuluvad kõik mikroobid, mis on keskkonnas juurdunud) ja
• transiit- ehk passaažmikrofloora (siia kuuluvad mikroobid, mis jäävad keskkonda lühikeseks ajaks, seejärel kas hukkuvad või tõrjutakse organismist välja).

Inimestega koos elavaid baktereid on kõige enamjämesooles,kuid neid leidub ka mujal. Normaalne mikrofloora on enamasti kahjutu ja selle koostis sõltub paljudest faktoritest. Normaalne mikrofloora kaitseb organismihaigusetekitajateeest, takistades organismile kahjulike bakterite kinnitumistkudedele,stimuleeridesantikehadeteket.

Patogeensed bakterid ja toksiinid

Bakterid, mis inimese organismi tungides põhjustavad haigusi, nimetatakse patogeenseteks. Enamik neist moodustavad mürkaineid ehktoksiine,mis kutsuvad esilekoekahjustusi.Toksiinid on reeglina valgulised.

Selleks, et oleks lihtsam haigestumist vältida, peab teadma, kuidas haigusetekitajad bakterid levivad.

Haigused ja vaktsiinid

Bakteriaalsed haigusedon enamastinakkushaigused.Mikroobide põhimassi moodustavadsaprofüüdidehk roisklased, mis etendavad meie elus väga tähtsat osa (käärimisprotsessid,lämmastiku ringkäik looduses,roiskumisprotsessidjne.). Nakkushaiguse väljakujunemiseks peab haigusetekitaja sattuma vastuvõtlikku organismi. Selle teed on erinevad, näitekssoolenakkustekorralsuukaudu.

Alati ei põhjusta haigusetekitaja sattumine organismi haigestumist. Haigestumiseks on vaja hulka haigustekitajaid. Organismis puhkeb võitlus haigustekitajaga. Kui võidab organism, siis haigestumist ei järgne, kui võidab aga haigustekitaja, on tagajärjeks kindla kliinilise kuluga haigestumine, ent võitlus tekitajaga käib ka haiguse vältel.

Bakteriaalsed haigused on näiteksiseeneslik abort,klamüüdia,klamüdidoos,gonorröa,toksoplasmoos,teetanus,salmonelloos,botulism,kõhutüüfus,tüüfus,difteeria,düsenteeria,koolera,kopsutuberkuloos,tuberkuloos,leepra ehkpidalitõbi,baktertoidumürgistus,läkaköha,leginelloos,listerioos,meningiit,katk(muhk-, kopsu-, nahakatk jms) või bioloogilise relvana kasutust leidnudSiberi katk.Ohtlikeks patogeenideks on veelleegionäride haigustpõhjustav bakter (Legionella pneumophila) jalihasööjabakter(Streptococcus pyogenes).

Toiduga ülekanduvatest bakteriaalsetest nakkustest on Euroopa Liidus kõige enam levinudkampülobakterioos,millele järgnebsalmonelloos.

Erinevalt viirushaigustest saab bakterihaigusi ravidaantibiootikumidega,abi on ka vaktsineerimisest. Antibiootikume on suur hulk. Paljud antibiootikumid on suunatud põhiliselt bakteri rakus toimuvate valgusünteesi komponentide pärssimisele, aga on ka teistsuguse toimemehhanismiga antibiootikume, mõned neist blokeerivad bakterite genoomi replikatsiooni jm. Bakterid eritavad ka ise antibiootikume, mida saab kasutada bakterhaiguste puhul.

Bakterite toodetud mürgised jääkained, mida sisaldavad riknenud toiduained, võivad põhjustadaseedehäireid.

Toit, vajalikkus inimesele

Inimene kasutas baktereidvõijajuustuvalmistamisel juba ammu enne seda, kui ta midagi teadis selliste organismide olemasolust. Bakterite abil toodetakse enamik hapendatud piimasaadusi, näitekshapupiima,keefirijajogurtit,samutialkoholi,antibiootikume,veiniäädikatja muid orgaanilisi ühendeid.

Ka roiskumine, sealhulgas toiduainete riknemine, on bakterite tegevuse tagajärg.

Inimene kasutab baktereid veelnaha parkimisel,linaleotamiseljareovete puhastamisel.Bakterid aitavad jõgedel ja järvedel puhtana säilida.

Piimapastöörimiselkuumutatakse seda temperatuurini, mis on piisav kõikide bakterirakkude hävitamiseks, ellu jäävad ainult endospoorid. Et piimas leiduvad tõvestavad pisikud spoore ei moodusta, on pastööritud piima joomine ohutu. Küll aga võivad ellujäänud spooridest kasvavad kahjutud bakterid piima hapendada.

Baktereid kasutatakse

• antibiootikumide tootmisel (aktinomütseedid,tetratsükliin)
• vitamiinidetootmisel (propioonbakteriteabil toodetakseB12-vitamiini)
• aminohapetetootmisel (lõhna- jamaitsetugevdajad,toidulisandid)
• toidupaksendajate tootmisel (kreemid,majonees,sulatatud juust)
• ensüümidetootmisel (pesupulber)
• orgaaniliste hapete jaetanoolitootmisel (äädikhape,piiritus)
• mügarbaktereidkasutataksebakterväetisena
• heitvetepuhastamisel

Pärisbakterid

Litotroofsed bakterid

• Väävlibakterid
• Rauabakterid
• Mangaanibakterid,antimonibakterid
• Vesinikubakterid
• Nitrifitseerivad bakterid

Fotosünteesivad bakterid

• Fotosünteesivad väävlibakterid
• Tsüanobakterid

Vaata ka

• arhed
• bakteriaalsed kopsuinfektsioonid
• bakterite loend
• biotehnoloogia
• Bergey süsteem
• GASP fenotüüp
• protistid
• viirused

Välislingid

Üldist

• Bakterid
• Bakterite geneetika
• Bakterite tähtsus
• Viirused ja bakterid
• Putukad ja bakterid

Meedias

• "Loomariigist sai uues evolutsioonipuus bakterite hale vari"ERR Novaator, 15. aprill 2016

Teaduses

• Burton Tabaac, Geoffrey Goldberg, Lia Alvarez, Molly Amin, Kathleen Shupe-Ricksecker, Fernando Gomez (2013).Bacteria detected on surfaces of formalin fixed anatomy cadavers,Italian Journal of Anatomy and Embryology, 118. väljaanne, nr 1: 1–5