InChI

InChI

Khai phát nguyên	InChI Trust
Sơ bản	2005 niên 4 nguyệt 15 nhật(2005-04-15)
Tối tân bản	1.04 /2011 niên 9 nguyệt(2011-09)
リポジトリ	github.com/IUPAC-InChI/InChI
Đối ứng OS	Microsoft WindowsandUnix-like
プラットフォーム	IA-32andx86-64
サイズ	4.3 MB
Đối ứng ngôn ngữ	Anh ngữ
サポート trạng huống	Active
ライセンス	IUPAC / InChI Trust Licence
Công thức サイト	https://www.inchi-trust.org/

InChI(International Chemical Identifier)は, tiêu chuẩn đích かつ nhân gian が đọc める phương pháp でPhân tửTình báo を đề cung し, またウェブ thượng でのデータベースからの tình báo の kiểm tác cơ năng を đề cung する. Nguyên 々, 2000 niên から2005 niên にIUPACとNISTによって khai phát され, フォーマットとアルゴリズムは phi 営 lợi であり, khai phát の継続は, IUPACも tham họa する phi 営 lợi đoàn thể のInChI Trustにより, 2010 niên までサポートされていた. Hiện tại の1.04 bản は, 2011 niên 9 nguyệt にリリースされた.

1.04 bản の tiền までは, ソフトウェアはオープンソースのGNU Lesser General Public Licenseで vô thường で nhập thủ できたが,Hiện tại は, IUPAC-InChI Trust Licenseと hô ばれる cố hữu のライセンスとなっている.

Khái yếu

Thức biệt tử は, tình báo のレイヤーとして hóa học vật chất を ký thuật する. レイヤーには, nguyên tử とその kết hợp,Hỗ 変 dị tínhTình báo,Đồng vị thểTình báo,Lập thể hóa học,Điện hà の tình báo がある. しかし toàn てのレイヤーが đề cung される訳ではなく, lệ えば hỗ 変 dị tính のレイヤーは tỉnh lược されることがある.

Quảng く dụng いられているCAS đăng lục phiên hàoとは, dĩ hạ の điểm で dị なる.

• Tự do に sử え, phi 営 lợi である.
• Cấu tạo tình báo から kế toán でき, tổ chức による cát đương が tất yếu ない.
• ほとんどの tình báo は, nhân が đọc むことができる.

そのため, InChIは,IUPAC mệnh danh phápを nhất bàn hóa, cực đoan な định thức hóa したものと kiến なすことができる.単 thuần なSMILES ký phápよりも đa くの tình báo を biểu hiện でき, toàn ての cấu tạo が, データベースの ứng dụng に tất yếu な độc tự のInChI văn tự liệt を trì つ điểm が dị なっている.Nguyên tử の3 thứ nguyên phối liệt の tình báo はInChIでは biểu せず, この mục đích のためにはPDBĐẳng のフォーマットが dụng いられる.

InChIアルゴリズムは, nhập lực された cấu tạo tình báo を, chính quy hóa ( nhũng trường な tình báo の trừ khứ ), tiêu chuẩn hóa ( các nguyên tử に cố hữu の phiên hào を sinh thành ), chỉnh liệt hóa ( đặc trưng の văn tự liệt を phó dữ ) の3 đoạn giai の quá trình で cố hữu の thức biệt tử に変 hoán する.

hashed InChIとも hô ばれるInChIKeyは, 25 văn tự の cố định trường であるが, デジタル biểu hiện なので nhân gian には đọc むことができない. InChIKeyの sĩ dạng は, ウェブでの kiểm tác を khả năng にするために, 2007 niên 9 nguyệt にリリースされた.InChIそのものとは dị なり, InChIKeyは nhất ý ではなく, phi thường に hi ではあるが trọng phục が phát sinh する.

2009 niên 1 nguyệt, InChIソフトウェアの tối chung の1.02 bản がリリースされた. これにより, いわゆるstandard InChIの sinh thành が khả năng となった. standard InChIは, InChI văn tự liệt と, dị なったグループによって sinh thành されたキーの bỉ giác を dung dịch にし, データベースやウェブ tư nguyên đẳng の quảng phạm な tình báo nguyên からのアクセスを khả năng にした.

フォーマットとレイヤー

InChI format

MIMEタイプ	chemical/x-inchi
Chủng biệt	chemical file format

Toàn てのInChIは,InChI=という văn tự liệt から thủy まり, バージョン ( hiện tại は1) が続く. standard InChIでは, これにSの văn tự が続く. Tàn りの tình báo は, レイヤーとサブレイヤーの phối liệt として cấu tạo hóa され, các 々のレイヤーは, 1つの chủng loại の tình báo を thâu める. レイヤーとサブレイヤーは,Khu thiết り văn tự/で cách てられ, ( メインレイヤーの hóa học thức サブレイヤーを trừ き ) cố hữu の tiếp đầu văn tự で thủy まる. 6つのレイヤーと các 々の trọng yếu なサブレイヤーは, dĩ hạ の thông りである.

1. メインレイヤー
   • Tổ thành thức( tiếp đầu văn tự なし ) - toàn てのInChIに hiện れる duy nhất のサブレイヤー
     Nguyên tố はHill thuận vị tắc, すなわちThán tốC,Thủy tốH, tha の nguyên tố をアルファベット thuận, で ký thuật される
   • Nguyên tử の繋がり ( tiếp đầu văn tự:c) - tổ thành thức trung の thủy tố dĩ ngoại の nguyên tố には xuất hiện thuận に phiên hào が phó dữ される. このサブレイヤーでは, nguyên tử が tha のどの nguyên tử と kết hợp されているかを ký thuật する.
   • Thủy tố nguyên tử ( tiếp đầu văn tự:h) - các 々の nguyên tử にいくつの thủy tố nguyên tử が kết hợp しているかを ký thuật する.
2. Điện hà レイヤー
   • プロトンサブレイヤー ( tiếp đầu văn tự:p) trung tính の hệ からプロトンを hà cá phó gia / trừ khứ するかを biểu す
   • Điện hà サブレイヤー ( tiếp đầu văn tự:q) hệ の điện hà を biểu す
3. Lập thể hóa học レイヤー
   • Nhị trọng kết hợp とクムレン( tiếp đầu văn tự:b)
   • Nguyên tử の tứ diện thể phối trí とアレーン( tiếp đầu văn tự:t,m)
   • Lập thể hóa học の chủng loại の tình báo ( tiếp đầu văn tự:s)
4. Đồng vị thể レイヤー ( tiếp đầu văn tự:i,h,Đồng vị thể lập thể hóa học に đối してはb,t,m,s)
   
5. Cố định Hレイヤー ( tiếp đầu văn tự:f) - nguyên tử の繋がり dĩ ngoại の, thượng ký の nhất bộ または toàn てのレイヤーを hàm む.oサブレイヤーで chung わってもよい.
   InChI sinh thành で cấu tạo を chính quy hóa する tế に thủy tố は trừ khứ されるため,Hỗ 変 dị tính thểやSong tính イオンなどは đồng じInChIを dữ える tràng hợp がある. これらを khu biệt するために thủy tố が kết hợp している nguyên tử を minh kỳ đích に dữ える tất yếu がある.
6. Tái tiếp 続レイヤー ( tiếp đầu văn tự:r) - kim chúc nguyên tử と tái tiếp 続する toàn ての cấu tạo のInChIを hàm む. standard InChIには hàm まれない.

Khu thiết り văn tự と tiếp đầu văn tự のフォーマットは, sử dụng giả が đặc định のレイヤーのみ hợp trí する thức biệt tử を tham すために dung dịch にワイルドカードKiểm tác を thật thi できる điểm で ưu vị tính がある.

Lệ

CH3CH2OH エタノール	InChI=1/C2H6O/c1-2-3/h3H,2H2,1H3 InChI=1S/C2H6O/c1-2-3/h3H,2H2,1H3(standard InChI)
CH3N+H3 メチルアンモニウム	InChI=1/CH5N/c1-2/h2H2,1H3/p+1 InChI=1S/CH5N/c1-2/h2H2,1H3/p+1(standard InChI)
L-アスコルビン toan	InChI=1/C6H8O6/c7-1-2(8)5-3(9)4(10)6(11)12-5/h2,5,7-10H,1H2/t2-,5+/m0/s1 InChI=1S/C6H8O6/c7-1-2(8)5-3(9)4(10)6(11)12-5/h2,5,7-8,10-11H,1H2/t2-,5+/m0/s1(standard InChI)

Danh tiền

このフォーマットは, nguyên 々IChI(IUPAC Chemical Identifier)と hô ばれていたが, 2004 niên 7 nguyệt にINChI(IUPAC-NIST Chemical Identifier)と cải danh され, đồng niên 11 nguyệt にInChI(IUPAC International Chemical Identifier)に tái cải danh され, IUPACの thương tiêu とされた.

Khai phát の継続

InChIの quản lý は, IUPACのVIII tiểu ủy viên hội で hành われており, tân しい tiêu chuẩn の拡 trương のための điều tra đẳng の kinh phí は, IUPACとInChI Trustが phụ đam している. InChI Trustは, InChIの phát triển, thí nghiệm, văn thư chỉnh bị のための tư kim を xuất している. Hiện tại の拡 trương では,Trọng hợp thểCập びHỗn hợp vật,マルクーシュ cấu tạo,Phản ứng とHữu cơ kim chúcの thủ tráp いについて định nghĩa しており, VIII tiểu ủy viên hội に thừa nhận されればアルゴリズムに gia えられる.

Thải dụng

InChIは,ChemSpiderやPubChemĐẳng を hàm む đại tiểu dạng 々なデータベースに thải dụng されている. しかし, đa くのデータベースで cấu tạo とInChIの thực い vi いが kiến られ, リンク dụng データベースの khóa đề となっている.

Quan liên hạng mục

• Molecular Query Language
• SMILES ký pháp
• Cấu tạo thức エディタ
• SYBYL line notation

Ngoại bộ リンク

ドキュメントとプレゼンテーション

• InChI Trust site
• IUPAC InChI site
• Unofficial InChI FAQ
• InChI Technical Manual(PDF,335 KB)
• [1]
• Description of the canonicalization algorithm
• Googling for InChIsa presentation to the W3C.
• The Semantic Chemical Web: GoogleInChI and other Mashups-ウェイバックマシン( 2007 niên 2 nguyệt 8 nhật アーカイブ phân ), Google Tech Talk by Peter Murray-Rust, 13 Sept 2006
• IUPAC InChI-ウェイバックマシン( 2007 niên 3 nguyệt 21 nhật アーカイブ phân ), Google Tech Talk by Steve Heller and Steve Stein, 2 November 2006
• InChI Release 1.02InChI final version 1.02 and explanation of Standard InChI, January 2009

ソフトウェアとサービス

• NCI/CADD Chemical Identifier ResolverGenerates and resolves InChI/InChIKeys and many other chemical identifiers
• ChemSpider InChI resolver
• Search Google for molecules(generates InChI from interactive chemical and searches Google for any pages with embedded InChIs). Requires Javascript enabled on browser
• ChemSketch,free chemical structure drawing package that includes input and output in InCHI format
• PubChem online molecule editorthat supports SMILES/SMARTS and InChI
• ChemSpider Servicesthat allows generation of InChI and conversion of InChI to structure (also SMILES and generation of other properties)
• MarvinSketchfrom ChemAxon, implementation to draw structures (or open other file formats) and output to InChI file format
• BKchemimplements its own InChI parser and uses the IUPAC implementation to generate InChI strings
• CompoundSearchimplements an InChI and InChI Key search of spectral libraries
• JNI-InChIJava library that wraps the InChI library
• the Chemistry Development Kit uses JNI-InChI to generate InChIs, can convert InChIs into structures, and generate tautomers based on the InChI algorithms
• Bioclipse generates InChI and InChIKeys for drawn structures or opened files