(1)新纳入银行扣税(费)系统的纳税人，办税服务厅一窗通办岗在综合征管信息系统中维护纳税人缴税账号，录入《数据电文申请审批表》，通过外部信息采集与交换综合服务平台录入三方协议信息，打印三方协议书发放纳税人一式三份(必要时可打印四份)，税务机关和纳税人在协议书上分别签章。
(2)纳税人将三份(或四份)三方协议书提交给开户银行，开户银行对协议书有关内容进行确认后，补录相关信息，签章并留存一份，将剩余三方协议书退还纳税人。
(3)纳税人将银行确认后的三方协议书报办税服务厅一窗通办岗，一窗通办岗通过外部信息采集与交换综合服务平台进行验证，验证通过的三方协议即为有效协议。办税服务厅一窗通办岗将一份协议书存档，一份交纳税人留存。