Sphingomonadaceae
Domaine | Bacteria |
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Embranchement | Proteobacteria |
Classe | Alphaproteobacteria |
Ordre | Sphingomonadales |
LesSphingomonadaceaesont unefamilledeprotéobactériesà colorationGram négativede l'ordre desSphingomonadales.
Cette famille regroupe une quinzaine de genres, dont certaines espèces sont desbactéries phytopathogènes.Le genre type estSphingomonas[2].
Une caractéristique importante desSphingomonadaceaeest la présence desphingolipidesdans la membrane externe de laparoi cellulaire[3]. Les cellules sont ovoïdes ou en forme de bâtonnet. Certaines sont égalementpléomorphes,c'est-à-dire que les cellules changent de forme au fil du temps. Certaines espèces sontphototrophes.
LesSphingomonadaceaesont aussi connues par la capacité de certaines espèces à dégrader certainscomposés aromatiques.Cela rend ces bactéries intéressantes pour ladépollutionde l'environnement[4].
Liste des genres
[modifier|modifier le code]SelonCatalogue of Life(15 août 2014)[5]:
- genreAminobacter
- genreBlastomonas
- genreErythrobacter
- genreErythromicrobium
- genreNovosphingobium
- genrePorphyrobacter
- genreSandaracinobacter
- genreSandarakinorhabdus
- genreSphingobium
- genreSphingomonas
- genreSphingopyxis
- genreSphingosinicella
- genreZymomonas
SelonWorld Register of Marine Species(15 août 2014)[6]:
- genreBlastomonasSly & Cahill, 1997
- genreCitromicrobium
- genreLutibacterium
- genreNovosphingobium
- genreSandaracinobacter
- genreSandarakinorhabdusGich & Overmann, 2006
- genreSphingobiumTakeuchi, Hamana & Hiraishi, 2001
- genreSphingomonas
- genreSphingopyxis
- genreSphingosinicella
Liste des genres et non classés
[modifier|modifier le code]- genreBlastomonas
- genreCitromicrobium
- genreHephaestia
- genreKaistobacter
- genreLutibacterium
- genreNovosphingobium
- Novosphingobium acidiphilum
- non-classéNovosphingobium acidiphilum DSM 19966
- Novosphingobium aquaticum
- Novosphingobium aromaticivorans
- Novosphingobium barchaimii
- non-classéNovosphingobium barchaimii LL02
- Novosphingobium capsulatum
- non-classéNovosphingobium capsulatum NBRC 12533
- Novosphingobium fuchskuhlense
- Novosphingobium hassiacum
- Novosphingobium indicum
- Novosphingobium lentum
- non-classéNovosphingobium lentum NBRC 107847
- Novosphingobium lindaniclasticum
- non-classéNovosphingobium lindaniclasticum LE124
- Novosphingobium mathurense
- Novosphingobium naphthalenivorans
- Novosphingobium nitrogenifigens
- Novosphingobium panipatense
- Novosphingobium pentaromativorans
- non-classéNovosphingobium pentaromativorans US6-1
- Novosphingobium resinovorum
- Novosphingobium rosa
- non-classéNovosphingobium rosa NBRC 15208
- Novosphingobium sediminicola
- Novosphingobium soli
- Novosphingobium stygium
- Novosphingobium subterraneum
- non-classéNovosphingobium subterraneum NBRC 16086
- Novosphingobium taihuense
- Novosphingobium tardaugens
- non-classéNovosphingobium tardaugens NBRC 16725
- Novosphingobium yangbajingensis
- Novosphingobium acidiphilum
- genreParasphingopyxis
- genrePolymorphobacter
- genreSandaracinobacter
- genreSandarakinorhabdus
- genreSphingobium
- Sphingobium abikonense
- non-classéSphingobium abikonense NBRC 16140
- Sphingobium amiense
- non-classéSphingobium amiense NBRC 102518
- Sphingobium aromaticiconvertens
- Sphingobium baderi
- non-classéSphingobium baderi LL03
- Sphingobium boeckii
- Sphingobium chinhatense
- non-classéSphingobium chinhatense IP26
- Sphingobium chlorophenolicum
- non-classéSphingobium chlorophenolicum L-1
- non-classéSphingobium chlorophenolicum NBRC 16172
- Sphingobium chungbukense
- Sphingobium cloacae
- non-classéSphingobium cloacae NBRC 102517
- Sphingobium cupriresistens
- Sphingobium czechense
- non-classéSphingobium czechense LL01
- Sphingobium estrogenivorans
- Sphingobium faniae
- Sphingobium fontiphilum
- Sphingobium francense
- Sphingobium fuliginis
- non-classéSphingobium fuliginis ATCC 27551
- Sphingobium herbicidovorans
- non-classéSphingobium herbicidovorans NBRC 16415
- Sphingobium indicum
- non-classéSphingobium indicum B90A
- Sphingobium japonicum
- non-classéSphingobium japonicum BiD32
- non-classéSphingobium japonicum UT26S
- Sphingobium gian gsuense
- Sphingobium lactosutens
- non-classéSphingobium lactosutens DS20
- Sphingobium limneticum
- Sphingobium lucknowense
- non-classéSphingobium lucknowense F2
- Sphingobium olei
- Sphingobium qiguonii
- Sphingobium quisquiliarum
- non-classéSphingobium quisquiliarum P25
- Sphingobium rhizovicinum
- Sphingobium scionense
- Sphingobium suberifaciens
- non-classéSphingomonas suberifaciens NBRC 15211
- Sphingobium sufflavum
- Sphingobium ummariense
- non-classéSphingobium ummariense RL-3
- Sphingobium vermicomposti
- Sphingobium vulgare
- Sphingobium wenxiniae
- Sphingobium xenophagum
- non-classéSphingobium xenophagum NBRC 107872
- non-classéSphingobium xenophagum QYY
- Sphingobium yanoikuyae
- non-classéSphingobium yanoikuyae ATCC 51230
- non-classéSphingobium yanoikuyae XLDN2-5
- Sphingomonas agrestis
- Sphingobium sp.R5-6
- Sphingobium abikonense
- genreSphingomicrobium
- genreSphingomonas
- Sphingomonas abaci
- Sphingomonas adhaesiva
- non-classéSphingomonas adhaesiva NBRC 15099
- Sphingomonas aerolata
- Sphingomonas aestuarii
- non-classéSphingomonas aestuarii DSM 19475
- Sphingomonas alpina
- Sphingomonas anadarae
- Sphingomonas aquatilis
- non-classéSphingomonas aquatilis NBRC 16722
- Sphingomonas asaccharolytica
- non-classéSphingomonas asaccharolytica NBRC 15499
- Sphingomonas astaxanthinifaciens
- Sphingomonas aurantiaca
- Sphingomonas azotifigens
- non-classéSphingomonas azotifigens NBRC 15497
- Sphingomonas azotofornans
- Sphingomonas bosoensis
- Sphingomonas canadensis
- Sphingomonas changbaiensis
- non-classéSphingomonas changbaiensis NBRC 104936
- Sphingomonas cynarae
- Sphingomonas desiccabilis
- Sphingomonas dokdonensis
- Sphingomonas echinoides
- non-classéSphingomonas echinoides ATCC 14820
- Sphingomonas elodea
- non-classéSphingomonas elodea ATCC 31461
- Sphingomonas endophytica
- Sphingomonas faeni
- Sphingomonas fennica
- Sphingomonas formosensis
- Sphingomonas genosp 1
- Sphingomonas genosp 2
- Sphingomonas ginsenosidimutans
- Sphingomonas ginsenosidivorax
- Sphingomonas glacialis
- Sphingomonas haloaromaticamans
- Sphingomonas hankookensis
- Sphingomonas histidinilytica
- Sphingomonas humi
- Sphingomonas hunanensis
- Sphingomonas indica
- Sphingomonas insulae
- Sphingomonas japonica
- Sphingomonas jaspsi
- non-classéSphingomonas jaspsi DSM 18422
- Sphingomonas jejuensis
- Sphingomonas jinjuensis
- Sphingomonas kaistensis
- Sphingomonas koreensis
- non-classéSphingomonas koreensis NBRC 16723
- Sphingomonas kwangyangensis
- Sphingomonas kyungheensis
- Sphingomonas laterariae
- Sphingomonas leidyi
- Sphingomonas mali
- non-classéSphingomonas mali NBRC 15500
- Sphingomonas mathurensis
- Sphingomonas melonis
- non-classéSphingomonas melonis C3
- non-classéSphingomonas melonis DAPP-PG 224
- non-classéSphingomonas melonis FR1
- Sphingomonas molluscorum
- Sphingomonas mucosissima
- Sphingomonas oligophenolica
- Sphingomonas oryziterrae
- Sphingomonas panni
- Sphingomonas parapaucimobilis
- non-classéSphingomonas parapaucimobilis NBRC 15100
- Sphingomonas paucimobilis
- non-classéSphingomonas paucimobilis NBRC 13935
- Sphingomonas phyllosphaerae
- non-classéSphingomonas phyllosphaerae 5.2
- non-classéSphingomonas phyllosphaerae FA2
- Sphingomonas pituitosa
- non-classéSphingomonas pituitosa NBRC 102491
- Sphingomonas polyaromaticivorans
- Sphingomonas pruni
- non-classéSphingomonas pruni NBRC 15498
- Sphingomonas pseudosanguinis
- Sphingomonas rhizogenes
- Sphingomonas rosea
- Sphingomonas roseiflava
- Sphingomonas rubra
- Sphingomonas sanguinis
- non-classéSphingomonas sanguinis NBRC 13937
- Sphingomonas sanxanigenens
- non-classéSphingomonas sanxanigenens DSM 19645
- Sphingomonas soli
- non-classéSphingomonas soli NBRC 100801
- Sphingomonas starnbergensis
- Sphingomonas swuensis
- Sphingomonas trueperi
- non-classéSphingomonas trueperi NBRC 100456
- Sphingomonas ursincola
- Sphingomonas wittichii
- non-classéSphingomonas wittichii DP58
- non-classéSphingomonas wittichii RW1
- non-classéSphingomonas wittichii TTN3
- non-classéSphingomonas wittichii TTNP3
- Sphingomonas xin gian gensis
- Sphingomonas yabuuchiae
- Sphingomonas yunnanensis
- genreSphingopyxis
- Sphingopyxis alaskensis
- non-classéSphingopyxis alaskensis RB2256
- Sphingopyxis baekryungensis
- non-classéSphingopyxis baekryungensis DSM 16222
- Sphingopyxis bauzanensis
- Sphingopyxis chilensis
- Sphingopyxis flavimaris
- Sphingopyxis ginsengisoli
- Sphingopyxis granuli
- non-classéSphingopyxis granuli NBRC 100800
- Sphingopyxis indica
- Sphingopyxis italica
- Sphingopyxis litoris
- non-classéSphingopyxis litoris DSM 22379
- Sphingopyxis macrogoltabida
- non-classéSphingopyxis macrogoltabida NBRC 15033
- Sphingopyxis marina
- non-classéSphingopyxis marina DSM 22363
- Sphingopyxis panaciterrae
- Sphingopyxis panaciterrulae
- Sphingopyxis rigui
- Sphingopyxis soli
- Sphingopyxis taejonensis
- Sphingopyxis terrae
- non-classéSphingopyxis terrae NBRC 15098
- Sphingopyxis ummariensis
- Sphingopyxis witflariensis
- Sphingopyxis wooponensis
- Sphingopyxis alaskensis
- genreSphingorhabdus
- genreSphingosinicella
- genreStakelama
- genreZymomonas
- Zymomonas mobilis
- sous-espèceZymomonas mobilissubsp.francensis
- sous-espèceZymomonas mobilissubsp.mobilis
- sous-espèceZymomonas mobilissubsp.mobilis ATCC 10988
- sous-espèceZymomonas mobilissubsp.mobilis ATCC 29191
- sous-espèceZymomonas mobilissubsp.mobilis ATCC 31822
- sous-espèceZymomonas mobilissubsp.mobilis IRMH52
- sous-espèceZymomonas mobilissubsp.mobilis NCIMB 11163
- sous-espèceZymomonas mobilissubsp.mobilis NRRL B-12526
- sous-espèceZymomonas mobilissubsp.mobilis str. CP4 - NRRL B-14023
- sous-espèceZymomonas mobilissubsp.mobilis ZM4 - ATCC 31821
- sous-espèceZymomonas mobilissubsp.pomaceae
- sous-espèceZymomonas mobilissubsp.pomaceae ATCC 29192
- Zymomonas mobilis
Notes et références
[modifier|modifier le code]- (en)YoshimasaKosako,EikoYabuuchi,TakashiNakaet NagatoshiFujiwara,«Proposal ofSphingomonadaceaeFam. Nov., Consisting ofSphingomonasYabuuchi et al. 1990,ErythrobacterShiba and Shimidu 1982,ErythromicrobiumYurkov et al. 1994,PorphyrobacterFuerst et al. 1993,ZymomonasKluyver and van Niel 1936, andSandaracinobacbacterYurkov et al. 1997, with the Type GenusSphingomonasYabuuchi et al. 1990»,Microbiology and Immunology,vol.44,no7,,p.563–575(DOI10.1111/j.1348-0421.2000.tb02535.x,lire en ligne,consulté le)
- (en)«Sphingomonadaceae», surList of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature (LPSN)(consulté le).
- (en)Garrity, George M.; Brenner, Don J.; Krieg, Noel R.; Staley, James T.,The Proteobacteria, Part C: The Alpha-, Beta-, Delta-, and Epsilonproteobacteria,New York, Springer,,1388p.(ISBN978-0-387-24145-6,lire en ligne),«Bergey's Manual of Systematic Bacteriology,Volume Two: ».
- (en)David L. Balkwill, J. K. Fredrickson et M. F. Romine,The Prokaryotes, A Handbook of the Biology of Bacteria,t.7,Proteobacteria: Delta and Epsilon Subclasses. Deeply Rooting Bacteria,,1074p.(ISBN978-0-387-33493-6),«Sphingomonas and Related Genera ».
- Catalogue of Life Checklist,consulté le 15 août 2014
- World Register of Marine Species,consulté le 15 août 2014
- NCBI,consulté le 15 août 2014
Liens externes
[modifier|modifier le code]- (en)RéférenceCatalogue of Life:Sphingomonadaceae(consulté le)
- (en)RéférenceNCBI:Sphingomonadaceae(taxons inclus)(consulté le)
- (en)RéférenceWoRMS:Sphingomonadaceae(+ liste genres+ liste espèces)(consulté le)