Alphaproteobacteria
Domaine | Bacteria |
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Embranchement | Pseudomonadota |
- CaulobacteriaCavalier-Smith 2020
- AlphabacteriaCavalier-Smith 2002
- Anoxyphotobacteria(Gibbons & Murray 1978) Murray 1988
LesAlphaproteobacteria(en français les Alphaprotéobactéries) sont uneclassedebactériesàGramnégatif de l'embranchementdesPseudomonadota.Son nom, formé sur les mots grecsAlpha(ἄλφα: première lettre de l' Alpha bet) etProteus(Προτεύς:Protée,dieu capable de se métamorphoser) complétés dunéolatinbacteria(bactérie), n'est exceptionnellement pas dérivé du nom de son ordre typeCaulobacterales.
C'est une classe très diversifiée qui comprend relativement peu de genres pathogènes humains tels queBartonella,Brucellaou encoreRickettsia.On y trouve également desgenresendosymbiotesd'arthropodeset denématodes(Wolbachia),symbiotesde plantes dans larhizosphère(Rhizobium),phototrophes(Rhodobacter) ouméthanotrophes(familles desMethylocystaceaeetBeijerinckiaceae), etc. D'après lathéorie endosymbiotique,lesproto-mitochondries(en)dont proviennent lesmitochondriesactuelles sont vraisemblablement desAlphaproteobacteriaproches desRickettsia.
L'espèceAgrobacterium radiobacter(anciennementA. tumefaciens) est exploitée par legénie génétiquecommevecteurdetransfectionpour introduire de l'ADNétranger dans descellules végétales.Des adaptations à la présence debiocideset à destempératures élevéesont été décrites chezRubellimicrobium thermophilumdans un environnement industriel (fabrication de papier)[2].
Taxonomie
[modifier|modifier le code]Cetaxonest décrit en 2006 parG.M. Garrityet al.dans la deuxième édition duBergey's Manual of Systematic Bacteriology[1].Il est validé la même année par une publication dans l'IJSEM[3].
En 2013, M.P. Ferlaet al.s'appuient sur unséquençagedes gènes de l'ARN ribosomiquede lagrandeet de lapetitesous-unitépour proposer une subdivision desAlphaproteobacteriaen troissous-classes:Caulobacteridae,MagnetobacteridaeetRicketsiidae(corrig.)[4]
Liste d'ordres
[modifier|modifier le code]Ordres validement publiés
[modifier|modifier le code]Selon laLPSN(3 décembre 2022)[5]:
- CaulobacteralesHenrici & Johnson 1935 – ordre type
- EmcibacteralesIinoet al.2016
- HolosporalesSzokoliet al.2020
- HyphomicrobialesDouglas 1957
- IodidimonadalesIinoet al.2016
- KordiimonadalesKwonet al.2005
- MagnetococcalesBazylinskiet al.2013
- MicropepsalesHarbisonet al.2017
- MinwuialesSunet al.2018
- RhodobacteralesGarrityet al.2006
- RhodospirillalesPfennig & Trüper 1971
- RhodothalassialesVenkata Ramanaet al.2014
- RickettsialesGieszczykiewicz 1939
- SneathiellalesKurahashiet al.2008
- SphingomonadalesYabuuchi & Kosako 2006
Ordres en attente de publication valide
[modifier|modifier le code]Selon laLPSN(3 décembre 2022)[5]les ordres suivants sont en attente de publication valide (Ca.signifieCandidatus):
- «Parvularculales» Garrityet al.2003
- «Ca.Pelagibacterales» Groteet al.2012
Voir aussi
[modifier|modifier le code]Articles connexes
[modifier|modifier le code]Notes et références
[modifier|modifier le code]- Garrity GM, Bell JA & Lilburn T « Class I. Alphaproteobacteria class. nov. » In: Brenner DJ, Krieg NR, Staley JT, Garrity GM (eds) Bergey's Manual of Systematic Bacteriology,2eédition, vol. 2 (The Proteobacteria), partie C (The Alpha-, Beta-, Delta-, and Epsilonproteobacteria). Springer, New York, 2005.https://link.springer /chapter/10.1007/978-0-387-29298-4_1
- (en)Ewald B. M.Denner,MarkoKolari,DouweHoornstra,IrinaTsitko,PeterKämpfer,Hans-JürgenBusseet MirjaSalkinoja-Salonen,«Rubellimicrobium thermophilum gen. nov., sp. nov., a red-pigmented, moderately thermophilic bacterium isolated from coloured slime deposits in paper machines»,Int. J. Syst. Evol. Microbiol.,vol.56,noPt 6,,p.1355--1362(DOI10.1099/ijs.0.63751-0,résumé,lire en ligne,consulté le)
- Euzéby JP « Validation list no. 107. List of new names and new combinations previously effectively, but not validly, published »Int J Syst Evol Microbiol.2006;56(1):1-6.Accès libre.
- Ferla MPet al.« New rRNA gene-based phylogenies of the Alphaproteobacteria provide perspective on major groups, mitochondrial ancestry and phylogenetic instability »PLoS One2013;8(12):e83383.Accès libre.
- List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature(LPSN), consulté le 3 décembre 2022