Aller au contenu

Taxonomie

Un article de Wikipédia, l'encyclopédie libre.
(Redirigé depuisTaxonomique)

Taxinomie

Page d’aide sur l’homonymie

Pour les articles homonymes, voirTaxonomie (homonymie).

Taxonomie
Laclassification classiquedu vivant classe les êtres vivants selon une hiérarchie de groupes de plus en plus vastes (de haut vers le bas).
Partie de
Typologie(d)Voir et modifier les données sur Wikidata
Pratiqué par
Taxonomiste(d)Voir et modifier les données sur Wikidata

modifier-modifier le code-modifier WikidataDocumentation du modèle

Lataxonomieoutaxinomieest une branche dessciences naturellesqui a pour objet l'étude de la diversité du monde vivant. Cette activité consiste à décrire et circonscrire en termes d'espèceslesorganismes vivantset à les organiser en catégories hiérarchisées appeléestaxons.Elle doit proposer des outils et des méthodes permettant de les identifier (notamment grâce auxclés de détermination). La reconnaissance par la communauté scientifique de ces catégories repose sur la pertinence de leurdescription,l'attribution d'unnomet leurclassementau sein du Vivant[1].La taxonomie contemporaine repose désormais sur une conception fondamentalement évolutive (approche notamment permise grâce à l'essor de la biologie moléculaire[2]au cours de la seconde moitié duXXesiècle), via le recours à lagénétique des populationspour en mettre en évidence l'existence de nouvelles espèces, ou aux analysesphylogénétiquespourclasserces dernières.

Par extension, le termetaxonomieest désormais utilisé dans d'autres sciences, telles que lessciences humaines et sociales,lessciences de l'informationou l'informatique.

Alpha-taxonomie et beta-taxonomie

[modifier|modifier le code]

Deux branches de la pratique taxonomique, travaillant à des échelles différentes et présentant des finalités bien distinctes, peuvent être identifiées[3],[4]:

  • d’une part, l’Alpha -taxonomie(ou microtaxonomie) consiste à identifier et caractériser lesunités catégorielles élémentaires(les espèces vivantes ou éteintes), afin d’établir uninventaire du Vivanten espèces. Dans la pratique, les enjeux du travail taxonomique consistent essentiellement à analyser le polymorphisme au sein du taxon étudié afin de déterminer si les différences constatées entre les groupes qui le composent correspondent à des espèces distinctes (ex.:loup, chacal, coyote…) et à décrire les espèces non encore connues de la science ainsi mises en évidence, ou si au contraire, ces différences observées ne représentent que de la variabilité au sein d'une seule et même espèce d'un point de vue biologique (ex.:Chihuahua, Berger allemand, Bulldog);
  • d’autre part, labeta-taxonomie(ou macrotaxonomie), vise quant à elle à classer ces espèces précédemment décrites les unes par rapport aux autres, c’est-à-dire à produire uneclassification du Vivant,en attribuant chacune d’elles à des rangs supérieurs, eux-mêmes hiérarchisés les uns par rapport aux autres (ex.:l'espèce du chien,Canis lupus,appartient au genreCanis,qui appartient à la famille des Canidés, qui elle-même appartient à la classe des Mammifères,etc.).

Étymologie et usage du mot

[modifier|modifier le code]

Sur les autres projets Wikimedia:

Le mottaxinomieprovient dugrecτάξις(taxis) « placement », « classement », « ordre » et deνομός(nomos) qui signifie « loi », « règle »)[5].Le terme fut créé en1813,sous la graphie detaxonomie,par le botaniste suisseAugustin Pyrame de Candolle(1778-1841) dans saThéorie élémentaire de la botanique ou exposition des principes de la classification naturelle et de l'art de décrire et d'étudier les végétaux[6],pour désigner dans sa « théorie des classifications » à la fois la méthode et ce qu'il a qualifié de « bases de la botanique philosophique » (Mémoires et souvenirs,Livre III, § 11[7]).

Dans la seconde édition publiée en 1819[8],il considérait la graphie du mottaxonomieincorrecte dans sa forme originale en mentionnant:« Il serait plus exact de dire Taxéonomie; mais j'ai cru devoir admettre la suppression de l’e,pour rendre le mot plus court »[9].Cela montre que De Candolle a en réalité fait dériver son termetaxonomie,non pas dunominatifτάξις(taxis) mais de songénitifτάξεως(taxeôs)[10].

Le termetaxonomieest entériné en 1836 dans leSupplément auDictionnaire de l'Académie française[11].

La graphietaxinomieétait recommandée en 1864[12].Émile Littré,dans sonDictionnaire de la langue française(version 1872-1877)[13]précisait que le mottaxinomieoutaxionomiepouvait aussi être utilisé, formé sur l'étymon grectaxis(l'ordre). LeGrand dictionnaire terminologique,auQuébec,confirme que « taxinomie » est recommandé par plusieurs auteurs considérant « taxonomie » comme « un calque de l'anglaistaxonomy», ce qui est pourtant historiquement faux. En effet,taxonomyn'apparait en anglais qu'en 1819 sous l'influence du français, soit six ans après qu'il a été inventé par De Candolle[14].Des dictionnaires français continuent cependant à répandre cette erreur[15]que la graphietaxonomie(De Candolle, 1813) correspondrait à l'anglaistaxonomy[16].Au contraire, la plupart des dictionnaires anglais affirment correctement que le mottaxonomydérive du français[17],et, pour leTLFI,l'anglaistaxonomyest apparu seulement en 1828 dans le dictionnaire américainWebster's[18].

Le terme de taxonomie ne dérive pas du mot taxon, ce dernier étant un concept apparu plus tardivement (mot créé par le botanisteHerman Johannes Lamen1948[19]). Ainsi, la taxonomie n'est pas, étymologiquement, l'étude des taxons mais bien les lois sur l'ordre, donc les règles de laclassification.Certains spécialistes font une différence dans l'usage, particulièrement enbotanique,entre lataxinomiequi, formée sur l'étymon grecnómos(loi, règle), concerne les questions de classification, et lataxonomiequi, formée sur l'étymon grecónoma(nom), se rapporte aux questions denomenclature[20],[21].D'autres savants font usage du termetaxionomiedans leur activité, particulièrement enzoologie,pour nommer les groupes d'êtres vivants[22],[23],[24],[25].Cependant, le mot taxonomie est aussi et très souvent utilisé pour nommer la science de la description des taxons. Même les auteurs prônant l'usage du terme « taxinomie » ne parlent pas de « taxins » mais de taxons, à l'exception toutefois d'un spécialiste enentomologieinvoquant la diffusionfrancophonedes connaissances et déplorant l'influence de l'anglais[26].Les autres langues utilisent des termes similaires à « taxonomie », pas « taxinomie »; ainsi, on écritTaxonomieen allemand,taxonomyen anglais,taxonomíaen espagnol (castillan),taxonomiaen portugais et en catalan,tassonomiaen italien,таксономия(taksonomiya) en russe, etc.[27].

En 1957, en France, l'Académie des sciencesadopte le nom de « Taxinomie » pour désigner la science de la classification[28].

Notons que, dans la pratique, le terme « taxonomie » peut aussi désigner la méthode utilisée (on parlera par exemple de « taxonomie moléculaire ») que le résultat obtenu avec cette méthode (la « taxonomie desAgaricales»).

Le terme est devenu d’usage courant auXXIesiècle, soit dans la graphie originale, taxonomie[29],[30],même si celle-ci est étymologiquement contestée[31],[32],[33],[34],[35]voire considérée comme fautive[36],soit sous la graphie corrigée parÉmile Littré,taxinomie avec un « i »[37],[38],[39],[40],[41],[42],même si cette dernière est sciemment réfutée[43].Le remplacement du « o » par un « i » est perçu par certains comme dupurisme,qui lui préfèrent le terme « taxonomie », en faisant valoir un usage majoritaire, la cohérence et un « principe de priorité »[43],[44],[45],[46],[15],[10].

Définition selon le code de nomenclature zoologique

[modifier|modifier le code]

Le mot « taxonomie » est employé dans les appendices duCode international de nomenclature zoologiquebilingue(publié enfrançaiset enanglais) en 1961 pour la première édition[47]et en 1964 pour la deuxième édition[48].

Le texte en français de la troisième édition duCode international de nomenclature zoologique(1985) mentionne le terme « taxonomie ». Dans leglossaire,la « taxonomie » est définie comme étant « La théorie et la pratique de la classification des organismes; partie de la systématique, l'étude des catégories d'organismes et de leur diversité »[49].

Le texte en français de la quatrième édition duCode international de nomenclature zoologique(1999) mentionne les deux termes « taxinomie » et « taxonomie ». Dans le glossaire, la « taxinomie ou taxonomie » est définie comme étant la « Théorie et pratique de la classification des organismes »[50].

Différences entre taxonomie et systématique

[modifier|modifier le code]

Enbiologie,taxonomie etsystématiquesont deux disciplines étroitement liées et souvent confondues[36].La systématique étant définie comme l'étude de la diversité et des relations évolutives entre les organismes vivants ou fossiles[10].Elle implique deux approches complémentaires que sont laphylogénétique,c'est-à-dire la discipline s'intéressant à la reconstruction de l'arbre du vivant,et la taxonomie qui produit des classifications formelles. La manière dont la taxonomie doit prendre en compte les résultats de la phylogénétique fut d'ailleurs par le passé source de vives controverses méthodologiques et épistémologiques[51],[52],[53],[54].

In fine, ces deux disciplines, taxonomie et systématique, ne diffèrent pas tant sur leurs méthodes ou leurs concepts que sur leurs intentions[55]:ainsi, dans son usage contemporain, la systématique cherche davantage àdonner du sens à la structure du vivant,c’est-à-dire à retracer son histoire évolutive afin de comprendre ses mécanismes de diversification à travers l’espace et le temps, tandis que la taxonomie vise à produireun modèle simplifié de la structure du Vivant qui puisse être directement exploitable (notamment par les systématiciens) à travers un système de communication performant(description et inventaire des espèces, classification dans des rangs supérieurs,etc.). Dans la pratique, la distinction entre ces deux finalités tend cependant à s’estomper, au fur et à mesure les pratiques taxonomiques contemporaines incorporent de plus en plus le cadre interprétatif et méthodologique de la systématique évolutive et de la génétique des populations[3],[4].Ainsi sont elles bien souvent pratiquées simultanément par les mêmes chercheurs. Les taxonomistes ont de tout temps été nommés systématiciens, car après avoir étudié et décrit des organismes, ils ont tout naturellement essayé de les classer à partir du bas niveau desespèces(Alpha taxonomyou « taxonomie primaire »).

Ceux qui utilisent surtout le sens de méthode (lesphylogénéticiensnotamment) nomment souvent le résultat « classification », ou parfois « taxonomie » par abus de langage, surtout dans les disciplines non biologiques (voirTaxonomie (homonymie)).

Historique et évolution des modèles

[modifier|modifier le code]

Avant Linné

[modifier|modifier le code]

La première classification des végétaux est généralement attribuée àThéophrasteà la fin duIVesiècleav. J.-C.,même si sonHistoire des plantesreprend en partie des théories de l'École pythagoricienne.Le premier classificateur connu des animaux futAristote,dans le traitéHistoire des animaux.Celui qui est traditionnellement présenté comme le « père de la science », emprunte la distinction àDémocriteen divisant les animaux en deux classes, ceux qui ont du sang et ceux qui n'en ont pas (animaux à sang blanc ou incolore qu'il nomme lymphe). Il sous-divise les animaux à sang rouge en cinq classes (quadrupèdes vivipares, cétacés, oiseaux, quadrupèdes ovipares et poissons) et les animaux à sang blanc en quatre (mollusques,testacés,crustacés et insectes)[56].Aristote subdivisa également les animaux en de nombreux taxons plus petits, qui forment peut-être une première taxonomie zoologique[57],[58],[59].

Carl von Linné

[modifier|modifier le code]

LenaturalistesuédoisCarl von Linné(1707-1778) posa les fondations de la nomenclature binominale, et fut l'auteur de deux publications fort influentes en biologie jusqu'à aujourd'hui, à savoir leSystema naturaeet leSpecies Plantarum[60],[61].

Augustin de Candolle

[modifier|modifier le code]
Portrait gravé d'Augustin Pyrame de CandolleparAmbroise Tardieu.

Bien que, comme la méthode deJussieu,elle utilise lesnoms binominauxet préconise la « méthode naturelle » opposée au « système artificiel » deCarl von Linné,la taxonomie proposée parde Candolle[62]s'en écarte par l'importance donnée aux coupures. Alors que pour Linné et Jussieu, la nature «ne fait pas de saut», de Candolle insiste sur les discontinuités qui sont à la base de la notion detaxon,à la foisentitéetcoupure[63].

La révolution darwinienne

[modifier|modifier le code]

Dans lasystématiqueclassique (parfois dite « linnéenne »), l'ordre hiérarchique interne destaxonsétait fondé à l'origine sur des critères de ressemblance « morphologique » et d'affinités supposées[a].Bien que fortementanthropocentriqueet reflétant des causes de ladiversité des êtres vivants(decréation divine) telles qu’on les concevait voici 250 ans, elle fait encore, en ce début duXXIesiècle,partie du bagage culturel commun de tous les naturalistes. Mais par la suite, au fur et à mesure de l'avancée des connaissances, notamment à partir des travaux deLamarcketDarwin,cet ordre a rapidement voulu donner par surcroît une image de l'évolution[64].

L’anthropocentrisme fut battu en brèche parCharles Darwin,qui recommande dansL'Origine des espèces[65]en1859une classification exclusivementgénéalogique.Les espèces y sont classées selon leur degré d’apparentement évolutif[66].Mais il faudra attendre près d’un siècle pour que l'élimination des taxonspolyphylétiquesdevienne consensuelle. Par contre, des interprétations divergentes du terme « généalogique » chez Darwin, comme ladistance patristiqueou comme la récente relative dudernier ancêtre commun,a donné naissance à deux courants conceptuels opposés en taxinomie: l'évolutionnismeet lecladisme.

Développements modernes

[modifier|modifier le code]

Dans la deuxième moitié duXXesiècle,la systématique ditephylogénétiques'est développée à partir d'une méthode de reconstruction qui a connu un développement foudroyant: lacladistique,initiée parWilli Hennigen1950[67].Cette méthode est fondée globalement sur des relations évolutives pour laquelle le critère fondamental du choix de la classification est qu'elle doit refléter strictement la phylogénie, c'est-à-dire les degrés d’apparentement entre espèces. La notion même d'une telle phylogénie est une conséquence de lathéorie de l'évolution,et le succès prédictif desarbres phylogénétiquesune des preuves de cette théorie[68].

D'importants progrès engénomiqueont été permis par l'analyse génétiqueautomatique et le développement des outils et modèles informatiques. Ils imposent et permettent la redéfinition de certaines espèces ou groupes d'espèces et permettraient une meilleure connaissance et suivi des espèces.

Principes communs et différences

[modifier|modifier le code]

Toutes lesclassificationsactuelles se présentent sous la forme d'unarbre(classement arborescent), depuis une racine incluant tous les êtresvivantsexistants ou ayant existé, jusqu'auxindividus.Chaque nœud de l'arbre définit untaxon,qui groupe tous les sous-taxons qu'engendre le nœud.

La notion d'espèce

[modifier|modifier le code]

La notion d'espèceest fondamentale en taxonomie, car elle constitue l'unité élémentaire de la classification du Vivant. Ce concept catégoriel est relativement bien défini, du moins pour les espèces àreproduction[69],[70].

Il existe différentes définitions du concept d'espèce. Celle visant à reconnaître les espèces comme des communautés d'êtres vivants interféconds (ouinterfertiles,capables de se reproduire entre eux) est une des plus répandues. Les espèces sont alors assimilées à des pools d'individus pouvant échanger du matériel génétique et produisant des descendants eux-mêmes féconds (en effet, certains individus du mêmegenremais appartenant à des espèces différentes peuvent se croiser pour donner un individuhybride,mais celui-ci est le plus souvent stérile)[69].Dans le cas de la multiplication strictementasexuée,on parle abusivement d'espèces à la place delignée,le groupement étant alors purementphylogénétique.Le cas des entités à la limite du vivant (virus,prions) est encore différent; elles sont en général exclues des classifications. Une autre difficulté à citer est celle dessymbiosesstrictes, comme leslichens(qui combinent un organisme de nature fongique, et un organisme capable de photosynthèse, de nature végétale), mais en général, un des deux partenaires est capable de vivre sans s'associer à l'autre, et l'on peut les classer dans deux espèces distinctes, avec comme caractéristique d'une des deux espèces de ne pouvoir survivre sans l'autre[71].

La description d'unenouvelle espècepar un taxonomiste est assimilable à une hypothèse formulée en fonction des connaissances du moment, sur la base des données et des outils d’analyse disponibles. Cette description peut être remise en question par un autre spécialiste, soit parce qu'il ne s’appuie pas sur la mêmeconceptionde ce qu'est une espèce, soit parce qu'il dispose de nouveaux éléments (nouvelles analyses, échantillonnage plus riche) ou a procédé à de nouvelles méthodes analytiques[72].

Emploi du binôme latin

[modifier|modifier le code]
Articles détaillés:Nom binominaletRang taxonomique.

Les espèces sont nommées selon lesystème binominalutilisé pour la première fois parGuillaume RondeletetPierre BelonauXVIesiècle[73]et généralisé parCarl von Linnéau cours duXVIIIesiècle.Le nom scientifique d'une espèce est la combinaison de deux motsréputéslatins (trois motsen zoologie), pour une sous-espèce, variété ou forme, généralement composés enitaliques:un nom de genre, suivi d'une ou deux épithètes spécifiques.

Au-dessous du rang de genre, tous les noms de taxons sont appelés combinaisons. On distingue plusieurs catégories de combinaisons:

  • entre genre et espèce (sous-genre, section, sous-section, série, sous-série, etc.), les combinaisons sont infragénériques etbinominales:nom de genre, puis après indication du rang, une épithète infragénérique, par exemple lecèpeappartient à la section «Boletussect.Edulis»;
  • au rang d'espèce, les combinaisons sont spécifiques etbinominales;
  • au-dessous de l'espèce, les combinaisons sont infraspécifiques ettrinominalesen zoologie.

Approche phylogénétique

[modifier|modifier le code]
Comparaison entre classifications classique et phylogénétique. Dans cette dernière, le groupe des poissons n'existe plus et leCœlacantheest plus proche deshumainsque de latruite.

L'approchephylogénétiqueactuelle fait appel aux données de lacladistique,mais ses exigences se résument à n'accepter que des taxonsmonophylétiques,c'est-à-dire correspondant à uncladedonné. Elle demande que les taxons soient limités à ceux qui respectent les deux conditions suivantes:

  • tous les individus du taxon descendent d'un individu ancestral particulier;
  • tous les descendants de cet ancêtre particulier sont dans le taxon.

On parle alors seulement de taxon monophylétique ou clade[74].Cette contrainte a amené des modifications fondamentales de la classification scientifique, certaines renversant le « sens commun » modelé par l'héritage culturel. Ainsi, lesdinosauresn'ont pasdisparu,la systématique moderne incluant lesoiseauxdans le groupement « dinosaures ».

Parmi d'autres exemples, les taxons traditionnels commereptiles,poissons,algues,dicotylédones,pongidés,n'ont pasdroit de citéen systématique phylogénétique, car considérés polyphylétiques (origines multiples) ou paraphylétiques (incomplets) (dicotylédonesa été remplacé pardicotylédones vraies). D'autres ont survécu avec quelques séquelles, commechampignons.Enfin, certains ont surmonté la tempête, commeanimal(métazoaires) oumammifères.Remarquons qu'il n'y avait rien d'évident à ce que tous les animaux multicellulaires partagent un ancêtre commun qui les sépare de tout végétal ou champignon.

À part cela, sa structure reste fondamentalement de type linnéen et sanomenclature(c'est-à-dire les dénominations elles-mêmes) également.

Il y a plusieurs approches techniques pour élaborer les arbres phylogénétiques.

  • L'approchecladistiquecherche en particulier à déterminer les caractères propres à une branche, qui « signent » un apparentement.
  • L'approchephénétique,une classification basée uniquement sur des mesures de distance entre taxons (évaluées par exemple en comptant les différences de séquences d'ADN) sans chercher à faire une interprétation phylogénétique.
  • L’approche probabiliste qui construit des arbres phylogénétiques en utilisant des modèles d’évolution des caractères (le plus souvent moléculaires, mais pas obligatoirement).

Selon les publications, on trouve à ce jour des classifications de tout type, depuis la classification traditionnelle à peine remaniée, jusqu'aux classifications strictementcladistessansrangs taxonomiquesen passant par différents mélanges, par exemple gardant lesrangs taxonomiquesmais s'alignant sur lesclades,ou encore des méthodes de traitement post-phylogénétique faisant ressortir automatiquement lesgrades évolutifs[75].

Évolution des pratiques

[modifier|modifier le code]

Les pratiques taxonomiques évoluent vers unescience intégrative[76]en articulant la collecte de spécimens sur le terrain, dans diverses parties du monde, avec un travail de description enlaboratoire,associant les approches traditionnelles (morphologie,écologie,etc.), et les méthodes moléculaires plus récentes (barcoding moléculaire[77])[42],[30].

Les progrès de lagénétiqueet de labioinformatiqueont contribué à de considérables avancées au cours des dernières décennies. Elles se traduisent par de fréquentes révisions, descriptions de nouveaux taxons et mises à jour de leur contenu. Les publications qui en découlent s'inscrivent davantage dans des modes alternatifs de publication scientifique[78],plus coopératifs[79]et réactifs.

De plus, l'étude de la biodiversitébactérienne,ou des espècesmicrobiennesdusolou desocéans,est complexe et nécessite - outre de nouveaux moyens enmétagénomique(barcoding de l'ADN microbien) - une collaboration entre de nombreux spécialistes répartis dans le monde entier.

Les naturalistes ont développé des outils de travail collaboratif et de partage avec par exempleTela botanica(pour lesbotanistes) et plus récemment l'European Journal of Taxonomy(EJT[80]). C'est une revue scientifique internationale de taxinomie descriptive, soutenue par un Consortium EJT (demusées d’histoire naturelleet dejardins botaniques)[81],publiée en anglais, en format électronique, enlicence Open Access,en licenceCreative Commons(3.0), c'est-à-dire en accès libre, à publication gratuite et consultation gratuite. Elle traite des domaines de lazoologie,entomologie,botaniqueetpaléontologie.Les articles sont des travaux originaux, devant répondre à des critères de haute qualité en termes de contenu scientifique et de forme (style, illustrations, etc.). La revue est européenne, mais les sujets peuvent concerner toutes les espèces, quel que soit leur pays d'origine. Les révisions taxonomiques, monographies et articles thématiques ou d'opinion pourront ainsi être mieux et plus rapidement partagés.

Dans le contexte de la décolonisation et de la lutte contre le racisme et le sexisme, un plaidoyer s'élève en 2024 pour la mise en place d'un comité pour la révision des noms posant des problèmes éthiques[82].

Notes et références

[modifier|modifier le code]

Notes

[modifier|modifier le code]
  1. ↑Voir aussi la section "Histoire de la Mycologie"

Références

[modifier|modifier le code]
  1. ↑Dr Sabah CHERMAT, «Introduction à la systématique C 1: Botanique Pharmaceutique 2eAnnée Pharmacie»[PDF],suruniv.ency-education,Sétif,UFAS1,2018-2019(consulté le).
  2. ↑Lecointre, Guillaume (1964-…),Visset, Dominique,Bosquet, GillesetCharrier, David,Classification phylogénétique du vivant,t.2, Paris,Belin,831p.(ISBN978-2-410-00385-7et2-410-00385-0,OCLC987914329)
  3. ↑aetb(en)Peter D.Ashlock,Principles of systematic zoology,McGraw-Hill,(ISBN0-07-041144-1,978-0-07-041144-9et0-07-112701-1,OCLC22006028)
  4. ↑aetbSpichiger, Rodolphe-Edouard (1946-…)etJeanmonod, Daniel,Botanique systématique: avec une introduction aux grands groupes de champignons,Lausanne,Presses polytechniques et universitaires romandes,,448p.(ISBN978-2-88915-134-9et2-88915-134-4,OCLC952555064).
  5. ↑Couplan, François,Dictionnaire étymologique de botanique,Delachaux et Niestlé,2006, ©2000(ISBN2-603-01410-2et978-2-603-01410-3,OCLC77564955)
  6. ↑1reéd., Paris, Déterville, 1813,p.19.[lire en ligne]
  7. ↑Augustin Pyrame de Candolle,Mémoires et souvenirs(1778-1841), éd. Alphonse de Candolle, Genève, Cherbuliez, 1862 — réédité en 2004 sous la direction Jean-Daniel Candaux et Jean-Marc Drouin avec le concours de Patrick Bungener et René Sigrist. Georg Éditeur (Chêne-Bourg, Genève), collection Bibliothèque d’histoire des sciences: xv + 591 p.(ISBN2-8257-0832-1).
  8. ↑2eéd., Paris, Deterville, 1819,p.20.[lire en ligne]
  9. ↑Charles Sauvage,« Taxinomie ou taxonomie »,Bulletin de laSociété Botanique de France,Vol.112,no3-4, 1965,p.180-182.DOI10.1080/00378941.1965.10838227
  10. ↑abetcDamienAubert,Classer le vivant: Les perspectives de la systématique évolutionniste moderne,Paris,Éditions Ellipses,,496p.[détail de l’édition](ISBN978-2-340-01773-3),« Lexique »,p.457
  11. ↑« taxonomie », dans F. Raymond,Supplément auDictionnaire de l'Académie française,Sixième édition publiée en 1835,Gustave Barba, libraire, Paris, 1836,p.780.lire en lignesurGallica.
  12. ↑« taxonomie et mieux taxinomie », dans Jean-François-Marie Bertet-Dupiney de Vorepierre,Dictionnaire français illustré et encyclopédie universelle,Tome Second: G-Z, Michel Lévy Frères, Libraires, Paris, 1864,p.1175.lire en lignesurGallica.
  13. ↑É. Littré,« taxinomie ou taxionomie », dansDictionnaire de la langue française,Tome Quatrième: Q-Z,Librairie Hachette et Cie,Paris, 1874,p.2158.lire en lignesurGallica.
  14. ↑Online Etymology Dictionary
  15. ↑aetbMarieD’Aoûst,«Taxinomie ou taxonomie? Quand l’usage s’emmêle»,Chroniques de langue, L’Actualité langagière,vol.2,no4,‎,p.12(lire en ligne)
  16. ↑« taxinomie », dansLe Grand Robert de la langue françaisedePaul Robert,Deuxième édition entièrement revue et enrichie parAlain Rey,Tome IX: Suc-Z,Dictionnaires Le Robert,Paris, 1985,p.188.(ISBN2-85036-100-3)
  17. ↑Taxinomiedans leGrand dictionnaire terminologiquede l’Office québécois de la langue française.
  18. ↑Informationslexicographiquesetétymologiquesde « taxinomie » dans leTrésor de la langue française informatisé,sur le site duCentre national de ressources textuelles et lexicales
  19. ↑(en)Herman Johannes Lam,"Proposal to indicate a taxonomic group of any rank with the term taxon (plural taxa)", inJoseph Lanjouw(ed.),Botanical nomenclature and taxonomy: A symposium organized by the International Union of Biological Sciences with support of UNESCO at Utrecht, the Netherlands, June 14-19, 1948,Chronica botanica,Vol.12, No.1-2, 1950,p.1-88;Series B:Colloquia,International Union of Biological Sciences,No.2, 1950,p.1-88.
  20. ↑Didier Normand et Raymonde Chatelet, «Sur le bois de quatre espèces africaines (Césalpiniacées, Ochnacée et Huacée)»,Journal d'agriculture tropicale et de botanique appliquée,vol.2, n°1-2, Janvier-février 1955,p.19-27.DOI10.3406/jatba.1955.2199
  21. ↑Jean-François Leroy,«Taxon, Taxonomie, querelle de mots? querelle de fond!»,Journal d'agriculture tropicale et de botanique appliquée,vol.5,no1-3, Janvier-février-mars 1958,p.73-176.DOI10.3406/jatba.1958.2456
  22. ↑GeorgesPasteur,«Taxinomie, taxionomie, systématique: trois termes, trois concepts»,Mammalia,Walter de Gruyter GmbH,vol.26,no2,‎,p.285-287(ISSN0025-1461,DOI10.1515/mamm.1962.26.2.280).
  23. ↑Marie-Louise Bauchot,Jacques Daget,Jean-Claude Hureau etThéodore Monod,"Le problème des « auteurs secondaires » en taxionomie",Bulletin duMuséum national d'histoire naturelle,tome 42,no2, 1970,p.301-304.[lire en ligne]
  24. ↑JacquesDaget,«Éditorial»,Cybium,Société française d'ichtyologie,3esérie,vol.1,no2,‎,p.3-6(ISSN0399-0974,lire en ligne)
  25. ↑ChristianLévêque(dir.) et DidierPaugy(dir.),« Taxinomie et systématique »,dansLes poissons des eaux continentales africaines: diversité, écologie, utilisation par l'homme,Paris,IRD Editions,,2eéd.(1reéd.1999), 564p.(ISBN2-7099-1589-8et978-2-7099-1589-2,lire en ligne[PDF]),p.105-133.
  26. ↑Remi Coutin, « Note de la rédaction à propos des deux articles précédents »,Insectes,Revue d'écologie et d'entomologie de l'Office pour les insectes et leur environnement,no97,2etrimestre 1995,p.24.[lire en ligne]
  27. ↑Fabien Raimbault, « Histoire des sciences: Remarques et réflexions en réaction à l'article d'Emmanuel Delfosse »,Insectes,Revue d'écologie et d'entomologie de l'Office pour les insectes et leur environnement,no97,2etrimestre 1995,p.23-24.[lire en ligne]
  28. ↑Académie des sciences,Comptes rendus hebdomadaires des séances de l'Académie des sciences,séance du,Tome 245, Paris, 1957,p.125-127.lire en lignesurGallica.
  29. ↑FrançoisRamade,Dictionnaire encyclopédique des sciences de la nature et de la biodiversité,Paris,Éditions Dunod,,1reéd.,viii + 726[détail de l’édition](ISBN978-2-10-049282-4),« Taxonomie (variante orthographique: taxinomie) »,p.636.
  30. ↑aetbChristopheTréhet,«La taxonomie, côté terrain»,Espaces naturels,no64,‎,p.45(ISSN1637-9896,lire en ligne).
  31. ↑(en)Georges Pasteur,"The Proper Spelling of Taxonomy",Systematic Biology,Vol.25, No.2, 1976,p.192-193.DOI10.2307/2412746
  32. ↑Marc Travers, « Sur quelques questions de terminologie scientifique »,La Banque des mots,no21,4etrimestre 1981,p.3-18.[lire en ligne]
  33. ↑Sur la controverse étymologique, voir: Fisher, Jean-Louis et Rey, Roselyne, « De l’origine et de l’usage des termes taxinomie-taxonomie », inDocuments pour l’histoire du vocabulaire scientifique (1983),vol. V,p.97-113.
  34. ↑Christine Tardieu,La bonne orthographe du mot taxinomie,PALEO, 22-2011, p. 331-334.
  35. ↑Michel Casevitz, « Taxi- ou Taxo-? »,Revue française d’Entomologie,N.S. 12 (1), 1990,p.26-28,republié par l'auteur,MichelCasevitz,«Chronique étymologique: Taxi- ou Taxo-?», surlaviedesclassiques.fr,(consulté le).
  36. ↑aetb«Glossaire progressif d'entomologie», surInsectes,OPIE(consulté le).
  37. ↑François Dagognet,« Taxinomie », dansEncyclopædia Universalis,Corpus 22:Tacite - Trust,Encyclopædia Universalis France S.A., Paris, octobre 1995,p.84-86.(ISBN2-85229-290-4)
  38. ↑Jean-Louis MorèreetRaymond Pujol,Dictionnaire raisonné de biologie,Paris, Frison-Roche,,1222p.[détail de l’édition](ISBN2-87671-300-4),« ArticleTaxinomie»,p.1136.
  39. ↑JacquesBerthet(préf.Christian de Duve,en collaboration avec Alain Amar-Costesec),Dictionnaire de Biologie,Bruxelles,De Boeck & Larcier,,1reéd.,vii + 1034[détail de l’édition](ISBN2-8041-2798-2),« Taxinomie »,p.853.
  40. ↑BernardBoullard,Dictionnaire de botanique,Paris,Éditions Ellipses,,398p.[détail de l’édition](ISBN2-7298-8845-4),article « Taxinomie ou taxonomie », p. 359.
  41. ↑« taxinomie (ou taxonomie) », dansGuillaume LecointreetHervé Le Guyader,Classification phylogénétique du vivant,Tome 2,4eédition (revue et augmentée),Belin,Paris, 2017,p.794.(ISBN978-2-410-00385-7)
  42. ↑aetbChristopheTréhet,«Profession: taxinomiste»,Espaces naturels,no63,‎,p.43(ISSN1637-9896,lire en ligne).
  43. ↑aetbMichel Boulard,« Taxi, Taxo, entomique et phéromone »,L'Entomologiste,tome 47, fasciculeno1, février 1991,p.53-56.[lire en ligne]
  44. ↑Tancoigne, E. (2011).Évaluer la santé de la taxonomie zoologique: histoire, méthodes et enjeux contemporains(Thèse de doctorat,Muséum national d'histoire naturelle-MNHN PARIS).[lire en ligne]
  45. ↑Aubert, D. (2016). Doit-on parler de « nomenclature binomiale » ou bien de « nomenclature binominale » ?La Banque des mots91, 7–14.[lire en ligne]
  46. ↑(en)Mayr, Ernst,«The proper spelling of taxonomy»,Systematic Zoology,no15,‎,p.88(lire en ligne)
  47. ↑(fr + en)1reédition(1961) duCINZ,sur le site de l’American Association for Zoological Nomenclature.
  48. ↑(fr + en)2eédition(1964) duCINZ,sur le site de l’American Association for Zoological Nomenclature.
  49. ↑(fr + en)3eédition(1985) duCINZ,sur le site de l’American Association for Zoological Nomenclature,p.293.
  50. ↑(fr + en)4eédition(1999) duCINZ,sur le site de l’American Association for Zoological Nomenclature,p.254.
  51. ↑(en)Ernst Mayr,"Cladistic analysis or cladistic classification?",Journal of Zoological Systematics and Evolutionary Research,Vol.12, No.1, September 1974,p.94-128.DOI10.1111/j.1439-0469.1974.tb00160.x
  52. ↑(en)Willi Hennig,"Cladistic Analysis or Cladistic Classification?: A Reply to Ernst Mayr",Systematic Zoology,Vol. 24, No.2, juin 1975,p.244-256.DOI10.2307/2412765
  53. ↑(en)JosephFelsenstein,«The Troubled Growth of Statistical Phylogenetics»,Systematic Biology,vol.50,no4,‎,p.465–467(ISSN1063-5157,lire en ligne,consulté le)
  54. ↑(en)MichelLaurin,The Advent ofPhyloCode:The Continuing Evolution of Biological Nomenclature,CRC Press,,1reéd.,226p.(ISBN978-1-003-09282-7,DOI10.1201/9781003092827,lire en ligne),chap.6.1(« Controversies in Nomenclature »)
  55. ↑AurélienMiralles,«L' Alpha -taxonomie auXXIesiècle: Inventorier le Vivant à l'ère du numérique et de la 6e extinction.»,Muséum national d'histoire naturelle(rapport),‎(lire en ligne,consulté le)
  56. ↑Hendrik Cornelis Dirk de Wit,Histoire du développement de la biologie,vol.3, Lausanne,PPURpresses polytechniques et universitaires romandes,,635p.(ISBN2-88074-264-1,présentation en ligne),chap.X (« Systématique ou taxinomie: 3. Aristote et lascala naturae»),p.5-11.
  57. ↑(en)Alexander Fürstvon Lievenet MarcelHumar,«A Cladistic Analysis of Aristotle's Animal Groups in the "Historia animalium"»,History and Philosophy of the Life Sciences,vol.30,no2,‎,p.227–262(ISSN0391-9714,lire en ligne,consulté le)
  58. ↑(en)EleniVoultsiadou,VasilisGerovasileiou,LeenVandepitteet KostasGanias,«Aristotle’s scientific contributions to the classification, nomenclature and distribution of marine organisms»,Mediterranean Marine Science,‎,p.468(ISSN1791-6763et1108-393X,DOI10.12681/mms.13874,lire en ligne,consulté le)
  59. ↑(en)MichelLaurinet MarcelHumar,«Phylogenetic signal in characters from Aristotle’s History of Animals»,Comptes Rendus Palevol,no1,‎(ISSN1777-571X,DOI10.5852/cr-palevol2022v21a1,lire en ligne,consulté le)
  60. ↑«Carl von Linné», surbibliomonde,(consulté le).
  61. ↑(en)MichelLaurin,The Advent ofPhyloCode:The Continuing Evolution of Biological Nomenclature,CRC Press,,1reéd.,226p.(ISBN978-1-003-09282-7,DOI10.1201/9781003092827,lire en ligne),chap.1.3(« Linnaeus and His Followers before the Advent of the Rank-Based Codes »)
  62. ↑Jacqueline Brossollet, «AUGUSTIN PYRAME DE CANDOLLE», suruniversalis.fr(consulté le).
  63. ↑Augustin Pyramus de Candolle,«Théorie élémentaire de la botanique: ou, Exposition des principes de la classification naturelle et de l'art de décrire et d'étudier les végétaux», surbooks.google.fr,(consulté le).
  64. ↑Sophie Fleury, «Révolution scientifique: théorie de l'évolution», surlinternaute(consulté le).
  65. ↑Margaux d'Adhémar, «24 novembre 1859: Darwin publie "L'Origine des espèces"», surRevue des Deux Mondes,(consulté le).
  66. ↑«Charles Darwin (1809-1882) - L'Origine des Espèces et la sélection naturelle», surherodote.net,(consulté le).
  67. ↑Pascal Tassy, «WILLI HENNIG, La révolution cladistique», suruniversalis.fr,(consulté le).
  68. ↑Darlu, Pierre (1944-…),Haese, Cyrille d'etZaragüeta Bagils, René,La reconstruction phylogénétique: concepts et méthodes,Paris,Éditions Matériologiques,430p.(ISBN978-2-37361-172-4et2-37361-172-4,OCLC1085559957)
  69. ↑aetbPiotr Daszkiewicz, «Quelques paradoxes de la notion d'espèce (espèce sensu Linné et non Linné)», surinra.fr,Sauve qui peut!,(consulté le).
  70. ↑Louis Gaussin, «Sur la notion d'espèce», surpersee.fr,Bulletins et Mémoires de la Société d'Anthropologie de Paris,Société d'Anthropologie de Paris,(consulté le).
  71. ↑«Sortie du livre Comprendre la notion d’espèce par Philippe Lherminier»,VR2015,surjussieu.fr,Société Française de Systématique,(consulté le).
  72. ↑GabrielleBarrieraet AlainChautems,«La taxonomie ou la fabrication d’un dictionnaire»,La Feuille Verte,Genève,CJB,no47 « Célébration du bicentenaire 1817-2017 »,‎,p.48(lire en ligne[PDF]).
  73. ↑Thierry Gontier,Animal et animalité dans la philosophie de la Renaissance et de l'Âge Classique,Éditions de l'Institut supérieur de philosophie,,p.22.
  74. ↑«Méthode cladistique», surens-lyon.fr(consulté le).
  75. ↑(en)T.F. Stuessyet C. König, «Patrocladistic classification»,Taxon,vol.57,‎,p.594-601(lire en ligne)
  76. ↑SarahSamadi,«Taxonomie intégrative»,Biofutur,Paris,Éditions Lavoisier,vol.31,no328 « Systématique: réorganiser le vivant »,‎,p.38(ISSN0294-3506,lire en ligne[PDF]).
  77. ↑NicolasPuillandre,«La « Révolution » ADN: Impact sur les collections des muséums et sur les pratiques en taxonomie»,Techniques & Culture,Paris, Éditions de l’EHESSen ligne surOpenEdition Journals,vol.59,no2 « Itinéraires de coquillages »,‎,p.338-345(ISBN978-2-7351-1534-1,ISSN0248-6016et1952-420X,DOI10.4000/tc.6764,lire en ligne).
  78. ↑(en)Houghton J., Rasmussen B., Sheehan P., Oppenheim C., Morris A., Creaser C., Greenwood H., Summers M. & Gourlay A. (eds) (janvier 2009). Economic Implications of Alternative Scholarly Publishing Models: Exploring the costs and benefit. Loughborough University, London, 257 p.[lire en ligne]
  79. ↑(en)Crow R. (février 2006).Publishing Cooperatives: an Alternative for Society publishers,a SPARC Discussion Paper, SPARC Publications, Washington DC, 39 p.
  80. ↑Présentation:(en)European Journal of Taxonomy: A Model for Collaborative Publication BioOne– 22 avril 2011.
  81. ↑(en)«Journal Sponsorship», sureuropeanjournaloftaxonomy.eu,(consulté le).
  82. ↑(en)Desalegn Chala, Dag Endresen, Sebsebe Demissew, Laura A. Slaughter, Einar Broch Johnsen et Nils Chr. Stenseth, «Address social injustices in taxonomy: implement extended revisions of names with ethical issues and persistent identifiers for tracing name changes», Machine-readable Nature (MaNa),(consulté le).

Voir aussi

[modifier|modifier le code]

Sur les autres projets Wikimedia:

Unecatégorieest consacrée à ce sujet:Taxinomie.

Bibliographie

[modifier|modifier le code]

Document utilisé pour la rédaction de l’article:document utilisé comme source pour la rédaction de cet article.

Articles connexes

[modifier|modifier le code]

Liens externes

[modifier|modifier le code]

v·m
Notions générales
Nomenclature
Rang taxonomique
v·m
Branches de labiologie
v·m
Contexte
Semantic Web Stack
Applicationset interfaces
Triplestore
Règles
Structure
Requête
Échange
Syntaxe
Identifiant
Caractères
Autres ontologies
Articles liés
v·m
Vocabulairepaléontologiqueconcernant les outils
Outils
Autres palettes liées:Espace géographique-Espace temps-Biologie-Géologie-Outils
Ce document provient de «https://fr.wikipedia.org/w/index.php?title=Taxonomie&oldid=219498224».