Paraphylie
![Arbre d’évolution. Ce groupe comprend un ancêtre et une partie de ses descendants mais pas tous puisque les oiseaux et les mammifères en sont exclus. C'est un groupe paraphylétique de degré deux.](https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/2/2f/Traditional_Reptilia.jpg/350px-Traditional_Reptilia.jpg)
Ensystématique,un groupe est ditparaphylétiquequand il ne rassemble pas tous les descendants d'uneespèce souchequ'il contient[1].
Définitions
[modifier|modifier le code]Sens biologique
[modifier|modifier le code]Contrairement à lapolyphylie,le groupe paraphylétique est fondé sur une similitude héritée d'un ancêtre commun (homologie).[réf.souhaitée]L'exclusion de certaines lignées nécessite de considérer lesétats ancestrauxde certains caractères (encore appelésymplésiomorphie) par opposition à leursétats dérivés(ousynapomorphie) dans les lignées exclues.
Le groupe desreptiles(amniotesdesquels ont été exclus lesoiseauxet lesmammifères) en est un exemple: lescrocodiliens,inclus dans les reptiles, sont généalogiquement plus proches desoiseaux,exclus des reptiles, que des autressauropsides(chéloniens,squamatesetsphénodontiens) et les reptiles mammaliens, inclus, sont plus proches des mammifères, exclus, que des autresamniotes.L'ancêtre commun le plus proche de tous les reptiles est également l'ancêtre commun le plus proche des oiseaux, des mammifères et des reptiles. Le groupe des reptiles ainsi défini est donc paraphylétique.
amniotes ├─Synapsides │ ├─Mammifères │ └─Reptiles mammaliens----------| | └─Sauropsides ├─Chéloniens-------------------| │ | «Reptiles» └─Diapsides--------------------| ├─Lépidosauriens-----------| │ ├─Squamates-----------| │ └─Sphénodontiens------| │ | └─Archosauriens| ├─Crocodiliens--------| └─Oiseaux
Note:Lescrustacés,lesamphibiensou lespoissonssont d'autres exemples de groupes paraphylétiques.
Propriétés mathématiques
[modifier|modifier le code]Enthéorie des graphes,on peut définir le « degré de paraphylie » d'un groupe comme étant le nombre minimum de branches qu'il faudrait retirer à un groupeholophylétique[1].Un groupe holophylétique a donc un degré de paraphylie de zéro.
La définition traditionnelle des reptiles (sauropsides+synapsides) en fait un groupe ayant un degré de paraphylie de 2, puisqu'il faut retirer au groupe desamniotesla branche desmammifèreset celle desoiseaux.
Exemples
[modifier|modifier le code]- Lesprocaryotes(excluent leseucaryotes)
- Lesmicroorganismes
- Lespréspermaphytes
- Lesherbes
- Lesinvertébrés
- Lescrustacés(excluent lesinsectes)
- Lespoissons(excluent lestétrapodes)
- Lesamphibiens(excluent lesamniotes)
- Lesreptiles(excluent lesoiseauxet les mammifères)
- Lesantilopes(excluent lesbovinsetcaprins)
- Les reptiles mammaliens (incluent tous lessynapsidessauf les mammifères, qui en sont exclus)
- Lesmicromammifères
- Lesrenards
- Lessinges(Débat concernant l'inclusion, ou non, de l'humain dans ce groupe; il peut, donc, être aussi vu commemonophylétique,ce qui va donner au groupe dessimiens).
Statut de la paraphylie
[modifier|modifier le code]Pour lescladistes,lestaxonsparaphylétiques sont inacceptables dans la classification. Au contraire pour lesévolutionnistesil n'y a aucun problème dans le fait d'accepter de telstaxons.Selon la définition qui en est donnée (voir l'articleMonophylie), la paraphylie est parfois considérée comme une forme demonophylie.
Voir aussi
[modifier|modifier le code]Termes associés:
Concepts associés:
Notes et références
[modifier|modifier le code]- Aubert, D. 2015. A formal analysis of phylogenetic terminology: Towards a reconsideration of the current paradigm in systematics.Phytoneuron2015-66:1–54.https://hal.archives-ouvertes.fr/hal-01240878v1