公司对员工罚款是不合法的。行政执法机关才可以对公民的违法行为进行罚款，而公司并不属于行政执法机关，因此公司是没有权利对员工罚款的，公司对员工的罚款行为是违法行为。如果公司对员工进行罚款的，员工可以去申请劳动仲裁来维权。
【法律依据】
《行政处罚法》第八条，行政处罚的种类:
（一）警告；
（二）罚款；
（三）没收违法所得、没收非法财物；
（四）责令停产停业；
（五）暂扣或者吊销许可证、暂扣或者吊销执照；
（六）行政拘留；
（七）法律、行政法规规定的其他行政处罚。