个人独资企业股权转让缴税方式：其转让所得应作为投资者个人的生产经营所得，按照个体工商户的生产经营所得计算缴纳个人所得税。不比照契税的免税规定。
【法律依据】
《国家税务总局关于执行需要明确的有关所得税问题的通知》第三条规定，企业已提取减值、跌价或坏帐准备的资产，如果有关准备在申报纳税时已调增应纳税所得，转让处置有关资产而冲销的相关准备应允许作相反的纳税调整。