1、法律性质不同，反垄断法是经济行政法的一种，属于公法范畴；而反不正当竞争法，是知识产权法的一种，属于私法范畴。
2、立法目的不同，反垄断法调整的目的在于禁止限制竞争行为，创造良好的市场环境，维护合法竞争的自由性，鼓促进经营者积极参与市场竞争。反不正当竞争法调整的目的在于禁止不正当竞争行为，规范合法竞争的市场秩序，维护合法竞争的公平性，鼓励经营者积极参予市场的公平竞争，保护经营者的合法地位。