医疗事故死亡，处理如下：1、医患双方可以协商解决；协商不成的，当事人可以向卫生行政部门提出调解申请，也可以向人民法院提起民事诉讼。2、应该赔偿医疗费、被扶养人生活费、丧葬费、精神损害抚慰金等费用。交通费、误工费、住宿费还包括死者的配偶和直系亲属所支出的合理费用。
法律依据
《医疗事故处理条例》 第四十六条
发生医疗事故的赔偿等民事责任争议，医患双方可以协商解决；不愿意协商或者协商不成的，当事人可以向卫生行政部门提出调解申请，也可以直接向人民法院提起民事诉讼。

《医疗事故处理条例》 第四十七条
双方当事人协商解决医疗事故的赔偿等民事责任争议的，应当制作协议书。协议书应当载明双方当事人的基本情况和医疗事故的原因、双方当事人共同认定的医疗事故等级以及协商确定的赔偿数额等，并由双方当事人在协议书上签名。