Paire de bases
Unepaire de bases(pb) est l'appariement de deuxbases nucléiquessituées sur deux brins complémentaires d'ADNouARN.Cet appariement est effectué par desponts hydrogène.Il y a quatre types debases nucléiques:adénine(A),thymine(T),cytosine(C) etguanine(G). Pour former une paire de bases, l'adénine s'apparie avec la thymine, et la cytosine s'apparie avec la guanine.
Unités de mesure
modifierLa longueur des molécules d'ADN ou d'ARNbicaténairesest comptée en paires de bases. Cette unité est notéebp(en anglaisbase pairs). Voir les liens suivants:
La longueur des ADN et ARNsimple brinest plutôt comptée ennucléotidesqu'en paires de bases. Cette unité est notéent.
Liaisons hydrogène, liaisons entre les bases
modifierLes liaisons hydrogène sont le mécanisme chimique qui régit la complémentarité des bases. Cette correspondance est unique grâce à la géométrie des atomes donneurs d'hydrogène et les accepteurs qui forment les bases.
Dans l'ADN, on observe des paires dites canoniques, ou encore, paires Watson-Crick: l'adénine(symbolisé A) s'apparie avec lathymine(T) grâce à deuxponts hydrogénés,et laguanine(G) s'apparie avec lacytosine(C) par trois ponts hydrogène. Dans l'ARN, la thymine est remplacée par l'uracile(U).
Au cours de laréplication de l'ADN,il peut arriver que l'ADN polymérasefasse des erreurs en recopiant le brin d'ADN matrice. Dans ce cas, la paire de bases normale ne peut se former et la double hélice contient un défaut, appelémésappariement(mismatch).
On peut également trouver dans l'ARN des paires de bases non canoniques, ou non Watson-Crick. Dans ce cas là, les bases peuvent s'associer entre elles, en fonction des atomes accepteurs d'un côté et donneurs de liaison hydrogène de l'autre. On observe en particulier ce type d'appariements, appeléspaires wobbledans l'interaction entreARNtetARNm.
Le nombre de liaisons faibles (2 ou 3) détermine la solidité du lien entre les deux brins d'ADN. Par conséquent, les sites d'ouverture de l'ADN lors de la transcription sont généralement des séquences consensus riches en A-T, comme laboîte TATAeucaryote ou encore laPribnow boxprocaryote.
Dimensions de la molécule
modifierLa molécule en double hélice de l'ADN (sous sa forme « B », la structure la plus courante) a un diamètre de 2nmet un pas de 3,4nm.Sachant qu'il y a dix paires de bases par pas, on peut considérer (même si c'est une approximation discutable sur le plan mathématique) que deux paires sont distantes de 0,34nm.
