农村宅基地纠纷的处理方式有：
1、农户之间发生宅基地权属争议，当事人双方应尊重历史，相互谦让，协商解决问题。
2、协商不成的，当事人任何一方或双方可到当地乡(镇)政府或土地管理所等受理机关提出处理申请。
3、当事人双方可直接向县政府或国土局申请，若符合受理条件，可指定受理或直接受理。受理机关对受理的宅基地权属争议，可先行调解。调解无效的，应当作出处理决定。
4、当事人对处理决定不服的，可在收到处理决定通知之日起15日内向上一级处理机关申请复议，也可以在接到处理决定后30日内，直接向人民法院起诉。
农村宅基地建房的纠纷包括：
1、争占宅基地以外的集体空闲地引发的纠纷；
2、建房户私下调换宅基地引发的纠纷；
3、用地建房影响相邻关系人利益引发的纠纷；
4、未经共同使用人同意，部分公用人擅自使用共用的宅基地而引发的纠纷
【法律依据】
《民法典》第三百六十二条，宅基地使用权人依法对集体所有的土地享有占有和使用的权利，有权依法利用该土地建造住宅及其附属设施。
《民法典》第三百六十三条，宅基地使用权的取得、行使和转让，适用土地管理的法律和国家有关规定。