Vibrio
Domaine | Bacteria |
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Embranchement | Pseudomonadota |
Classe | Gammaproteobacteria |
Ordre | Vibrionales |
Famille | Vibrionaceae |
- AllomonasKalinaet al.1984
- LucibacteriumHendrieet al.1970
- BeneckeaCampbell 1957
Vibrio(en français les Vibrions) est ungenredebacillesGramnégatifs de lafamilledesVibrionaceae.Son nom tiré du latinvibro(vibrer, tressaillir, trembler) fait référence à la mobilité extrême et d'allure désordonnée observée chez ces bactéries. C'est legenre typede l'ordredesVibrionaleset de lafamilledesVibrionaceae.
En 2022 le nombre d'espècesdécrites et validement publiées a déjà largement dépassé la centaine. La plus célèbre est aussi l'espèce type,Vibrio cholerae,qui est l'agent responsable de l'infectiontoxiniquegrave appeléecholéra.D'autres espèces deVibrioprovoquent des atteintes digestives moins sévères à type degastroentérites.
Écologie
[modifier|modifier le code]Habitat
[modifier|modifier le code]Ce sont desbactériesvivant dans l'eau.Beaucoup vivent ensaprophytesdans les eaux douces, mais elles sont également communes dans les habitats aquatiques salés (eaux de mer,estuaires,intestins des animaux marins). Leur résistance aux sels marin s'explique par leurhalophilie.
Pouvoir pathogène
[modifier|modifier le code]Quelques espèces possèdent un pouvoirpathogène,les unes contre lesHommes,les autres contre les animaux aquatiques comme lespoissonsou lesbatraciens.
L'espèceVibrio choleraeest responsable d'une maladie grave exclusivement humaine, célèbre dans l'histoire pour sesépidémiesmondiales: lecholéraqui reste, aujourd'hui, une lourde menace pour certains pays africains et le sous-continentIndien.
Vibrio parahaemolyticusprovoque des infections digestives à la suite de consommation de coquillages (huîtres), crustacés, poissons d'eau salée crus ou insuffisamment cuits, cette bactérie est responsable de nombreusestoxi-infectionsauJaponoù la consommation de poissons crus est très courante.
Ainsi lesVibriopathogènes possèdent plus spécifiquement un « pouvoirtoxique»: capacité de la bactérie à sécréter unetoxineresponsable de trouble dans le fonctionnement d'un organisme supérieur.
Prévalence
[modifier|modifier le code]Le rapportLancet Countdown on health and climate change2023 publié[2]mercredi 15 novembre par la revueThe Lancetalerte sur le fait que ce genre bactérien (dont deux bactéries sont redoutéesVibrio parahaemolyticusetVibrio vulnificusdite « bactérie mangeuse de chair ») est de plus en plus présent dans les eaux côtières en raison du réchauffement des eaux marines et du climat[3].
Ces zones concernées gagnent en moyenne 329 kilomètres tous les ans depuis 1982. C'est aux États-Unis qu'on s'est d'abord inquiété: leCDCestimait en 2023 à 150 à 200 le nombre annuel d'infections parVibrio vulnificusdans le pays, survenant surtout les mois les plus chauds. Une personne diagnostiquée sur cinq en meurt. Mais l'Europe était en 2022 la région du monde où l'extension moyenne de la zone de risque s'est le plus accrue: 142 kilomètres par an (record historique de propagation)[3].
En 2022, 10 % des littoraux du monde sont concernés, avec 1,4 milliard de personnes susceptibles de développer des maladies diarrhéiques, de graves infections des plaies et des septicémies dues à ces bactéries. Dans un scénario de réchauffement à2°Cla zone concernée devrait s'agrandir de 17 à 25 % (soit + 23 % à +39 % de cas supplémentaires de vibrioses entre 2023 et 2050[3].
En 2022, 17 % du littoral européen était concerné, avec 421 000 cas déclarés de vibrioses en 2022 (un nombre qui devrait augmenter de 5 000 cas par an), d'autant que la température de surface de l'Atlantique a encore battu des records de chaleur à plusieurs reprises en 2023 (ex.:T°C moyenne de24,2°Cle 17 octobre, soit +1,1°Cde plus que la norme 1982-2011)[3].
En 2023, Patrick Monfort (CNRS,spécialiste des vibrions) alerte sur le fait que ce risque est« aggravé par les événements extrêmes comme les ouragans, les tempêtes ou les inondations qui vont faire varier les niveaux de salinité de l’eau, deuxième facteur favorable à la propagation de ces Vibrio ».Ainsi, après le passage de l'ouragan Ian sur la Floride (septembre 2022), 38 nouveaux cas ont été signalés (dont 11 mortels). Le nombre de cas devrait doubler dans les vingt prochaines années aux États-Unis[3].
Caractères bactériologiques
[modifier|modifier le code]Aspect microscopique
[modifier|modifier le code]Les vibrions se présentent sous la forme de bacillesGram négatifsfins, fréquemment de forme incurvés, de 2 à 3 µm de long. Ils se caractérisent par une grande mobilité liée à la présence d'unflagelleunique: ciliature polaire. Ainsi leurs déplacements sont très rapides, et suivent une trajectoire rectiligne.
Aspect macroscopique et de culture
[modifier|modifier le code]LesVibriodonnent sur GTS (gélose trypticase soja) des colonies de 2 à 3mmde diamètre, circulaires à bords réguliers, assez plates, légèrement convexes, transparentes en général en 24h. Puis les colonies s'opacifient; colonies lisses, luisantes de type S.
Conditions de culture
[modifier|modifier le code]Aérobie de préférence, ils se développent peu ou pas enanaérobiose.Ils se cultivent bien sur les milieux ordinaires entre 10 °C et 40 °C (psychrophilesetmésophiles), un pH un peu au-dessus de 7 sera optimal pour leur culture (neutrophileetalcalophile). Leur culture est rapide et abondante sur un milieu peptoné simple (germe « non-exigeant »).
LesVibrioont des propriétés qui permettent leur « électivité » sur les différents milieux:
- Ils se cultivent à un pHalcalinentre 7,5 et 9
- Ils se cultivent à de forte concentration en NaCl (10 à 30 g/l), du fait de leur caractèrehalophile.Toutefois certaines espèces de Vibrio sont incapables de pousser en absence de NaCl, elles sont dites halophiles obligatoires.
- Leur croissance n'est pas entravée par l'ajout de différentsinhibiteurstels que lessels biliaires,citratedesodium,thiosulfatede sodium...
- ce qui fait d'eux des sources potentielles d'erreurs d'identification avec lesentérobactéries,dont les milieux sélectifs sont propices au développement des Vibrio.
Caractéristiques des cultures
[modifier|modifier le code]- « Aspect en bouillon »: trouble homogène avec un voile en surface.
- « Aspect en gélose »: petites ou moyennes colonies (de 1 à 2mmde diamètre pour 24 heures) semi-bombé, lisses, arrondies: de typesmooth;transparentes ou translucides.
Milieux de culture
[modifier|modifier le code]Milieux non sélectifs:
Milieux sélectifs:
- Milieu TCBS(thiosulfate-citrate-bile-saccharose)
Caractères biochimiques
[modifier|modifier le code]Les caractères biochimiques desVibriosont étudiés en galerie classique pour entérobactérie ou enApi 20 NEpour bacille gram - non-entérobactérie.
Un test permet de différencier les genresVibriodu genreAeromonasdans la famille desVibrionaceae:il s'agit du test devibriostase,un test de la sensibilité des bactéries à un composé 'vibriostatiqueO129. sachant que le genreVibrioest sensible.
Liste d'espèces
[modifier|modifier le code]Selon laLPSN(8 décembre 2022)[4]:
- Vibrio aerogenesShiehet al.2000
- Vibrio aestivusLucenaet al.2013
- Vibrio aestuarianusTison & Seidler 1983
- Vibrio agarilyticusWanget al.2021
- Vibrio agarivoransMaciánet al.2001
- Vibrio albusLiet al.2019
- Vibrio alfacsensisGomez-Gilet al.2012
- Vibrio algicolaGenget al.2020
- Vibrio alginolyticus(Miyamotoet al.1961) Sakazaki 1968
- Vibrio algivorusDoiet al.2016
- Vibrio aphrogenesTanakaet al.2018
- Vibrio aquaticusLiet al.2020
- Vibrio areninigraeChanget al.2008
- Vibrio artabrorumDiéguezet al.2011
- Vibrio astriarenaeAl-Saariet al.2016
- Vibrio atlanticusDiéguezet al.2011
- Vibrio atypicusWanget al.2010
- Vibrio azureusYoshizawaet al.2009
- Vibrio barjaeiDubertet al.2017
- Vibrio bivalvicidaDubertet al.2016
- Vibrio brasiliensisThompsonet al.2003
- Vibrio breoganiiBeaz Hidalgoet al.2009
- Vibrio campbellii(Baumannet al.1971) Baumannet al.1981
- Vibrio caribbeanicusHoffmannet al.2012
- Vibrio caseiBleicheret al.2010
- Vibrio celticusBeaz-Hidalgoet al.2011
- Vibrio chagasiiThompsonet al.2003
- Vibrio choleraePacini 1854 –espèce type
- Vibrio cidiciiOrataet al.2016
- Vibrio cincinnatiensisBraytonet al.1986
- Vibrio comitansSawabeet al.2007
- Vibrio coralliilyticusBen-Haimet al.2003
- Vibrio coralliirubriPoliet al.2018
- Vibrio cortegadensisLasaet al.2014
- Vibrio crassostreaeFauryet al.2004
- Vibrio crosaiGonzález-Castilloet al.2015
- Vibrio cyclitrophicuscorrig. Hedlund & Staley 2001
- Vibrio diabolicusRaguénèset al.1997
- Vibrio diazotrophicusGuerinotet al..1982
- Vibrio echinoideorumHiraet al.2019
- Vibrio europaeus(Pradoet al.2016) Dubertet al.2016
- Vibrio ezuraeSawabeet al.2005
- Vibrio fluvialisLeeet al.1981
- Vibrio fortisThompsonet al.2003
- Vibrio fujianensisFanget al.2018
- Vibrio furnissiiBrenneret al.1984
- Vibrio galatheaeGiubergiaet al.2016
- Vibrio gallaecicusBeaz-Hidalgoet al.2009
- Vibrio gallicusSawabeet al.2004
- Vibrio ganglieiMenget al.2018
- Vibrio gazogenes(Harwoodet al.1980) Baumannet al.1981
- Vibrio gigantisLe Rouxet al.2005
- Vibrio halioticoliSawabeet al.1998
- Vibrio hangzhouensisXuet al.2009
- Vibrio hannamiLeeet al.2019
- Vibrio harveyi(Johnson & Shunk 1936) Baumannet al.1981
- Vibrio hepatariusThompsonet al.2003
- Vibrio hippocampiBalcázaret al.2010
- Vibrio hispanicusGomez-Gilet al.2004
- Vibrio hyugaensisUrbanczyket al.2015
- Vibrio ichthyoenteriIshimaruet al.1996
- Vibrio injensiscorrig. Paeket al.2021
- Vibrio inusitatusSawabeet al.2007
- Vibrio ishigakensisGaoet al.2018
- Vibrio japonicusDoiet al.2017
- Vibrio jasicidaYoshizawaet al.2012
- Vibrio kanaloaeThompsonet al.2003
- Vibrio lentusMaciánet al.2001
- Vibrio litoralisNamet al.2007
- Vibrio madraciusMoreiraet al.2015
- Vibrio mangroviRameshkumaret al.2011
- Vibrio marisflaviWanget al.2011
- Vibrio maritimusChimettoet al.2011
- Vibrio mediterraneiPujalte & Garay 1986
- Vibrio metoecusKirchbergeret al.2014
- Vibrio metschnikoviiGamaleia 1888
- Vibrio mexicanusGonzález-Castilloet al.2015
- Vibrio mimicusDaviset al.1982
- Vibrio mytiliPujalteet al.1993
- Vibrio natriegens(Payneet al.1961) Baumannet al.1981
- Vibrio navarrensisUrdaciet al.1991
- Vibrio neonatusSawabeet al.2005
- Vibrio neptuniusThompsonet al.2003
- Vibrio nereis(Harwoodet al.1980) Baumannet al.1981
- Vibrio nigripulchritudo(Baumannet al.1971) Baumannet al.1981
- Vibrio nitrifigilisHuanget al.2021
- Vibrio oceanisediminisKanget al.2015
- Vibrio olivaeLucena-Padróset al.2015
- Vibrio ordaliiSchieweet al.1982
- Vibrio orientalisYanget al.1983
- Vibrio ostreaeMuhammadet al.2022
- Vibrio ostreicidaPradoet al.2014
- Vibrio ouciLiet al.2020
- Vibrio owensiiCano-Gómezet al.2010
- Vibrio paciniiGomez-Gilet al.2003
- Vibrio palustrisLucenaet al.2017
- Vibrio panuliriKumariet al.2015
- Vibrio paracholeraeIslamet al.2022
- Vibrio parahaemolyticus(Fujinoet al.1951) Sakazakiet al.1963
- Vibrio pectenicidaLambertet al.1998
- Vibrio penaeicidaIshimaruet al.1995
- Vibrio plantisponsorRameshkumaret al.2012
- Vibrio pomeroyiThompsonet al.2003
- Vibrio ponticusMaciánet al.2005
- Vibrio porteresiaeRameshkumaret al.2008
- Vibrio proteolyticus(Merkelet al.1964) Baumannet al.1982
- Vibrio quintilisLucenaet al.2013
- Vibrio rarusSawabeet al.2007
- Vibrio renipiscariusTarazonaet al.2015
- Vibrio rhizosphaeraeRamesh Kumar & Nair 2007
- Vibrio rotiferianusGomez-Gilet al.2003
- Vibrio ruberShiehet al.2003
- Vibrio rumoiensisYumotoet al.1999
- Vibrio sagamiensisYoshizawaet al.2011
- Vibrio salilacusZhonget al.2015
- Vibrio salmonicidaEgidiuset al.1986
- Vibrio scophthalmiCerdà-Cuéllaret al.1997
- Vibrio sinaloensisGomez-Gilet al.2008
- Vibrio sinensisLiet al.2020
- Vibrio sonorensisGonzález-Castilloet al.2017
- Vibrio spartinaeLucenaet al.2017
- Vibrio splendidus(Beijerinck 1900) Baumannet al.1981
- Vibrio stylophoraeSheuet al.2011
- Vibrio superstesHayashiet al.2003
- Vibrio taketomensisTanakaet al.2021
- Vibrio tapetisBorregoet al.1996
- Vibrio tarriaeIslamet al.2022
- Vibrio tasmaniensisThompsonet al.2003
- Vibrio thalassaeTarazonaet al.2014
- Vibrio toranzoniaeLasaet al.2013
- Vibrio tritoniusSawabeet al.2015
- Vibrio tubiashiiHadaet al.1984
- Vibrio ulleungensisMoon & Park 2021
- Vibrio variabilisChimettoet al.2011
- Vibrio viridaestusLiet al.2020
- Vibrio vulnificus(Reicheltet al.1979) Farmer 1980
- Vibrio xiamenensisGaoet al.2012
- Vibrio xuiiThompsonet al.2003
- Vibrio zhugeiGuoet al.2019
- Vibrio ziniensisWuet al.2021
Voir aussi
[modifier|modifier le code]- Lesgram négatifs
- Lecholéra
Notes et références
[modifier|modifier le code]- Pacini F « Osservazione microscopiche e deduzioni patologiche sul cholera asiatico »Gazette Medicale de Italiana Toscano Firenze1854;6:405-412.Accès libre.
- Rapport 2023duLancet Countdown on health and climate change.
- «Le Vibrio, cette bactérie mangeuse de chair qui prolifère avec le réchauffement des océans», surnovethic.fr(consulté le).
- List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature(LPSN), consulté le 8 décembre 2022