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Vibrio

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Vibrio
Description de cette image, également commentée ci-après
Classification LPSN
Domaine Bacteria
Embranchement Pseudomonadota
Classe Gammaproteobacteria
Ordre Vibrionales
Famille Vibrionaceae

Genre

Synonymes

  • AllomonasKalinaet al.1984
  • LucibacteriumHendrieet al.1970
  • BeneckeaCampbell 1957

Vibrio(en français les Vibrions) est ungenredebacillesGramnégatifs de lafamilledesVibrionaceae.Son nom tiré du latinvibro(vibrer, tressaillir, trembler) fait référence à la mobilité extrême et d'allure désordonnée observée chez ces bactéries. C'est legenre typede l'ordredesVibrionaleset de lafamilledesVibrionaceae.

En 2022 le nombre d'espècesdécrites et validement publiées a déjà largement dépassé la centaine. La plus célèbre est aussi l'espèce type,Vibrio cholerae,qui est l'agent responsable de l'infectiontoxiniquegrave appeléecholéra.D'autres espèces deVibrioprovoquent des atteintes digestives moins sévères à type degastroentérites.

Ce sont desbactériesvivant dans l'eau.Beaucoup vivent ensaprophytesdans les eaux douces, mais elles sont également communes dans les habitats aquatiques salés (eaux de mer,estuaires,intestins des animaux marins). Leur résistance aux sels marin s'explique par leurhalophilie.

Pouvoir pathogène

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Quelques espèces possèdent un pouvoirpathogène,les unes contre lesHommes,les autres contre les animaux aquatiques comme lespoissonsou lesbatraciens.

L'espèceVibrio choleraeest responsable d'une maladie grave exclusivement humaine, célèbre dans l'histoire pour sesépidémiesmondiales: lecholéraqui reste, aujourd'hui, une lourde menace pour certains pays africains et le sous-continentIndien.
Vibrio parahaemolyticusprovoque des infections digestives à la suite de consommation de coquillages (huîtres), crustacés, poissons d'eau salée crus ou insuffisamment cuits, cette bactérie est responsable de nombreusestoxi-infectionsauJaponoù la consommation de poissons crus est très courante.
Ainsi lesVibriopathogènes possèdent plus spécifiquement un « pouvoirtoxique»: capacité de la bactérie à sécréter unetoxineresponsable de trouble dans le fonctionnement d'un organisme supérieur.

Le rapportLancet Countdown on health and climate change2023 publié[2]mercredi 15 novembre par la revueThe Lancetalerte sur le fait que ce genre bactérien (dont deux bactéries sont redoutéesVibrio parahaemolyticusetVibrio vulnificusdite « bactérie mangeuse de chair ») est de plus en plus présent dans les eaux côtières en raison du réchauffement des eaux marines et du climat[3].

Ces zones concernées gagnent en moyenne 329 kilomètres tous les ans depuis 1982. C'est aux États-Unis qu'on s'est d'abord inquiété: leCDCestimait en 2023 à 150 à 200 le nombre annuel d'infections parVibrio vulnificusdans le pays, survenant surtout les mois les plus chauds. Une personne diagnostiquée sur cinq en meurt. Mais l'Europe était en 2022 la région du monde où l'extension moyenne de la zone de risque s'est le plus accrue: 142 kilomètres par an (record historique de propagation)[3].

En 2022, 10 % des littoraux du monde sont concernés, avec 1,4 milliard de personnes susceptibles de développer des maladies diarrhéiques, de graves infections des plaies et des septicémies dues à ces bactéries. Dans un scénario de réchauffement à2°Cla zone concernée devrait s'agrandir de 17 à 25 % (soit + 23 % à +39 % de cas supplémentaires de vibrioses entre 2023 et 2050[3].

En 2022, 17 % du littoral européen était concerné, avec 421 000 cas déclarés de vibrioses en 2022 (un nombre qui devrait augmenter de 5 000 cas par an), d'autant que la température de surface de l'Atlantique a encore battu des records de chaleur à plusieurs reprises en 2023 (ex.:T°C moyenne de24,2°Cle 17 octobre, soit +1,1°Cde plus que la norme 1982-2011)[3].

En 2023, Patrick Monfort (CNRS,spécialiste des vibrions) alerte sur le fait que ce risque est« aggravé par les événements extrêmes comme les ouragans, les tempêtes ou les inondations qui vont faire varier les niveaux de salinité de l’eau, deuxième facteur favorable à la propagation de ces Vibrio ».Ainsi, après le passage de l'ouragan Ian sur la Floride (septembre 2022), 38 nouveaux cas ont été signalés (dont 11 mortels). Le nombre de cas devrait doubler dans les vingt prochaines années aux États-Unis[3].

Caractères bactériologiques

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Aspect microscopique

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Les vibrions se présentent sous la forme de bacillesGram négatifsfins, fréquemment de forme incurvés, de 2 à 3 µm de long. Ils se caractérisent par une grande mobilité liée à la présence d'unflagelleunique: ciliature polaire. Ainsi leurs déplacements sont très rapides, et suivent une trajectoire rectiligne.

Aspect macroscopique et de culture

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LesVibriodonnent sur GTS (gélose trypticase soja) des colonies de 2 à 3mmde diamètre, circulaires à bords réguliers, assez plates, légèrement convexes, transparentes en général en 24h. Puis les colonies s'opacifient; colonies lisses, luisantes de type S.

Conditions de culture

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Aérobie de préférence, ils se développent peu ou pas enanaérobiose.Ils se cultivent bien sur les milieux ordinaires entre 10 °C et 40 °C (psychrophilesetmésophiles), un pH un peu au-dessus de 7 sera optimal pour leur culture (neutrophileetalcalophile). Leur culture est rapide et abondante sur un milieu peptoné simple (germe « non-exigeant »).

LesVibrioont des propriétés qui permettent leur « électivité » sur les différents milieux:

  • Ils se cultivent à un pHalcalinentre 7,5 et 9
  • Ils se cultivent à de forte concentration en NaCl (10 à 30 g/l), du fait de leur caractèrehalophile.Toutefois certaines espèces de Vibrio sont incapables de pousser en absence de NaCl, elles sont dites halophiles obligatoires.
  • Leur croissance n'est pas entravée par l'ajout de différentsinhibiteurstels que lessels biliaires,citratedesodium,thiosulfatede sodium...
    • ce qui fait d'eux des sources potentielles d'erreurs d'identification avec lesentérobactéries,dont les milieux sélectifs sont propices au développement des Vibrio.

Caractéristiques des cultures

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  • « Aspect en bouillon »: trouble homogène avec un voile en surface.
  • « Aspect en gélose »: petites ou moyennes colonies (de 1 à 2mmde diamètre pour 24 heures) semi-bombé, lisses, arrondies: de typesmooth;transparentes ou translucides.

Milieux de culture

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Milieux non sélectifs:

Milieux sélectifs:

Caractères biochimiques

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Les caractères biochimiques desVibriosont étudiés en galerie classique pour entérobactérie ou enApi 20 NEpour bacille gram - non-entérobactérie.
Un test permet de différencier les genresVibriodu genreAeromonasdans la famille desVibrionaceae:il s'agit du test devibriostase,un test de la sensibilité des bactéries à un composé 'vibriostatiqueO129. sachant que le genreVibrioest sensible.

Liste d'espèces

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Selon laLPSN(8 décembre 2022)[4]:

Notes et références

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  1. Pacini F « Osservazione microscopiche e deduzioni patologiche sul cholera asiatico »Gazette Medicale de Italiana Toscano Firenze1854;6:405-412.Accès libre.
  2. Rapport 2023duLancet Countdown on health and climate change.
  3. abcdete«Le Vibrio, cette bactérie mangeuse de chair qui prolifère avec le réchauffement des océans», surnovethic.fr(consulté le).
  4. List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature(LPSN), consulté le 8 décembre 2022