Nella stagione2007-2008il Messina disputa il 32º campionato diSerie B,in seguito alla retrocessione dopo tre anni consecutivi inSerie A.Il torneo cadetto è terminato con il 14º posto per i peloritani che sono allenati daNello Di Costanzo,a pari punti con ilGrosseto.NellaCoppa Italiail Messina subito fuori ad agosto nel primo turno, (2-2) con il Vicenza, ma superati (3-4) nei calci di rigore. Miglior realizzatore stagionale il napoletanoRaffaele Biancolinopreso dall'Avellino, che ha realizzato di 10 reti.
Ma l'estate 2008 ha visto la situazione societaria divenire sempre più insostenibile per i debiti accumulati. La famiglia Franza comunica l'intenzione di lasciare la proprietà del Messina[1]e, coadiuvata dalle istituzioni messinesi, ha cercato nuovi acquirenti in grado di garantire la continuità e l'iscrizione al prossimo campionato cadetto[2].Ma nessuno si è accollato l'enorme mole di debiti accumulata, e il 14 luglio2008è stata ufficialmente ritirata la domanda di iscrizione allaSerie B 2008-2009[3].La società non è stata radiata, ma è stata iscritta dallaprefetturaper ordine pubblico nel girone I dellaSerie D 2008-2009con una nuova squadra di dilettanti[4].
Il 27 novembre2008il Tribunale di Messina dichiara fallito il Football Club Messina Peloro a causa delle gravi anomalie riscontrate dai magistrati nelbilanciodel sodalizio messinese; alla squadra è stata comunque garantita la regolare attività fino al termine della stagione in corso poiché parzialmente acquisita dalla nuova Rinascita Messina[5][6].
^abcdeCeduto durante la sessione estiva del calciomercato, a stagione in corso.
^abCeduto durante la sessione invernale del calciomercato.
^abcdeAcquistato durante la sessione estiva del calciomercato, a stagione in corso.
^Acquistato durante la sessione invernale del calciomercato.
^Giornata interamente rinviata al 1º dicembre 2007, dopo i gravi disordini accaduti in un autogrill tra tifosi laziali e juventini, che hanno provocato una vittima, il tifoso laziale Gabriele Sandri.