Wikipedy

Streptomyces

(Trochferwiisd fanNetskurft)

Streptomycesbinne it grutsteskaaifanActinobacteriaen in skaai fan de famyljeStreptomycetaceae.[1]Mear as 500 soarten fan Streptomyces-baktearjes binne beskreaun.[2]Krekt as by de oare Actinobaktearjes, binne streptomycetesGram-posityf,en hawwegenomenmei in hege GC-ynhâld.[3]Se wurde meast fûn yn de grûn en by ferwyldere plantegroei, de measte streptomyceten produsearjespoaren,en binne ferneamd om hargrûnigerook dy’t fan de produksje fan in flechtichmetabolytkomt.

Streptomyces
Kultuer fan in Streptomyces-soarte
Kultuer fan inStreptomyces-soarte
Taksonomy
domein: eukaryoaten(Eukaryota)
ryk: baktearjes(Baktearia)
stamme: Actinobacteria
klasse: Actinobacteria
skift: Actinomycetales
famylje: Streptomycetaceae
skaai: Streptomyces
Waksman & Henrici, 1943

Streptomycetes wurde skaaimerke troch in kompleksesekundêre stofwiksel.[3]Se produsearje mear as twa-tredde fan de klinysk brûkbere antibiotika fan natuerlik komôf (bgl, neomycine, cypemycine, grisemycine, bottromycins en Gloaramfenikol).[4][5]It no net mear algemien brûktestreptomycineûntlient syn namme daliks oanStreptomyces.Streptomycetes binne ynfrekwinte sykteferwekkers, mar ynfeksjes by minsken, lykas mycetoma, kinne feroarsake wurde trochStreptomyces somaliensisenStreptomyces sudanensis,en yn planten trochStreptomyces caviscabies,Streptomyces acidiscabies,Streptomyces turgidiscabiesenStreptomyces scabies.

Taksonomy

bewurkje seksje

Streptomycesis it type skaai fan de famyljeStreptomycetaceae[6]en omfiemet tsjintwurdich sa’n 576 soarten dêr’t alle jierren guon bykomme.[7]Acidophilicen acid-tolerante dy’t earst yndield wiene by dit skaai binne letter ferpleatst neiKitasatospora(1997)[8]enStreptacidiphilus(2003).[9]Denomeklatuerfan soarten is meastal basearre op harren kleur fanskimmeltrieddenenspoaren.

Saccharopolyspora erythraeawaard foarhinne yn dit skaai pleatst (asStreptomyces erythraeus).

Morfology

bewurkje seksje

It skaaiStreptomycesomfiemetaerobic,Gram-positive,triedderige baktearjes dy’t goed ûntwikkele fegetative skimmeltriedden meitsje (tusken 0.5-2.0 µm yn trochsneed) mei ôftakkings. Se foarmje in kompleksmyceliumsubstraat dat helpt by it ferwiderjen fan organyske ferbinings út har substraten.[10]Hoewol't de mycelia en de antennes fan de skimmeltriedden dy't dêrút ûntsteane net mobyl binne, wurdt mobiliteit berikt troch fersprieding fan spoaren.[10]Spoare-oerflakken kinne hierrich, ploaid, rûch, glêd, stikelich of fettich wêze.[11]By guon soarten besteane de antennes út lange, rjochte teisters, dy’t mear as 50 spoaren drage yn min ofte mear geregelde ynterfallen, rangskikt yn krânsen. Eltse tûke fan in harpe produsearret, yn syn top, in skerm dat fan twa oant ferskate keatlingen fan balfoarmige oant elipsfoarmige, glêde of ploaide spoaren draacht.[10]Guon stammen foarmje koarte keatlingen fan spoaren op substrate skimmeltriedden. Sclerotia-, pycnidia-, sporangia-, en synnemata-lykjende struktueren wurde produsearre troch guon stammen.

Genomika

bewurkje seksje

De folsleinegenoomfan "Streptomyces coelicolorstamme A3(2)” waard publisearre yn 2002.[12]Doe waard tocht dat it "S. coelicolor"genoom it grutste tal genen fan allebaktearjeshie.[12]De gromosoom is 8,667,507bplang mei in GC-ynhâld fan 72.1%, en befettet nei ferwachting 7,825 aaiwyt-kodearjende genen.[12]Yn taksonomyske termen heart "S. coelicolorA3(2) "by de soarteStreptomyces violaceoruber,en is it gjin jildige ôfsûnderlike beskreaune soarte; "S. coelicolorA3(2) "moat net betize wurde mei de echteStreptomyces coelicolor(Müller), hoewol’t er foar it gemak gauris oantsjutten wurdt asS. coelicolor[13]

De earste folsleine genoom fanS. avermitiliswaard foltôge 2003.[14]Elts fan dy genomen foarmet ingromosoommei in lineêre struktuer, yn tsjinstelling ta de measte bakteariële genomen, dy't bestean yn 'e foarm fan sirkelfoarmige gromosomen.[15]

De genoomsekwinsje fan S. scabies, in lid fan it skaai dat skurft by ierdappels feroarsaakje kin, is bepaald oan itWellcome Trust Sanger Ynstitút.Mei 10.1 Mbp lang en kodearring foar 9.107 foarriedige genen, is it de grutst bekendeStreptomycesgenoomsekwinsje.[16]

Biotechnology

bewurkje seksje

Yn de ôfrûne jierren begûnenbiotechnology-ûndersikersStreptomyces-soarten te brûken foarheterologe ekspresjefan aaiwiten. Tradisjoneel namen seEscherichia colifoar kar omEukaryoategenen mei út te drukken, omdat se dat goed yn de macht hiene en it maklik wie om mei te wurkjen.[17][18]It útdrukken fan eukaryoate aaiwiten ynE. colikin problematysk wêze. Inkeld teare de aaiwiten net goed, wat liede kin ta ûnoplosberens, ôfsetting ynynslutingslichemsen ferlies fan bio-aktiviteit fan it produkt.[19]Hoewol'tE. colistammen ôfskiedingsmeganismen hawwe, binne dy net effisjint genôch en resultearje se yn ôfskieding yn deperyplasmatyske romte,wylst ôfskieding troch in Gram-positive baktearje, lykas inStreptomycessoarte, resultearret yn ôfskieding daliks yn it ekstrasellulêre medium. Dêrnjonken hawweStreptomycessoarten effisjintere ôfskiedingsmeganismen asE.coli.De eigenskippen fan it sekreesjesysteem binne in foardiel foar yndustriële produksje fan heterologysk útdrukt aaiwyt omdat it de folgjende suveringsstappen makliker makket en de opbringst ferheegje kin. Under oare dizze eigenskippen meitsjeStreptomycesspp. ta in oantreklik alternatyf foar oare baktearjes lykasE. coliandBacillus subtilis.[19]

Plantpatogene baktearjes

bewurkje seksje

Oant no ta hat bliken dien dat tsien soarten út dit skaai patogeen foar planten binne:[7]

  1. S. scabiei
  2. S. acidiscabies
  3. S. europaeiscabiei
  4. S. luridiscabiei
  5. S. niveiscabiei
  6. S. puniciscabiei
  7. S. reticuliscabiei
  8. S. stelliscabiei
  9. S. turgidiscabies(skurft ynierdappels)
  10. S. ipomoeae(weakrot ynswiete ierdappels)
bewurkje seksje

Boarnen, noaten en referinsjes

bewurkje seksje
Boarnen, noaten en/as referinsjes:
  1. ↑Kämpfer, Peter, 2006, The Family Streptomycetaceae, Part I: Taxonomy url=https://books.google.com/books?id=swciHNNWZDEC&pg=PA538s.538–604, Martin Dworkin, Stanley Falkow, Eugene Rosenberg, Karl-Heinz Schleifer, Erko Stackebrandt, The Prokaryotes, isbn 978-0-387-25493-7
  2. ↑Euzéby JPhttp://www.bacterio.cict.fr/s/streptomycesa.htmlGenus Streptomyces, List of Prokaryotic names with Standing in Nomenclature, 2008
  3. ↑3,03,1Madigan M, Martinko J, Brock Biology of Microorganisms, Prentice Hall, 2005, isbn 0-13-144329-1
  4. ↑Kieser T, Bibb MJ, Buttner MJ, Chater KF, Hopwood DA, Practical Streptomyces Genetics, John Innes Foundation, Norwich, Ingelân, 2000, isbn 0-7084-0623-8
  5. ↑Understanding and manipulating antibiotic production in actinomycetes
  6. ↑Anderson, AS, Wellington, Elizabeth, 2001, The taxonomy ofStreptomycesand related genera, International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 51, 3, s. 797–814
  7. ↑7,07,1Multilocus sequence analysis of phytopathogenic species of the genus Streptomyces|year, 2010, Labeda, D. P., International Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology, 61, 10, s. 2525–31
  8. ↑A Proposal to Revive the Genus Kitasatospora (Omura, Takahashi, Iwai, and Tanaka 1982), 1997, Zhang, Z., Wang|, Y., Ruan, J., International Journal of Systematic Bacteriology, 47, 4, s.1048–54
  9. ↑2003, Kim|first, Seung Bum, Antonie van Leeuwenhoek, 83, 2|, s.107–16, Lonsdale, J, Seong, CN, Goodfellow, M, Streptacidiphilus gen. Nov., acidophilic actinomycetes with wall chemotype I and emendation of the family Streptomycetaceae (Waksman and Henrici (1943)AL) emend. Rainey et al. 1997
  10. ↑10,010,110,2Chater, Keith, Richard, Losick, Microbial development, Morphological and physiological differentiation inStreptomycesurl=http://cshmonographs.org/index.php/monographs/article/view/43671984, isbn 978-0-87969-172-1, s. 89–115
  11. ↑Dietz, Alma, Mathews, John, 1971, Classification ofStreptomycesspore surfaces into five groups, Applied Microbiology, 21, 3, s. 527–533
  12. ↑12,012,112,2Complete genome sequence of the model actinomycete Streptomyces coelicolor A3(2), Nature, 417, s.141–7, 2002, Bentley, S. D., Chater, K. F., Cerdeño-Tárraga, A.-M., Challis, G. L., Thomson, N. R., James, K. D., Harris, D. E., Quail, M. A., Kieser, H., Harper, D., Bateman, A., Brown, S., Chandra, G., Chen, C. W., Collins, M., Cronin, A., Fraser, A., Goble, A., Hidalgo, J., Hornsby, T., Howarth, S., Huang, C.-H., Kieser, T., Larke, L., Murphy, L., Oliver, K., O’Neil, S., Rabbinowitsch, E., Rajandream, M.-A., Rutherford, K.
  13. ↑Chater, Keith F., Biró, Sandor, Lee, Kye Joon, Palmer, Tracy, Schrempf, Hildgund, 2010, The complex extracellular biology ofStreptomyces,FEMS Microbiology Reviews, 34, 2, s.171–98
  14. ↑Complete genome sequence and comparative analysis of the industrial microorganism Streptomyces avermitilis, Nature Biotechnology, 21, 5, s. 526–31, 2003, Ikeda, Haruo, shikawa,, Jun, Hanamoto, Akiharu, Shinose, Mayumi, Kikuchi, Hisashi, Shiba, Tadayoshi, Sakaki, Yoshiyuki, Hattori, Masahira, Ōmura, Satoshi
  15. ↑Paul Dyson, Streptomyces: Molecular Biology and Biotechnology url=https://books.google.com/books?id=3z9_QwFumi8CJanuary 2012, Horizon Scientific Press, isbn 978-1-904455-77-6
  16. ↑http://www.sanger.ac.uk/Projects/S_scabiesStreptomyces scabies, Sanger Institute|accessdate
  17. ↑Streptomyces: A host for heterologous gene expression, Current Opinion in Biotechnology, 2, 5, s. 674–81, 1991, Brawner, Mary, Poste, George, Rosenberg, Martin, Westpheling, Janet
  18. ↑Payne, Gregory F., Delacruz, Neslihan, Coppella, Steven J., 1990, Improved production of heterologous protein from Streptomyces lividans |journal=Applied Microbiology and Biotechnology, 33, 4, s. 395–400
  19. ↑19,019,1Heterologous biopharmaceutical protein expression in Streptomyces, Trends in Biotechnology, 15, 8, s. 315–20, 1997, Binnie, Craig, Douglas Cossar, J., Stewart, Donald I.H.
Opfrege fan "https://fy.wikipedia.org/w/index.php?title=Streptomyces&oldid=1022207"