夫妻感情确已破裂可以离婚。仅仅因为孩子有先天性疾病是不影响的，但是离婚后对孩子的抚养上两人共同承担。
人民法院审理离婚案件，应当进行调解；如果感情确已破裂，调解无效的，应当准予离婚。
有下列情形之一，调解无效的，应当准予离婚：
（一）重婚或者与他人同居；
（二）实施家庭暴力或者虐待、遗弃家庭成员；
（三）有赌博、吸毒等恶习屡教不改；
（四）因感情不和分居满二年；
（五）其他导致夫妻感情破裂的情形。
一方被宣告失踪，另一方提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
经人民法院判决不准离婚后，双方又分居满一年，一方再次提起离婚诉讼的，应当准予离婚。
【法律依据】
《民法典》第一千零八十条，完成离婚登记，或者离婚判决书、调解书生效，即解除婚姻关系。