土地流转的合法程序有：承包方与受让方就流转方式、期限和具体条件等进行自愿平等协商，达成流转意向；报所在地农村土地承包管理机构对受让方情况进行审查；经审查后在乡镇土地承包流转服务中心监督下，双方签订土地承包经营权流转合同。
法律依据：《农村土地承包法》第三十六条承包方可以自主决定依法采取出租（转包）、入股或者其他方式向他人流转土地经营权，并向发包方备案。第四十条土地经营权流转，当事人双方应当签订书面流转合同。第四十六条经承包方书面同意，并向本集体经济组织备案，受让方可以再流转土地经营权。