Bacteriën

Bacteriën Fossielvoorkomen:Archaïcum–heden
Escherichia coli Enterococcus Campylobacter Oscillatoria Myxococcus Streptomyces
Domein
Bacteria Woese,1990
Synoniemen
"Eubacteria"Woese and Fox 1977 "Bacteriaceae"Cohn 1872 "Neobacteria"Möhn 1984 "Schizomycetes"Nägeli 1857
Portaal Biologie

Debacteriën(Bacteria) vormen eendomeinvaneencellige,doorgaans vrijlevendemicro-organismen.De meeste bacteriën zijn slechts enkelemicrometersgroot – alleen zichtbaar onder demicroscoop– en leven in losjes georganiseerdekoloniesin bijna allehabitatsop Aarde. Ze zijn aanwezig in bodems, in het water, in associatie met planten en dieren, maar ook in extremere omgevingen zoalswarmwaterbronnenen zelfs de diepe lagen van de planeet.

Het lichaam van mensen en dieren is de woonplaats van vele miljarden bacteriën. Veruit het merendeel is onschadelijk en sommige bacteriën vervullen zelfs nuttige functies, zoals de vertering van voedsel. Er zijn echter ook verschillende bacteriesoorten die ernstige besmettelijke ziektes veroorzaken, waarondercholera,syfilisentuberculose.Om bacteriële infecties te bestrijden, gebruikt menantibiotica,maarresistentievan bepaalde bacteriestammen tegen antibiotica is een groeiend probleem. Bacteriën spelen een belangrijke rol bij de zuivering van afvalwater, bij de productie van sommige levensmiddelen als kaas en yoghurt, en in debiotechnologievoor de productie van commercieel nuttige chemicaliën.

Bacteriën waren de eerste levensvormen die verschenen op Aarde. In tegenstelling tot de cellen vanplanten,dierenen andereeukaryotenbevatten de cellen van bacteriën geenkernen weinig andere cellulaire structuren. Ze worden om deze reden alsprokaryotengeclassificeerd. In de jaren 1990 ontdekte men op basis van moleculair-genetische gegevens dat prokaryoten bestaan ​​uit twee zeer verschillende groepen organismen: bacteriën enarchaea.Bacteriën worden bestudeerd in een wetenschapstak genaamdmicrobiologie.

Algemeen

Bacteriën zijn bijna overal te vinden. De meeste bacteriën zijn zo'n 1-5µm(0,001-0,005 mm) lang. De grootte kan per soort echter nogal variëren. De parasitaire bacterieRickettsiakan 0,1 μm (0,0001 mm) meten, terwijl de "zwavel-etende" reuzenbacterieThiomargarita namibiensisafmetingen tot 750 micrometer (0,75 mm) kan bereiken. Bacteriën zijn de kleinste organismen die nog met eenlichtmicroscoopwaarneembaar zijn.

De meeste bacteriën zijn niet schadelijk maar juist onmisbaar voor het leven op aarde en onontbeerlijk voor de gezondheid van plant, dier en mens. Plantenzaden hebben al een eigen zogeheten beschermend 'microbioom', soortspecifieke bacteriën die met de individuele plant (in aantal) 'meegroeien' en beschermen tegen andere, schadelijke, bacteriën, virussen en schimmels. Het microbioom in dedarmenvan mensen en dieren waar bacteriën en schimmels alssymbiontenmet hungastheerleven is de zogenaamdedarmflora.De darmflora helpt bij despijsvertering,bevordert deperistaltieken maakt vitamine K aan. Ook houdt de darmflora schadelijke bacteriën tegen en vormt daarmee een deel van deafweer.Ook natuurlijk aanwezige bacteriën op de huid vormen een deel van de afweer.

Sommige plantensoorten leven, om in hunvoedingsstoffente voorzien, insymbiosemet specifieke (bodem)bacteriën, bijvoorbeeld devlinderbloemenfamiliewaartoe depeulvruchtenbehoren. De zogeheten 'bodemfauna' bestaat überhaupt voor het grootste deel uit (al dan niet symbiotische) bacteriën en microscopischeschimmels.

Zuurkoolenyoghurtdanken hun bestaan aanfermentatievan respectievelijkwitte koolenmelkdoormelkzuurbacteriën.In de industrie worden bacteriën gebruikt om organisch afvalaf te brekenen ommedicijnente maken.

Bouw

Structuur van een bacterie

Bouw van een gramnegatieve celwand

Het inwendige van een bacterie bestaat uitcytoplasmamet daarin onder andere het DNA. Het cytoplasma wordt omgeven door eencelmembraan.Bij de meeste bacteriesoorten zit hier omheen eencelwandop basis vanpeptidoglycaan.Veel bacteriën kunnen om de celwand nog een kapsel, een slijmlaag of een celenvelop hebben. Bacteriën kunnen verder uitsteeksels hebben aan de buitenkant in de vorm vanflagellenen/ofpili.

Variatie

Bacteriën kunnen op verschillende manieren praktisch van elkaar worden onderscheiden. Bacteriën worden onderverdeeld op basis van drie kenmerkgroepen:

• de vorm en de ligging van bacteriën ten opzichte van elkaar;
• de aard van de celwand;
• voedsel en het onderscheid aeroob/anaeroob (wel of geen zuurstof nodig).

Vorm

A. staafvormig, B.bolvormig,C. bolvormig in clusters, D. bolvormig in paren, E. spiraalvormig, F. kommavormig

Bacterievormen

Devormvan de bacteriën wordt gebruikt voor de systematische indeling, zonder dat daardoor tegelijk ook relaties in verwantschap worden aangegeven. Op basis van vorm en ligging kan men al veel bacteriën van elkaar onderscheiden. Zo onderscheidt menkokken,die bolvormig zijn, staven, die een grote variatie in lengte, doorsnede en vorm kunnen hebben en spiraalvormige micro-organismen, die eenkurkentrekkerstructuurof kommavorm hebben. De manier waarop de cellen ten opzichte van elkaar liggen kan ook verschillen, doordat na de deling dedochtercellen(de nieuw gevormde bacteriën) vaak op karakteristieke wijze bij elkaar blijven liggen.

Te onderscheiden zijn:

• kokken(bolvormige bacteriën), rond van vorm, al of niet losliggend. VoorbeeldenStreptococcus, Sarcina.
  • streptokokken,liggen in ketens of in paren
  • stafylokokken,liggen in groepjes (druiventrosvorm, van Gr. σταφυλήstaphulé,druiventros)
• bacillen(staafvormig), bijvoorbeeldnitraatbacterie, pestbacterie
• vibrionen(kommabacillen), gebogen staafjes in de vorm van een deel van een spiraal. VoorbeeldVibrio cholerae.
• spirillen(spiraalbacteriën), spiraalvormige gewonden staafjes.
• straalzwammen(Actinobacteria), schimmelachtige vormen bestaande uit staafvormige onbeweeglijke cellen. Meestal met straalvormige vertakkingen van zeer dunne lange draden.

Celwand

De celwand van bacteriën bestaat uitpeptidoglycaan(mureïne). Door middel van eengramkleuringkan zichtbaar worden gemaakt of deze laag dik of dun is. De celwand omsluit decelmembraanvan de bacterie-cel.

• Bacteriën met een dikke wand van peptidoglycaan zijn de grampositieve bacteriën. Grampositieve bacteriën hebben meestal geen extra membraan aan de buitenkant van het omhulsel, maar een aantal soorten heeft wel een extra omhullend laagje.Mycobacteriazijn wel grampositief, maar hebben aan de buitenkant eenhydrofoobwasachtig laagje. Daarom zijn zij alleen goed kleurbaar met een speciale kleurtechniek, zoals deZiehl-Neelsen-kleuring.
  Bacteriën van het phylum Deinococcus-Thermus zijn grampositief, maar hebben wél een extra membraan aan de buitenkant.
• Bacteriën met een dunne wand van peptidoglycaan. Dit zijn de gramnegatieve bacteriën, die gewoonlijk een extra membraan aan de buitenkant van het omhulsel hebben. Het buitenmembraan maakt deze bacteriën vaak ziekteverwekkend.
• Bacteriën zonder celwand. Er zijn bacteriën die van nature geen celwand bezitten, zoals de leden van de klasseMollicutes,waartoe ook deMycoplasma’s behoren. Dit zijn parasitair levende bacteriën die binnen de cellen van hungastheerleven. Daarnaast zijn er celwandloze bacteriën die zich ontwikkeld hebben uit bacteriën mét een celwand, onder invloed van antibiotica of een andere chemische stof. Deze wordenL-vormengenoemd.

Voedsel

Halomonas titanicaeis eenchemoautotrofebacterie die zich voedt met hetroestvan de gezonkenTitanic.

Tussen de bacteriën zijn heterotrofe en autotrofe bacteriën te vinden:

• Heterotrofebacteriën moeten organischevoedingsstoffenopnemen om te leven. Binnen de groep heterotrofe bacteriën kan onderscheid gemaakt worden tussenparasietenensaprofyten.
  • Heterotrofe bacteriën die, tot schade van dezeorganismen,hun voedingsstoffen uit levende wezens betrekken wordenpathogenen(ziekteverwekkers), ofparasietengenoemd.
  • Roofbacteriën die andere bacteriën opeten. Sommige dringen de bacteriën binnen en vermenigvuldigen zich aldaar. Anderen zuigen de bacteriën leeg.
  • Bacteriën die hun voedingsstoffen uit dood materiaal halen, heten in de biologiesaprofyten(sapros = verrot). Deze bacteriën zijn de oorzaak van het rotten vanvoedingsmiddelen.
• Autotrofebacteriën zijn in staat om hun eigenorganische stoffenteproduceren.Ze zijn in te delen naar hun energiebron:
  • Fotoautotrofebacteriën halen middelsfotosynthesehun energie uit zonlicht. De autotrofecyanobacteriënofblauwalgenbezitten dekleurstoffycocyaninewaarmee ze fotosynthese bedrijven. Blauwalgen komen voor als losse cellen, of in kolonies van draadvormige celgroepen, waarin de afzonderlijke bacteriën door een schede worden samengehouden, bijvoorbeeldijzerbacteriën.
  • Chemoautotrofebacteriën halen hunenergieuit stoffen uit hun omgeving.

Omgevingsfactoren

Citrobacter freundii

Bacteriën gedijen beter of slechter afhankelijk van de volgende omgevingsfactoren:

• Zuurstofgehalte: aerobe bacteriën hebben een zuurstofrijk milieu nodig, anders stoppen ze met groeien endelen;anaerobe bacteriën hebben juist een zuurstofarm milieu nodig.
• Vochtigheid: de beschikbaarheid van water is voor bacteriën essentieel, met minder water kunnen ze zich minder snel voortplanten.
• Temperatuur: beneden 0° Celsius vormen bacteriënendosporen;tussen 30 °C en 40 °C delen ze het snelst, bij verhitting boven 70 °C gaan ze dood.
• Zuurgraad: de meeste bacteriën gedijen optimaal bij een neutralepH,maar er zijn uitzonderingen, bijvoorbeeld demelkzuurbacterie.
• Voedingsstoffen: bacteriën komen voor op alle mogelijke voedingsbodems. De meeste bacteriën zijnheterotroof,sommige bacteriën zijn echter zelfvoorzienend (autotroof) viafotosynthese.
• Ultraviolettestraling: na blootstelling aan ultraviolette straling gaan bacteriën direct dood.

Bacteriën kunnen verschillende eisen stellen aan hetmilieuom er te kunnen groeien. Voldoet de omgeving hier niet aan, dan zullen bepaalde bacteriën zich niet vestigen of niet groeien. Omgekeerd kunnen gunstigemilieufactorende groei en vermenigvuldiging weer stimuleren. Volgens deBaas Becking-hypothese geldt voor bacteriën: "Alles is overal, maar het milieu selecteert".

Temperatuur

Naar gevoeligheid voortemperatuurworden er drie groepen bacteriën onderscheiden:

• psychrofiele bacteriën met een temperatuurbereik van 5° tot 30° Celsius. Bacteriën die problemen geven bij opslag van voedsel in de koelkast behoren tot deze groep. Ze kunnen bij deze relatief lage temperaturen nog groeien.
• mesofielebacteriën groeien optimaal tussen 15° en 50° Celsius. De meeste bacteriën behoren tot deze groep en zo ook de meeste voor de menspathogenebacteriën die een optimumtemperatuur van 35° tot 40° Celsius hebben.
• thermofielebacteriën waarvan de optimale temperatuur tussen de 50 en 60° Celsius ligt. In hete bronnen worden bacteriën gevonden die kunnen groeien bij temperaturen tot 90°C.

Zuurgraad

Wat de gevoeligheid voor dezuurgraadvan de omgeving betreft kunnen bacteriën ingedeeld worden als

• acidogeenis een micro-organisme dat uit voedselbronnenzurenkan vormen, wat depHdan doet dalen.
• acidofielis een micro-organisme dat nog goed kan groeien bij een lage pH.
• alkalifielis een micro-organisme dat goed kan groeien bij een hoge pH (9-11).

De meeste bacteriën groeien bij eenpHvan 7 en kunnen over het algemeen een pH bereik van 5 tot 8 tolereren.

Opgeloste stoffen

Deosmotische waardewordt bepaald door de concentratie opgeloste stof in de omgeving.

Zuurstof

Naar hun gevoeligheid voorzuurstofspanningworden bacteriën in vier groepen onderverdeeld:

• aeroob- kan uitsluitend gedijen onder aanwezigheid van zuurstof
• facultatief anaeroob- kan leven zowel mét als zonder zuurstof
• micro-aerofiel- hebben wel zuurstof nodig, maar wel in kleine hoeveelheden
• anaeroob- kunnen leven zonder zuurstof (aerotolarant) of kunnen uitsluitend zonder zuurstof overleven (obligaat anaeroob)

Voorkomen

Bacteriën komen op zeer veel plaatsen voor, maar 90% huist diep onder de grond, voornamelijk onder zee.Ook bekend is dat sommige bacteriën die normaal op planten leven, tijdelijk kunnen overleven in een extreme omgeving alsdonderwolken.

Voortplanting

Bacteriën planten zich voort doorbinaire deling.De bacterie deelt zich in twee cellen zodanig dat de celinhoud van elke nieuwe cel ofdochterceldezelfde is als demoedercel.Er zijn bacteriesoorten die zich onder gunstige omstandigheden elke 20 minuten kunnen delen.

Overleven

Verschillende bacteriesoorten hebben verschillende strategieën om te overleven in ongunstige omstandigheden. Sommige bacteriesoorten vormenendosporen:een inwendig (binnen decelwandgevormd) kapsel rond een deel van de celinhoud, waarmee ze, zelfs na tientallen jaren invriezen, of een uur koken, kunnen overleven. Onder gunstigere omstandigheden kiemt uit deendosporevervolgens een nieuwe bacterie. Veelziekteverwekkendebacteriën kunnen dit niet. Bij andere soorten kapselt de hele bacterie zich in, in eencyste.Zo kan de bacterie een kritieke periode overbruggen, doordat hij zich tijdelijk in een rusttoestand bevindt, met een stilgelegdestofwisseling.

Bacteriën die diep in deaardkorstleven hebben een beperkt voedselaanbod. Er zijn bacteriën bekend die in eensedimentleven dat al66 miljoen jaarbegraven is. De hoeveelheid beschikbaar voedsel is er zo gering, en daardoor de stofwisseling van de bacteriën zo traag, dat de bacteriën zich slechts eens in de duizend jaardelen.Het zijn hiermee de traagste organismen op aarde.

Er zijn bacteriën in het tropische deel van deGrote Oceaandiezuurstof consumeren,maar verwacht wordt dat meeste vandeze bacteriënvan sulfaat of ijzer leven.

Belang van bacteriën

In de natuur

• Saprofytenspelen een belangrijke rol bij het omzetten van dood organisch materiaal naar eenvoudige verbindingen.
• Bacteriën spelen een belangrijke rol in destikstofkringloop.

In het lichaam

• De darmflora bevat enkele bacteriepopulaties die een rol spelen in de spijsvertering.
• Sommige bacteriën bemoeilijken het overleven en de voortplanting van pathogene bacteriën.
• DeVeillonella-bacterie heeft een gunstig effect op het uithoudingsvermogen.

Ziekteverwekkers bij mens en dieren

Vele soorten bacteriën zijn altijd en overal aanwezig. Veel soorten zijn nooit problematisch, sommige zijn nuttig, andere kunnen bij ernstige verzwakking of andere speciale omstandigheden tot ziekteverschijnselen leiden (pathogeen), weer andere doen dat geregeld. Bij de celstofwisseling van bacteriën kunnen voor de mens schadelijketoxinesontstaan, met als gevolg ziektes alscholera,pest,tetanus.Er zijn veel bacteriën die normaal niet in of op de mens voorkomen en bij contact tot ziekteverschijnselen leiden. Ook kunnen bacteriën zich ongemerkt verspreiden viabacillendragersdie zelf geen last ondervinden, maar wel de bacterie overdragen viaontlasting,urine,bloedenspeeksel.

Tegen door bacteriën veroorzaakte ziekten worden meestalantibioticagebruikt. Demedische microbiologieis devakwetenschapdie zich met pathogene bacteriën bezighoudt.

Voorbeelden van pathogene bacteriën en door bacteriën veroorzaakte ziekten zijn:

• blauwalg
• Clostridium botulinumenbotulisme
• Legionella pneumophilaenlegionellose(veteranenziekte)

Tabel met enkele medisch van belang zijnde bacteriën

Bacteriën die medisch van belang zijn volgensBergey,1984
groep	familie	geslacht	soort	beschrijving
Spirocheten	Spirochaetaceae	Spirochaeta
		Treponema	T. pallidum	Spiraalvormig met fijne windingen,anaeroob
		Borrelia	B. burgdorferi	Spiraalvormig met grove windingen,aeroob
		Leptospira	L. interrogans	Spiraalvormig, fijne windingen, aeroob, sterk beweeglijk
Spirillenen gebogen bacteriën	Spirillaceae	Spirillum	S. minor	Spiraalvormig,polytrische,polaireflagellen
		Campylobacter	C. foetus	Eén flagel aan elke pool,micro-aerofiel
Gramnegatieve aerobe kokken en staafvormige bacteriën	Pseudomonadaceae	Pseudomonas	Ps. aeruginosa	Monotrich,oxidase+
	Niet bij eenfamilie ingedeelde geslachten	Alcaligenes	A. faecalis	Peritrich,bio-chemischeactiviteit
		Brucella	B. abortus	Klein, onbeweeglijk; stellen hoge eisen aanmedium
		Bordetella	B. pertussis
		Francisella	F. tularensis
	Neisseriaceae	Neisseria	N. meningitidis	Boonvormige diplokok, oxidase +
		Moraxella	M. lacunata	Diplostaaf, oxidase +
		Acinetobacter	A calcoacetius	Kokkoïd-staafvormig, oxidase -
Gramnegatieve facultatief anaerobe staafvormige bacteriën	Enterobacteriaceae	Escherichia	E. coli	Peritrich of onbeweeglijk; soms gekapseld,biochemischactief
		Salmonella	S. typhi
		Shigella	Sh. dysenteriae
		Klebsiella	K. pneumoniae
		Enterobacter	E. enterogenes
		Serratia	S. marcescens
		Proteus	P. mirabilis
		Yersinia	Y. pestis
			Y. enterocolitica
	Vibrionaceae	Vibrio	V. cholerae	Gekromd metpolaireflagellen, meestal monotrich, polair
		Aeromonas	A. hydrophila
	Niet bij een familie ingedeelde geslachten	Flavobacterium	F. meningoscepticum	Peritrich, geligepigmenten
		Haemophilus	H. influenzae	Klein, kokkoïd, X- en V-factorbehoefte
		Pasteurella	P. multocida	Onbeweeglijk, vaak bipolaire kleuring
		Streptobacillus	S. moniliformis	Klein; ketens en filamenten met verdikkingen
Gramnegatieve anaerobe bacteriën	Bacteroidaceae	Bacteroides	B. fragilis	Pleiomorf;uitglucoseproductie vanvetzuurmengsels
Gramnegatieve anaerobe kokken	Veillonellaceae	Veillonella	V. parvula	Soms boonvormig
Rickettsia's en chlamydia's
Mycoplasma's	Mycoplasmataceae	Mycoplasma	M. fermentans
			M. genitalium
			M. hominis
			M. pneumoniae
Grampositieve kokken
Straalzwammenof Actinobacteria en verwante organismen	Coryneforme groep	Corynebacterium	C. diphtheriae	Onregelmatige kleuring en vorm,katalase-
	Propionibacteriaceae	Propionibacterium	P. acnes	Onbeweeglijk, anaeroob ofaerotolerant
		Eubacterium	E. multiforme	Meestal onbeweeglijk, anaeroob
	Actinomycetaceae	Actinomyces	A. israelii	Anaeroob, vertakkingen
		Bifidobacterium	B. bifidum	Soms vertakt, bifurcaties
Mycobacteriën	Mycobacteriaceae	Mycobacterium	M. tuberculosis	Zuurresistent
	Streptomycetaceae	Streptomyces	S. albus	Sterkemyceliumvorming
Nocardioformen	Nocardiaceae	Nocardia	N. tenuis	Variabele myceliumvorming

Bestrijding van ziekteverwekkende bacteriën

In voedsel

Omdat bacteriënvoedseldoenrotten,waarbijtoxinesvrijkomen, worden ze bestreden met verschillendeconserveertechnieken.

• Steriliseren: het doden van micro-organismen door verhitting met vuur of stoom, of gebruik van ultraviolet licht (bacteriën sterven onmiddellijk na blootstelling aan uv-straling), of chemische middelen.
• Invriezen: bacteriën vermenigvuldigen zich minder snel bij minder optimale omgevingsfactoren. Door in te vriezen op -18 °C kan voedsel maanden goed blijven, omdat de bacteriën zich minder snel vermenigvuldigen, dan wel in eensporentoestandgaan.
• Bestralen:gammastralingofröntgenstralingworden toegepast als andere, eenvoudige manieren van conserveren niet aangewezen zijn.
• Konfijten: het toevoegen van suiker.
• Pekelen:het toevoegen van zout.
• Toevoegen vanconserveermiddelenof bewaarstoffen: stoffen die de houdbaarheid van levensmiddelen vergroten door ze te beschermen tegenmicro-organismen.

In het menselijk lichaam

Natuurlijke bestrijding

De eerste linie van verdediging is het vermijden van een bacteriëleinfectiedoor inachtneming van een goedehygiëne.Ieder mens loopt de kans ooit een bacteriële infectie oplopen.

De tweede linie van verdediging is dealgemene weerstand:huid enslijmvliezenvormen een barrière tegen micro-organismen,zoutzuurin de maag doodt micro-organismen, enfagocytennemen lichaamsvreemde deeltjes op, en doden ze vervolgens doorfagocytose.

Als de tweede linie de infectie niet onder controle krijgt, wordt despecifieke weerstanddoor hetlichaamingezet (de derde linie). Specifieke weerstand houdt in datB-lymfocyten(cellen van het immuunsysteem)antilichamenaanmaken tegen het specifieke soort bacterie, als reactie op de infectie. Deze antilichamen binden op de onbekende bacterie of met delen ervan, waardoor deze geneutraliseerd worden en moeilijker kunnen voortbewegen, waarna het afweersysteem ze kan uitschakelen. De gevormde antilichamen blijven in het lichaam aanwezig. De besmette persoon is dan immuun geworden tegen de specifieke bacteriesoort, echter niet per se levenslang.

Kunstmatige bestrijding

Bacteriën kunnen bestreden worden metantibiotica,de "vierde linie van verdediging". Als het immuunsysteem de bacterie niet onder controle krijgt, kan toegediende antibiotica de bacterie doden of ten minste verdere bacteriële groei verhinderen. Bacteriesoorten kunnen echterresistent worden tegen antibiotica.

Bij sterk verzwakte patiënten kan als laatsteserumtherapie,"vijfde linie van verdediging", worden ingezet om (noodzakelijke) tijd te winnen; dit zorgt echter niet voor immuniteit tegen de bacterie.

Bacteriële infecties kunnen ookpreventiefbehandeld worden, onder andere metvaccinaties:een sterk verzwakte bacterie wordt in het lichaam geïnjecteerd, wat een reactie van het immuunsysteem oplevert, met immuniteit tegen de betreffende bacteriesoort als resultaat; de immuniteit is echter niet altijd levenslang.

Uit oogpunt van preventie van bacteriële infectie kan een schaafwond worden gereinigd met zeep en koud stromend water,en vervolgens afgedekt worden met een pleister.

Een speciale vorm van kunstmatige bestrijding is defaagtherapie:bacteriofagenzijnvirussendie bacteriën specifiek kunnen uitschakelen. Faagtherapie is beter dan therapie met antibiotica, omdat bacteriën daartegen resistent kunnen worden; echter niet tegen virussen. Bacteriofagen schakelen alleen bepaalde pathogene (ziekteverwekkende) bacteriën uit, antibiotica alle bacteriën. Het enige nadeel van faagtherapie is de kostprijs, voor iedere bacteriesoort moet een aparte faagtherapie ontwikkeld en getest worden.

Plantenziekten

Bacteriën kunnen ookplantenziektenveroorzaken. Bestrijding is eigenlijk niet mogelijk omdat antibiotica niet voorhanden zijn. De ziekten zijn vrij besmettelijk. Hygiënisch werken is de manier om verspreiding te voorkomen. Voorbeelden zijn:

• bacterievuur(doorErwinia amylovora) vooral bij peer en meidoorn
• watermerkziekte(doorBrenneria salicis,synoniem:Erwinia salicis) bij wilgensoorten
• vetvlekkenziekte(doorPseudomonas syringaesubsp.savastanoi) bij bonen
• bacteriekanker(doorPseudomonas syringae) bij pruim, perzik en kers
• geelziek(doorXanthomonas hyacinthi) bij hyacint

Taxonomie

Bacteriën worden onderscheiden naar vorm (morfologie), voedingswijze (metabolisme), en in de modernetaxonomievooral naar de samenstelling van hun DNA.In de loop van detaxonomischewetenschapsgeschiedeniszijn de bacteriën op verschillende wijzen ingedeeld. In grote lijnen komen de indelingen echter overeen.

De bacteriën worden ingedeeld naarfylum,klasse,subklasse,orde,suborde,familie,tribus (geslachtengroep),geslachtensoort.In deBacteriological Codekomen verder de rangenonderfamilieensubtribusvoor, maar deze worden niet gebruikt.

Soorten worden nog verder onderverdeeld inondersoorten.Ondersoorten worden aangeduid met een toevoeging aan de tweedelige soortnaam, bijvoorbeeldCampylobacter pylorisubsp.mustelae.Zo ontstaat eenternaire naam.

De term(bacterie)stamverwijst naar een zuivere"cultuur",in eenmicrobiologischlaboratorium,van genetisch identieke bacteriën van één bacterie-soort. Een "cultuur" van identieke bacteriën wordt verkregen door eenreincultuur.

Bij een stam wordt aan de soortnaam van de oorspronkelijke soort een naam of letter-cijfercombinatie toegevoegd, bijvoorbeeldLactobacillus caseiShirota ofBifidobacterium longumBB536.

Nomenclatuur

Denaamgevingis internationaal geregeld in deInternational Code of Nomenclature of Bacteria(Bacteriological Code).Alle erkende soorten die voldoen aan deze nomenclatuur worden na goedkeuring gepubliceerd in deInternational Journal of Systematic and Evolutionary Microbiology(IJSEM) en opgenomen in deApproved Lists of Bacterial Names(Skerman et al., 1980).

De namen van rangen komen tot stand door aan de naam van het geslacht een suffix toe te voegen:

Rang	Engels	Wetensch.	Suffix	Voorbeeld
Stam,fylum	phylum	phylum	-
Klasse	class	classis	-
Subklasse	subclass	subclassis	-
Orde	order	ordo	-ales	Pseudomonadales
Suborde	suborder	subordo	-ineae	Pseudomonadineae
Familie	family	familia	-aceae	Pseudomonadaceae
Onderfamilie	subfamily	subfamilia	-oideae	Pseudomonadoideae
Tribus	tribe	tribus	-eae	Pseudomonadeae
Subtribus	subtribe	subtribus	-inae	Pseudomonadinae
Geslacht	genus	genus	-	Pseudomonas
Ondergeslacht	subgenus	subgenus	(subgen.)	Pseudomonas(subgen. novum)
Soort	species	species	-	Pseudomonas aeruginosa
Ondersoort	subspecies	subspecies	(subsp.)	Pseudomonas aeruginosasubsp.novum

Zie ook

• Bacteriëmie

Referenties

Literatuur

• (en)Alberts, B.(2022).Molecular Biology of The Cell,7th. W.W. Norton & Company, "Pathogens and Infection".ISBN 978-0-393-42708-0.
• (en)Madigan MT, Bender KS, Buckley DH.(2019).Brock Biology of Microorganisms,15th. Pearson.ISBN 978-1-292-23510-3.
• (nl)Hoepelman A, Kroes A, Sauerwein R.(2016).Microbiologie en infectieziekten,4. Bohn Stafleu van Loghum.ISBN 978-90-368-1116-3.
• (en)Pommerville, JC.(2014).Fundamentals of Microbiology,10th. Jones and Bartlett, Boston.ISBN 978-1-284-03968-9.

Mediabestanden

Zie de categorieBacteriavanWikimedia Commonsvoor mediabestanden over dit onderwerp.