Przejdź do zawartości

DAPI

Z Wikipedii, wolnej encyklopedii
DAPI
Ogólne informacje
Wzór sumaryczny

C16H15N5

Masa molowa

277,32 g/mol

Wygląd

żółty proszek[1]

Identyfikacja
Numer CAS

47165-04-8
28718-90-3(chlorowodorek)

PubChem

2954

Jeżeli nie podano inaczej, dane dotyczą
stanu standardowego(25 °C, 1000 hPa)

DAPI(4',6-diamidyno-2-fenyloindol) –organiczny związek chemiczny,aromatyczna,heterocyklicznaaminastosowana jakobarwnikfluorescencyjnysilnie wiążący się doDNA(dwuniciowego) na zasadzieinterkalacji[2][3].

Zastosowanie

[edytuj|edytuj kod]
DAPI (fioletowy) związany z małą bruzdąpodwójnej helisyDNA (zielony i niebieski).
Jądra komórkowewybarwione DAPI (niebieskie).

Powszechnie używany do wybarwianiająder komórkowychlubchromosomów(poprzez wizualizację DNA) wmikroskopii fluorescencyjnej[4].Ponieważ DAPI przenika przez nienaruszonebłony biologiczne,może być używany do wybarwiania zarówno żywychkomórekjak i utrwalonych[5].

W mikroskopii fluorescencyjnej DAPI jest wzbudzany światłemultrafioletowym.Związany do DNA ma maksimumabsorpcjiprzypadające nadługość faliświetlnejrówną 358nm,a maksimumemisjiprzy 461 nm (kolor niebiesko-fioletowy). DAPI wiąże się także doRNA,aczkolwiek słabiej. Maksimum emisji DAPI związanego z RNA jest przesunięte do około 400 nm[6].

Niebieska emisja DAPI jest bardzo wygodna w obrazowaniu fluorescencyjnym przy użyciu kilku różnych barwników jednocześnie, ponieważ nie pokrywa się ona z emisją innych popularnychfluoroforów(na przykład zielonymGFPczyfluoresceiną).

Poza wybarwianiem jąder komórkowych, DAPI jest także używane do wykrywaniamykoplazm[7]lubwirusów(także na zasadzie wiązania ich DNA)[8]wkulturach komórkowych.

Ponieważ DAPI wiąże się bardzo ściśle z DNA na zasadzie interkalacji i tym samym zaburza jego strukturę, związek ten jest toksyczny imutagenny.Przy pracy z DAPI powinno się zachować szczególną ostrożność.

Przypisy

[edytuj|edytuj kod]
  1. DAPI (nr D9542)– karta charakterystyki produktu Sigma-Aldrich (Merck) na obszar Polski.
  2. P. Chandra, B. Mildner, O. Dann, A. Metz.Influence of 4'-6'-diamidino-2-phenylindole on the secondary structure and template activities of DNA and polydeoxynucleotides.„Molecular and Cellular Biochemistry”. 18 (2-3), s. 81-86, 1978.DOI:10.1007/BF00280272.PMID:604784.
  3. J. Kreuter, E. Liehl.Protection induced by inactivated influenza virus vaccines with polymethylmethacrylate adjuvants.„Medical Microbiology and Immunology”. 165 (2), s. 111-117, 1978.DOI:10.1007/BF02122746.PMID:672773.
  4. M.S. Lin, O. S. Alfi, G. N. Donnell.Differential fluorescence of sister chromatids with 4'-6-diamidino-2-phenylindole.„Canadian Journal of Genetics and Cytology”. 18 (3), s. 545-547, 1977.DOI:10.1139/g76-068.PMID:63310.
  5. H. M. Hull, R. W. Hoshaw, J. C. Wang.Cytofluorometric determination of nuclear DNA in living and preserved algae.„Stain Technology”. 57 (5), s. 273-282, 1983.DOI:10.3109/10520298209066723.PMID:6758206.
  6. G. Manzini, L. Xodo, M. L. Barcellona, F. Quadrifoglio.Interaction of DAPI with double-stranded ribonucleic acids.„Nucleic Acids Research”.13 (24), s. 8955-8967, 1986.DOI:10.1093/nar/13.24.8955.PMID:4080554.PMCID:PMC318964.
  7. M. Jagielski, M. Zaleska, S. Kaluzewski, I. Polna.Ocena przydatności DAPI do wykrywania mykoplazm w hodowlach komórkowych.„Medycyna Doświadczalna i Mikrobiologia”. 28 (2), s. 161-173, 1976.PMID:775226.
  8. B. Mildner, P. Chandra.[Molecular mechanism of action of diamidinephenylindole (DAPI). II. Effect of DAPI on the template activity of DNA and polydeoxynucleotides in the DNA-polymerase system from bacteria, eukaryotic cells and RNA tumor viruses].„Cell Mol Biol Incl Cyto Enzymol”. 25 (6), s. 399-407, 1980.PMID:94275.(niem.).