ADN A
L'ADN Aest une forme de ladouble héliced'ADNproche de l'ADN B— la forme naturellement la plus courante de cette molécule — dans laquelle lesbases nucléiquessont plus inclinées par rapport à l'axe de la double hélice, ce qui augmente le diamètre de la structure ainsi que le nombre depaires de basespar unité de longueur de la double hélice. Le diamètre d'unADN Aest typiquement de2,3nm(contre2,0nmpour l'ADN B) tandis que la double hélice s'allonge en moyenne de0,24nmpar paire de bases, contre0,32nmpour l'ADN B). Ceci a pour effet d'élargir le grand sillon et de rendre le petit sillon plus étroit.
Cette forme d'ADN dériverait de la forme B par déshydratation et se rencontrerait de ce fait essentiellement dans les échantillons dematériel génétiqueutilisés encristallographie aux rayons X.La forme A serait également celle des hybridesbicaténairesd'ADNet d'ARN.
| Paramètre | ADN A | ADN B | ADN Z |
|---|---|---|---|
| Sens de l'hélice | droite | droite | gauche |
| Motif répété | 1bp | 1bp | 2bp |
| Angle de rotation parpaire de bases | 32,7° | 34,3° | 60°/2 |
| Nombre depaires de basespar tour d'hélice | 11 | 10,5 | 12 |
| Pas de l'hélice par tour | 2,82nm | 3,32nm | 4,56nm |
| Allongement de l'axe parpaire de bases | 0,24nm | 0,32nm | 0,38nm |
| Diamètre | 2,3nm | 2,0nm | 1,8nm |
| Inclinaison despaires de basessur l'axe de l'hélice | +19° | −1,2° | −9° |
| Torsion moyenne (propeller twist) | +18° | +16° | 0° |
| Orientation dessubstituantsdesbases sur lesrésidusosidiques |
anti | anti | Pyrimidine:anti, Purine:syn |
| Plissement / torsion endocyclique dufuranose (Sugar pucker) |
C3’-endo | C2’-endo | Cytosine:C2’-endo, Guanine:C3’-endo |
Notes et références
[modifier|modifier le code]- (en)Richard RSinden,DNA structure and function,Academic Press,,398p.(ISBN0-12-645750-6)
- (en)Rich A, Norheim A, Wang AHJ, «The chemistry and biology of left-handed Z-DNA»,Annual Review of Biochemistry,vol.53,,p.791–846(PMID6383204,DOI10.1146/annurev.bi.53.070184.004043)
- (en)Ho PS, «The non-B-DNA structure of d(CA/TG)n does not differ from that of Z-DNA»,Proc Natl Acad Sci USA,vol.91,no20,,p.9549–9553(PMID7937803,PMCID44850,DOI10.1073/pnas.91.20.9549,Bibcode1994PNAS...91.9549H)
