Stef Wils (Turnhout, 2 augustus 1982) is een Belgisch voetballer die als middenvelder of verdediger speelt.
Wils begon op jonge leeftijd te voetballen bij de club uit zijn buurt KVV Vosselaar. Later kwam hij bij de jeugd van K. Lierse SK terecht. Daar maakte hij zijn debuut in de eerste klasse in 2001. Na vijf seizoenen maakte Wils de overstap naar streekgenoot KVC Westerlo. Tijdens de winterstop van het seizoen 2008-2009 kon de ondertussen 26-jarige speler een contract tekenen bij KAA Gent. Na 3 seizoenen KAA Gent maakte hij in augustus 2011 terug de overstap naar KVC Westerlo. Op 27 mei 2012 maakte Cercle Brugge bekend dat ze een contract hadden afgesloten met Wils voor de duur van 3 seizoenen. In 2015 ging hij naar het Hongaarse Szombathelyi Haladás. Na afloop van zijn contract bij Haladás keerde Wils terug naar België om een contract voor 2 seizoenen te tekenen bij K. Lyra-Lierse.
Wils heeft nog een jongere broer Thomas Wils, eveneens profvoetballer.