两者的区别如下：
1、合同诈骗罪是指以非法占有为目的，在签订、履行合同的过程中，以虚构事实或隐瞒真相的方法，骗取对方当事人财物，数额较大的行为。票据诈骗罪，是指以非法占有为目的，进行金融诈骗活动，数额较大的行为。
2、在犯罪客体上，二者均为复杂客体，也都侵犯了他人财产所有权，但是：合同诈骗罪还侵犯了国家的合同管理制度，而票据诈骗罪则是侵犯国家票据管理秩序。从客观方面来看，合同诈骗罪的手段主要是利用合同将他人的财物据为己有或逃匿；而票据诈骗罪主要利用票据骗取他人财物；另外，在合同诈骗罪中，被骗人往往自愿交出财物以履行“合同”，而票据诈骗罪往往是被骗人误以为交易已经完成，而履行自己的“付款”义务。