ADN Z
Apparence
L'ADN Zest une forme d'ADNcaractérisée par unedouble hélicegauche, contrairement à l'ADN B,naturellement la plus courante, et à l'ADN A,observée notamment après déshydratation de la première. L'ADN Zest plus étroit que l'ADN Bet l'ADN A,avec un allongement supérieur parpaire de basesajoutée. Cette forme d'ADN bicaténaire jouerait un rôle dans le relâchement des tensions induites par lesurenroulement de l'ADNlors de laréplication[1],[2].L'apparition d'ADN Z coïncide par ailleurs avec les régions dugénomeà forte activité de transcription.
Paramètre | ADN A | ADN B | ADN Z |
---|---|---|---|
Sens de l'hélice | droite | droite | gauche |
Motif répété | 1bp | 1bp | 2bp |
Angle de rotation parpaire de bases | 32,7° | 34,3° | 60°/2 |
Nombre depaires de basespar tour d'hélice | 11 | 10,5 | 12 |
Pas de l'hélice par tour | 2,82nm | 3,32nm | 4,56nm |
Allongement de l'axe parpaire de bases | 0,24nm | 0,32nm | 0,38nm |
Diamètre | 2,3nm | 2,0nm | 1,8nm |
Inclinaison despaires de basessur l'axe de l'hélice | +19° | −1,2° | −9° |
Torsion moyenne (propeller twist) | +18° | +16° | 0° |
Orientation dessubstituantsdesbases sur lesrésidusosidiques |
anti | anti | Pyrimidine:anti, Purine:syn |
Plissement / torsion endocyclique dufuranose (Sugar pucker) |
C3’-endo | C2’-endo | Cytosine:C2’-endo, Guanine:C3’-endo |
Notes et références
[modifier|modifier le code]- (en)Sung Chul Ha, Ky Lowenhaupt, Alexander Rich, Yang-Gyun Kim et Kyeong Kyu Kim,«Crystal structure of a junction between B-DNA and Z-DNA reveals two extruded bases»,Nature,vol.437,no7062,,p.1183-1186(PMID16237447,DOI10.1038/nature04088,Bibcode2005Natur.437.1183H,lire en ligne)
- (en)Alexander Rich et Shuguang Zhang,«Z-DNA: the long road to biological function»,Nature Reviews Genetics,vol.4,no7,,p.566-572(PMID12838348,DOI10.1038/nrg1115,lire en ligne)
- (en)Richard RSinden,DNA structure and function,Academic Press,,398p.(ISBN0-12-645750-6)
- (en)Rich A, Norheim A, Wang AHJ, «The chemistry and biology of left-handed Z-DNA»,Annual Review of Biochemistry,vol.53,,p.791–846(PMID6383204,DOI10.1146/annurev.bi.53.070184.004043)
- (en)Ho PS, «The non-B-DNA structure of d(CA/TG)n does not differ from that of Z-DNA»,Proc Natl Acad Sci USA,vol.91,no20,,p.9549–9553(PMID7937803,PMCID44850,DOI10.1073/pnas.91.20.9549,Bibcode1994PNAS...91.9549H)