农民工工伤赔偿的程序为：
一、工伤认定程序用人单位或者受伤职工或其近亲属、工会组织向社保部门提出工伤认定申请，由社会保险经办机构对工伤(亡)事故进行调查确定是否属工伤的程序，这是一般工伤必走第一步二线、工伤鉴定程序工伤鉴定是在申请工伤鉴定的职工被认定为工伤的基础上(即走完工伤认定程序后)，在其医疗终结或医疗期满之后，由县以上劳动鉴定委员会对其进行的评定伤残等级的行为。
三、协商赔偿程序工伤鉴定以后，就可以依据鉴定的标准计算出赔偿数额了，职工和单位就可以协商处理了。
四、劳动仲裁程序与用人单位协商解决不了的，则可以依据劳动仲裁法规提起仲裁程序。
五、法院审理程序对劳动仲裁不服的，可以向法院提起诉讼解决。对一审法院判决不服的，可以依法向二审法院提起上诉。
六、执行程序仲裁或者判决生效后，用人单位不支付赔偿费的，则可以依据生效法律文书向法院执行局提起执行申请，由法院执行。
七、申诉程序对生效判决不服的，则可以申请启动再审程序。