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Amoebozoa

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Amoebozoa
Description de cette image, également commentée ci-après
Arcellasp.
Classification
Sous-domaine Unikonta

Embranchement

Amoebozoa
Lühe,1913emend.Cavalier-Smith,1998[1]

Synonymes

Taxons de rang inférieur

Position phylogénétique


Lesamibozoaires(Amoebozoa) (du grecamoibēsignifiant «transformation») constituent un grand groupe deprotozoairessimples,la majorité se déplaçant par vaguescytoplasmiquesinternes[pas clair].À ne pas confondre avec lesamiboïdes(également nommésrhizopodes), qui sont un sous-groupe des amibes, avec environ 500 espèces d'organismes vivants unicellulaires hétérotrophes.

Leurpseudopodeest appelélobopode.Ils peuvent plus rarement être équipés deflagellespour assurer leur mobilité. La plupart sont unicellulaires, et sont souvent rencontrés dans les sols et les milieux aquatiques, où ils cohabitent avec d'autres organismes. Plusieurs sontpathogènes.Les Amoebozoa peuvent aussi être multicellulaires et peuvent produire des spores, généralement visibles à l'œil nu.

La taille des Amoebozoa varie beaucoup. Beaucoup font seulement 10 à 20μm,mais certains font la taille des plus grands protozoaires. La fameuse espèceAmoeba proteuspeut atteindre 800μmde longueur[3],ce qui en fait un géant dans le monde des amiboïdes[4],et est souvent étudiée comme représentant une cellule (en raison de sa taille). Quand ils s'agglutinent, ils peuvent couvrir de très grandes surfaces. Quelques amibes, appartenant à différents genres, atteignent une taille plus grande, par exemple dans les genresGromia,PelomyxaetChaos.

Morphologie

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Amibe, telle qu'observée par Wilson au microscope vers 1900; légende originale:Amoeba proteus;un animal constitué d'une seule cellule nuex 280 (tiré de:Sedgwick and Wilson's Biology)
n.Noyau (nucleus);w.v.Vacuoled'eau;c.v.Vacuole contractile;f.v.Vacuole d'aliments.

Une des caractéristiques des amibes est qu’elles comprennent un ou plusieursnoyauxdans une même cellule, et unevacuole contractile(ou pulselle) pour maintenir leuréquilibre osmotique.

Lacelluleest généralement divisée en une masse granuleuse centrale, appeléeendoplasme,et une couche extérieure, appeléeectoplasme.Au cours de la locomotion, des flux endoplasmiques se produisent à l'avant et à l'arrière de lacellule.De nombreuses amibes ont une côté antérieur et un côté postérieur, lacellulefonctionne comme un seul pseudopode. En général, elles produisent de nombreuses projections appelées subpseudopodia, qui ne sont pas directement impliquées dans la locomotion.

D'autres amoebozoa peuvent avoir de multiples pseudopodes indéterminés, qui sont plus ou moins tubulaires et sont pour la plupart remplis de granulés endoplasmiques. Ceux-ci se rassemblent dans l'un des principaux pseudopodes, et les autres se rétractent; ils ne sont utilisés que si elle change de direction. En plus de quelques genres comme Amoeba et Chaos, cela concerne la plupart des amibes qui produisent une capsule. Ces capsules peuvent être composés de matériaux organiques, comme dans l'Arcella,ou de particules collectées et collées, comme dansDifflugia,avec une seule ouverture par laquelle le pseudopode émerge.

La plupart des Amoebozoa n'ont pas deflagelleset, plus généralement, ne sont pas soutenus par un réseaumicrotubulairesauf pendant lamitose.Toutefois, des flagelles se produisent chez certainsArchamoebae,et de nombreux genres produisent des gamètes biflagellés. Les flagelles sont généralement ancrés à un cône de microtubules, ce qui suggère une relation étroite avec lesopisthokonta.Lesmitochondriescaractéristiques de branchement ont descristastubulaires, mais ont été perdues chez lesarchamoebae.

Nutrition

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Ce sont des organismes non-photosynthétiques:ils ne produisent pas d'énergie grâce à la lumière. Lachlorophylleparfois observée dans leurs cytoplasmes provient demicroalguesphagocytées et en cours d'assimilation par l'amibe.

Le principal mode de nutrition est laphagocytose:la cellule entoure de potentielles particules d'aliments, puis la vacuole se referme et l'absorbe. Certaines amibes ont une ampoule postérieure appelée une uroïde, qui peut servir à accumuler et évacuer des déchets, et qui se détache périodiquement du reste de la cellule. Lorsque la nourriture est rare, la plupart des espèces peuvent former deskystes,qui peuvent devenir aériens et ainsi être emmenés vers de nouveaux environnements. Chez lesmyxomycètes,ces structures sont appelées spores et forment des structures appeléessporocystes.

Habitat

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Les amibes sont des protozoaires qui occupent presque tous les compartiments de l'environnement aquatique et des sols humides.

L’amibe évolue en milieu fortementaqueuxet riche enmatières organiques. Certaines ne tolèrent pas les milieuxhyper salinscomme lameret se développent dans les eaux riches en matières organiques: marais, eaux stagnantes ou polluées. On en a trouvé dans les eaux de refroidissement decentrales thermiqueset les eaux depiscines(mal traitées).

Reproduction

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Les amibes, comme les autres organismes unicellulaireseucaryotes,se reproduisent de façon asexuée parmitoseetcytocinèse(à ne pas confondre avec lafission binairequi est la façon dontprocaryotes(bactéries) se reproduisent).

Quand l'amibe est divisée par la force (coupée en deux), seule la partie contenant le noyau va survivre et reconstituer une nouvelle cellule et un cytoplasme. Les amibes n'ont également pas de forme définie[5].

Classification

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Historiquement, toutes les amibes à pseudopodes ont été regroupées sous la classe desLobosea,placées avec d'autres amiboïdes dans les taxonsSarcodinaouRhizopoda,mais ceux-ci étaient considérés comme des groupes non naturels. Des études génétiques et structurelles ont montré que lesPercolozoaet lesArchamoebaesont des groupes indépendants. Les études enphylogéniebasée sur l'ARNront montré que leurs représentants étaient séparés des autres amibes, et ont dû diverger près de la base de l'évolution deseucaryotes,de même que la plupart desmyxomycètes.

Toutefois, les arbres ont été révisés parCavalier-Smithet Chao en1996et il a été suggéré que les autres lobosans forment un groupemonophylétique,et qu'ArchamoebaeetMycetozoasont étroitement liées à celui-ci, bien que lesPercolozoane le soient pas.

Classification selonBioLib(20 avril 2021)[6]:

Classification selonWorld Register of Marine Species(20 janvier 2023)[7]:

L'amibe dans l’environnement

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On distingue les amibeslibresdes amibesparasitaires.

  • Les amibeslibressont capables d'évoluer de façon parfaitement autonome dans leur environnement. Cependant certaines d'entre elles peuvent investir le corps d'un hôte si l'occasion leur en est offerte et y déclencher unepathologie.
  • Les amibes parasitaires sont en permanence à la recherche d'un hôte; elles survivent dans l'environnement mais s'y développent généralement peu. Il arrive que certaines ne déclenchent pas desyndromepathologique chez l'hôte; on parlera alors préférentiellement decommensalismemais rarement desymbiose(l'amibe est unicellulaire).

Pathogénie

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Certaines amibes ont un pouvoir pathogène pour diverses espèces, dont l'Homme.

C'est le cas deEntamoeba histolyticaresponsable de ladysenterie amibienneou amibiase dans les milieux tropicaux. La prévalence de ce protozoaire varie considérablement dans les différents groupes de population et est généralement étroitement liée aux conditions socio-économiques.
Les taux les plus élevés sont retrouvés dans des endroits dépourvus d'installations sanitaires comme les toilettes, égouts ou dépourvus d'accès à l'eau potable.

Une espèce particulièrement dangereuse:Naegleria fowleriest responsable d'une très rare (environ 200casdans le monde) mais gravissimepathologie:laméningo-encéphalite amibienne primitive(ou MEAP), presque systématiquement mortelle pour l'Homme (~97 % de mortalité dans les 15 jours).

Le genreAcanthamoebacomme l'espèceAcanthamoeba castellaniiest responsable d'encéphalite amibienne granulomateuse(ou EAG) ou d'atteintes oculaires (kératiteoukérato-uvéite) chez les animaux et humainsimmunodéprimés.

De plus, on soupçonne une association entre des amibes pathogènes commeAcanthamoebaspp. avec des bactéries pathogènes comme legenredesLegionella,plus particulièrementLegionella pneumophila,responsable deslégionellosesoù l'amibe jouerait le rôle de vecteur et de catalyseur de surinfections en conservant, par exemple, des foyers infectieux de labactériedans seskystes.

Système immunitaire dans une colonie d'amibes

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Au sein d'une colonie d'amibes, des individus spécialisés absorbent les contaminants (bactéries, toxines). Ces cellules ont une capacité de stockage dix fois plus importante que celle des autrescellulesde la colonie. Elles sont ensuite rejetées à l'arrière au fur et à mesure du déplacement de la colonie[8].

Résistances

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Certaines amibes font preuve d'une relative résistance à certains biocides (dont le chlore actif des piscines, sous un certain seuil de concentration).

LesAcanthamoebas'avèrent plus résistantes que lesNaegleria(ils ont une durée de survie dans une eau 40 fois plus longue: 40 min contre 1 min). 0,5mg/l de chlore actif (acide hypochloreux) est le minimum nécessaire dans une piscine pour éliminer les amibes, ce qui implique 0,5 à 1mg/l de chlore actif en permanence. Si l'acide hypochloreux est activé par 5 à 10 % debromenaissant, le chlore tue les amibes plus rapidement.

Génomique

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Une autre caractéristique remarquable des amibes est la grande taille de leur génome.

L'espèceAmoeba proteusa 270 milliards (109) de paires de bases dans son génome, etPolychaos dubium(autrefois nomméAmoeba dubia) en compte 670 milliards. Le génome humain est petit par contraste (environ 2,9 milliards de bases)[9].

Dans l'histoire des sciences

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Les amibes ont été pour la première fois décrites parAugust Johann Rösel von Rosenhofen1757[10].

Pour les premiers naturalistesAmoebal'« animalcule protéen » faisait référence à laMythologie grecquedans laquelle le dieuProteuspouvait changer d'apparence. Le nom « amibe » a été ensuite donné à ces organismes parBory de Saint-Vincent[11],depuis le grecamoibè(αμοιβή), signifiant « changement[12]».

Dientamoeba fragilisa été décrite dès1918[13]et n'a été reconnue comme pathogène important chez l'Homme qu'avec difficulté et on ne sait toujours pas comment cette amibe est transmise (peut être en même temps que les spores du ver parasite (oxyure)Enterobius vermicularis)[13].

Organisme modèle

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Chaos carolinense
Amibes en mouvement

La simplicité fonctionnelle et structurale des amibes a permis d'en faire unorganismed'étude et de laboratoire modèle.

Elles ont permis de nombreuses études, notamment parBalbianisur la localisation de l'information génétique dans le noyau (section d'amibe).

Voir aussi

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Articles connexes

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Bibliographie

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  1. ↑(en)Thomas Cavalier-Smith,"A revised six-kingdom system of life",Biological Reviews,Cambridge Philosophical Society,vol.73, n°3, août 1998, p. 232.DOI10.1111/j.1469-185X.1998.tb00030.x
  2. ↑(en)Sina M. Adl, Alastair G.B. Simpson, Christopher E. Lane, Julius Lukeš, David Bass, Samuel S. Bowser, Matthew W. Brown, Fabien Burki, Micah Dunthorn, Vladimir Hampl, Aaron Heiss, Mona Hoppenrath, Enrique Lara, Line Le Gall, Denis H. Lynn, Hilary McManus, Edward A.D. Mitchell, Sharon E. Mozley-Stanridge, Laura W. Parfrey, Jan Pawlowski, Sonja Rueckert, Laura Shadwick, Conrad L. Schoch, Alexey Smirnov et Frederick W. Spiegel,«The Revised Classification of Eukaryotes»,Journal of Eukaryotic Microbiology,vol.59,no5,‎,p.429-514(ISSN1066-5234,DOI10.1111/j.1550-7408.2012.00644.x,lire en ligne)
  3. ↑ Amoeba proteus;Amoebae on the Web, consulté 2009-10-08
  4. ↑MacIver, Sutherland;Isolation of Amoebae;The Amoebae, consulté 2009-10-08
  5. ↑Amoeba;Scienceclarified.com
  6. ↑BioLib,consulté le 20 avril 2021
  7. ↑World Register of Marine Species,consulté le 20 janvier 2023
  8. ↑Émilie Rauscher,Système immunitaire: nos défenses sont plus vieilles que nous,Science et Vie,février 2008, page 77.
  9. ↑«Sizing up genomes: Amoeba is king», surgenomenewsnetwork.org(consulté le).
  10. ↑(en)JosephLeidy,«Amoeba proteus»,The American Naturalist,vol.12,no4,‎,p.235–238(DOI10.1086/272082,lire en ligne,consulté le)
  11. ↑Jean-VictorAudouinet al.,Dictionnaire classique d'histoire naturelle,Rey et Gravier,(lire en ligne),p.5
  12. ↑(en)KimberleyMcGrathet Stacey Blachford (eds.),Gale Encyclopedia of Science Vol. 1: Aardvark-Catalyst (2eéd.),Gale Group,,4136p.(ISBN978-0-7876-4370-6,OCLC46337140)
  13. ↑aetbEugene H. Johnson, Jeffrey J. Windsor, et C. Graham Clark;Emerging from Obscurity: Biological, Clinical, and Diagnostic Aspects of Dientamoeba fragilis;Clinical Microbiology Reviews,juillet 2004,p.553-570,Vol. 17, No. 3 0893-8512/04/08,00$+0; DOI: 10.1128/CMR.17.3.553-570.2004 (Résumé).

Liens externes

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