Sari la conținut

Regn

De la Wikipedia, enciclopedia liberă
Ierarhia clasificării biologice a celor opt ranguri taxonomice majore. Un domeniu conține unul sau mai multe regnuri. Clasamentele intermediare minore nu sunt afișate.

Înbiologie,regnul(latină:regnum,pluralregna) este al doilea rang taxonomic, dupădomeniu.Regnurile sunt împărțite în grupuri mai mici numiteîncrengăturisau filumuri. În mod tradițional, unele manuale din Statele Unite și Canada folosesc un sistem de șase regnuri (Animalia,Plantae,Fungus,Protista,ArchaeașiBacteria) în timp ce manualele din Marea Britanie, India, Grecia, Brazilia și alte țări folosesc numai cinci regnuri (Animalia,Plantae,Fungus,ProtistașiMonera). Unele clasificări recente bazate pecladisticamodernă au abandonat în mod explicit termenul deregn,observând că regnurile tradiționale nu suntmonofiletice,ceea ce înseamnă că nu sunt formate din toți descendenții unui strămoș comun.

Definiție și termeni asociați

[modificare|modificare sursă]

CândCarl Linnaeusa introdus sistemul de nomenclatură bazat pe rang în biologie în 1735, cel mai înalt rang a primit numele de „regn” și a fost urmat de alte patru ranguri principale:clasă,ordin,genșispecie.[1]Ulterior au fost introduse alte două ranguri principale, clasificarea devenind astfel: regn,filum sau încrengătură,clasă, ordin,familie,gen și specie.[2]În 1990, deasupra regnului a fost introdus rangul dedomeniu.[3]

PSe pot adăuga prefixe, astfel încâtsubregnul(subregnum) șiinfraregnul(cunoscut și sub numele deinfraregnum) sunt cele două poziții imediat sub regn. În unele sisteme de clasificare,ramura(latină:ramus) poate fi inserată între subregn și infraregn, de exemplu,ProtostomiașiDeuterostomiaîn clasificarea Cavalier-Smith.[4]

Sistemul celor două regnuri

[modificare|modificare sursă]

Clasificarea ființelor vii în animale și plante este una antică.Aristotel(384-322 î.Hr.) a clasificat speciile de animale înIstoria animalelor,în timp ce elevul săuTeofrast(c. 371 – c. 287 î.Hr.) a scris o lucrare paralelă,Historia Plantarum,despre plante.[5]

Carl Linnaeus(1707–1778) a pus bazele nomenclaturii biologice moderne, reglementate acum de codurile de nomenclatură, în 1735. El a distins două regnuri ale viețuitoarelor:Regnum Animale(„regnul animal” ) șiRegnum Vegetabile(„regnul vegetal”, pentru plante). Linnaeus a inclus șimineraleîn sistemul său de clasificare, plasându-le într-un al treilea regn,Regnum Lapideum.

Viață

RegnumAnimale(animale)

Regnum Vegetabile ('vegetale'/plante)

Non‑viață

Regnum Lapideum (minerale)

Sistemul celor trei regnuri

[modificare|modificare sursă]
Arborele celor trei regnuri ale vieții conform lui Haeckel (1866).

În 1674,Antonie van Leeuwenhoek,adesea numit „tatăl microscopiei”, a trimisSocietății Regale din Londrao copie a primelor sale observații ale organismelor microscopice unicelulare. Până atunci, existența unor astfel de organisme microscopice era în întregime necunoscută. În ciuda acestui fapt, Linnaeus nu a inclus nici un organism microscopic în taxonomia sa originală.

La început, organismele microscopice au fost clasificate în regnurile animale și vegetale. Cu toate acestea, la mijlocul secolului al XIX-lea, a devenit clar pentru mulți că „dihotomia existentă a regnurilor vegetale și animale [devenise] estompată rapid la granițele sale și depășită”.[6]

În 1860, John Hogg a propusProtoctista,un al treilea regn al vieții compus din „toate organismele inferioare sau ființe organice primare”; el a păstrat Regnum Lapideum ca al patrulea regn al mineralelor.[6]În 1866,Ernst Haeckela propus ca al treilea regn al vieții,Protista,pentru „organisme neutre” sau „regnul formelor primitive”, care nu erau nici animale, nici vegetale; el nu a inclus Regnum Lapideum în schema sa.[6]Haeckel a revizuit conținutul acestui regn de mai multe ori înainte de a se stabili la o diviziune bazată pe faptul dacă organismele erau unicelulare (Protista) sau multicelulare (animale și plante).[6]

Viață

RegnulProtistasau Protoctista

RegnulPlantae

RegnulAnimalia

Non‑viață

Regnum Lapideum (minerale)

Dezvoltarea microscopiei a relevat distincții importante între acele organisme ale căror celule nu au un nucleu distinct (procariote) și organismele ale căror celule au un nucleu distinct (eucariote). În 1937,Édouard Chattona introdus termenii „procariote” și „eucariote” pentru a diferenția aceste organisme.[7]

În 1938,Herbert Copelanda propus o clasificare cu patru regnuri prin crearea unui nou regnMoneraal organismelor procariote. În cartea sa din 1904,Minunile vieții,el a plasat algele albastre-verzi (sau Phycochromacea) în Monera; acest lucru va câștiga treptat acceptarea, iar algele albastre-verzi vor fi clasificate ca bacterii în filumCyanobacteria.[6][7]

În anii 1960,Roger StanierșiC. B. van Nielau promovat și popularizat lucrările anterioare ale lui Édouard Chatton, în special în lucrarea lor din 1962, „Conceptul Bacterium”; aceasta a creat, pentru prima dată, un rang deasupra regnului – un super-regn sau imperiu – cu un sistem de două imperii procariote și eucariote.[7]Sistemul cu două imperii va fi extins mai târziu la sistemul cu treidomenii:Archaea, Bacteria și Eukaryota.[8]

Viață
DomeniulProkaryota

RegnulMonera

DomeniulEukaryota

RegnulProtistasau Protoctista

RegnulPlantae

RegnulAnimalia

Unii au recunoscut diferențele dintreciuperciși alte organisme considerate plante. Haeckel mutase ciupercile din Plantae în Protista după clasificarea sa inițială,[6]dar această separare a fost ignorată de către oamenii de știință din vremea sa.Robert Whittakera recunoscut regnul suplimentar pentruciuperci.Sistemul rezultat cu cinci regnuri, propus în 1969 de Whittaker, a devenit un standard popular și cu oarecare rafinament este încă utilizat în multe lucrări și stă la baza noilor sisteme multiregionale. Se bazează în principal pe diferențele denutriție;plantele sale erau în mare parte multicelulare autotrofe, Animalia multicelulare heterotrofe și Fungi multicelulare saprotrofe.

Celelalte două regnuri, Protista și Monera, includeau colonii celulare unicelulare și simple.[9] Sistemul celor cinci regnuri poate fi combinat cu sistemul celor două imperii. În sistemul Whittaker, Plantae include câteva alge. În alte sisteme, cum ar fi sistemul de cinci regnuri al luiLynn Margulis,plantele includ doar plantele de uscat (Embryophyta), iar Protoctista are o definiție mai largă.[10]

După publicarea sistemului Whittaker, modelul celor cinci regnuri a început să fie utilizat în mod obișnuit în manualele de biologie de liceu.[11]În ciuda dezvoltării de la două regnuri la cinci în rândul celor mai mulți oameni de știință, unii autori încă din 1975 au continuat să folosească un sistem tradițional cu două regnuri de animale și plante, împărțind regnul plantelor în subregnul Prokaryota (bacterii și cianobacterii), Mycota (ciuperci și presupuse rude) și Chlorota (alge și plante terestre).[12]

Viață
DomeniulProkaryota

RegnulMonera

DomeniulEukaryota

RegnulProtistasau Protoctista

RegnulPlantae

RegnulFungi

RegnulAnimalia

În 1977,Carl Woeseși colegii săi au propus subdiviziunea fundamentală a procariotelor în Eubacteria (denumită ulterior Bacteria) și Archaebacteria (denumită ulterior Archaea), pe baza structuriiARN ribozomal;[13]acest lucru va duce mai târziu la propunerea a trei „domenii” ale vieții, Bacteria, Archaea și Eukaryota.[3]Combinat cu modelul cu cinci regnuri, acesta a creat un model cu șase regnuri, unde regnul Monera este înlocuit de regnurile Bacteria și Archaea.[14]Acest model cu șase regnuri este utilizat în mod obișnuit în manualele recente de biologie din liceul american, dar a primit critici pentru compromiterea consensului științific actual.[11]Dar împărțirea procariotelor în două regnuri rămâne în uz cu schema recentă de șapte regnuri a lui Thomas Cavalier-Smith, deși diferă în primul rând prin faptul că Protista este înlocuit deProtozoașiChromista.[15]

Viață
DomeniulProkaryota

RegnulEubacteria(Bacteria)

RegnulArchaebacteria(Archaea)

DomeniulEukaryota

RegnulProtistasau Protoctista

RegnulPlantae

RegnulFungus

RegnulAnimalia

Thomas Cavalier-Smitha susținut consensul la acel moment, că diferența dintre Eubacteria și Archaebacteria era atât de mare (în special având în vedere distanța genetică a genelor ribozomale) încât procariotele trebuiau separate în două regnuri diferite. Apoi a împărțit Eubacteria în două subregnuri: Negibacteria (Bacterie Gram-negativă) și Posibacteria (Bacterie Gram-pozitivă). Progresele tehnologice în microscopia electronică au permis separarea Chromista de regnul Plantae.

În cele din urmă, au fost descoperiți uneleprotistelipsite de mitocondrii.[16]Întrucât mitocondriile erau cunoscute ca fiind rezultatul endosimbiozei unei proteobacterii, s-a crezut că aceste eucariote amitocondriale au fost primitive, marcând un pas important în eucariogeneză. Drept urmare, aceste protiste amitocondriate au fost separate din regnul protiste, dând naștere, în același timp, superregnului și regnuluiArchezoa.Acest super-regn s-a opus super-regnului Metakaryota, grupând celelalte cinci regnuri eucariote (Animalia, Protozoa, Fungi, Plantae și Chromista).

Aceasta a fost cunoscută sub numele de ipoteza Archezoa, care a fost abandonată de atunci;[17]schemele ulterioare nu au inclus diviziunea Archezoa-Metakaryota.[4][15]

Viață
Super-regnulProkaryota
Super-regnulArchezoa

RegnulArchezoa

Super-regnulMetakaryota

RegnulProtozoa

RegnulChromista

RegnulPlantae

RegnulFungi

RegnulAnimalia

† Nu mai este recunoscut detaxonomi.

Șase regnuri (1998)

[modificare|modificare sursă]

În 1998, Cavalier-Smith a publicat un model cu șase regnuri,[4]care a fost revizuit în lucrările ulterioare. Versiunea publicată în 2009 este prezentată mai jos.[18][a][19]Cavalier-Smith nu a mai acceptat importanța diviziunii fundamentale Eubacteria-Archaebacteria propusă de Woese și alții și susținută de cercetări recente.[20]RegnulBacteria(singurul regn al domeniului Prokaryota) a fost împărțit în două subregnuri în funcție de topologiile membranelor: Unibacteria și Negibacteria. Unibacteria a fost împărțită în filum Archaebacteria și Posibacteria.

Cavalier-Smith nu acceptă necesitatea ca taxonii să fie monofiletici („holofiletici” în terminologia sa) pentru a fi valabili. El definește Prokaryota, Bacteria, Negibacteria, Unibacteria și Posibacteria ca fiind taxoni valabili (deci „monofiletici” în sensul în care folosește acest termen), marcând inovații importante de semnificație biologică (în ceea ce privește conceptul de nișă biologică).

În același mod, regnul său parafiletic Protozoa include strămoșii Animalia, Fungi, Plantae și Chromista. Progresele studiilor filogenetice i-au permis lui Cavalier-Smith să-și dea seama că toate filumurile considerate arhezoa (adică eucariote primitiv amitocondrate) își pierduseră, de fapt, în mod secundar mitocondriile, de obicei transformându-le în organite noi: Hidrogenozomii. Aceasta înseamnă că toate eucariotele vii sunt de fapt metacariote, în funcție de semnificația termenului dat de Cavalier-Smith. Unii dintre membrii fostului regn Archezoa, precum filumul Microsporidia, au fost reclasificați în regnul Fungi. Altele au fost reclasificate în regnul Protozoarelor, cum ar fi Metamonada, care face acum parte din infraregnul Excavata.

Deoarece Cavalier-Smith permite parafilia, diagrama de mai jos este o „diagramă organizatorică”, nu o „diagramă de ascendență” și nu reprezintă un arbore evolutiv.

Cavalier-Smith și colaboratorii săi și-au revizuit clasificarea în 2015. În această schemă au reintrodus împărțirea procariotelor în două regnuri,Bacteria(= Eubacteria) șiArchaea(= Archaebacteria). Acest lucru se bazează pe consensul în schema taxonomică a Bacteria și Archaea (TOBA) și în Catalogul vieții.[15]

Linnaeus
1735[21]
Haeckel
1866[22]
Chatton
1925[23][24]
Copeland
1938[25][26]
Whittaker
1969[27]
Woeseet al.
1977[28][29]
Woeseet al.
1990[30]
Cavalier-Smith
1993[31][32][33]
Cavalier-Smith
1998[34][35][36]
Ruggieroet al.
2015[37]
(netratat) (netratat) 2 domenii 2 domenii 2 domenii 2 domenii 3 domenii 3 domenii 2 domenii 2 domenii
2 regnuri 3 regnuri (netratat) 4 regnuri 5 regnuri 6 regnuri (netratat) 8 regnuri 6 regnuri 7 regnuri
(netratat) Protista Prokaryota Monera Monera Eubacteria Bacteria Eubacteria Bacteria Bacteria
Archaebacteria Archaea Archaebacteria Archaea
Eukaryota Protista Protista Protista Eucarya Archezoa Protozoa Protozoa
Protozoa
Chromista Chromista Chromista
Vegetabilia Plantae Plantae Plantae Plantae Plantae Plantae Plantae
Fungi Fungi Fungi Fungi Fungi
Animalia Animalia Animalia Animalia Animalia Animalia Animalia Animalia

Clasificarea vieții la nivel de regn este încă utilizată pe scară largă ca mod util de grupare a organismelor, în ciuda unor probleme cu această abordare:

  • Regnurile, cum ar fi Protozoa, reprezintă grade evoluționare mai degrabă decâtcladeși astfel sunt respinse de sistemele declasificare filogenetică.
  • Cele mai recente cercetări nu acceptă clasificarea eucariotelor în nici unul dintre sistemele standard. În aprilie 2010 se considera că nici un set de regnuri nu este suficient susținut de cercetare pentru a obține o acceptare pe scară largă. În 2009, Andrew Roger și Alastair Simpson au subliniat necesitatea diligenței în analiza noilor descoperiri: „Cu ritmul actual de schimbare în înțelegerea arborelui eucariot al vieții, ar trebui să procedăm cu prudență”.[38]
  1. ^Compared to the version Cavalier-Smith published in 2004, the alveolates and the rhizarians have been moved from Kingdom Protozoa to Kingdom Chromista.
  1. ^Linnaeus, C. ().Systemae Naturae, sive regna tria naturae, systematics proposita per classes, ordines, genera & species.
  2. ^See e.g.McNeill, J.; et al., ed. ().International Code of Botanical Nomenclature (Vienna Code) adopted by the Seventeenth International Botanical Congress, Vienna, Austria, July 2005(ed. electronic). Vienna: International Association for Plant Taxonomy. Arhivat dinoriginalla.Accesat în.,„article 3.1”.
  3. ^abWoese, C.R.; Kandler, O.; Wheelis, M.L. ().„Towards a natural systs: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya”.Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America.87(12): 4576–9.Bibcode:1990PNAS...87.4576W.doi:10.1073/pnas.87.12.4576.PMC54159Accesibil gratuit.PMID2112744.
  4. ^abcCavalier-Smith, T. ().„A revised six-kingdom system of life”.Biological Reviews.73(3): 203–66.doi:10.1111/j.1469-185X.1998.tb00030.x.PMID9809012.
  5. ^Singer, Charles J. ().A short history of biology, a general introduction to the study of living things.Oxford: Clarendon Press.OCLC1197036.
  6. ^abcdefScamardella, Joseph M. (). „Not plants or animals: a brief history of the origin of Kingdoms Protozoa, Protista and Protoctista”.International Microbiology.2(4): 207–16.PMID10943416.
  7. ^abcSapp, J. ().„The Prokaryote-Eukaryote Dichotomy: Meanings and Mythology”.Microbiology and Molecular Biology Reviews.69(2): 292–305.doi:10.1128/MMBR.69.2.292-305.2005.PMC1197417Accesibil gratuit.PMID15944457.
  8. ^Stanier, R.Y.; Van Neil, C.B. (). „The concept of a bacterium”.Archiv für Mikrobiologie.42(1): 17–35.doi:10.1007/BF00425185.PMID13916221.
  9. ^Whittaker, R.H. (ianuarie 1969). „New concepts of kingdoms or organisms. Evolutionary relations are better represented by new classifications than by the traditional two kingdoms”.Science.163(3863): 150–60.Bibcode:1969Sci...163..150W.CiteSeerX10.1.1.403.5430Accesibil gratuit.doi:10.1126/science.163.3863.150.PMID5762760.
  10. ^Margulis, Lynn; Chapman, Michael J. ().Kingdoms and Domains: An Illustrated Guide to the Phyla of Life on Earth.Academic Press.ISBN9780080920146.
  11. ^abCase, Emily ().„Teaching Taxonomy: How Many Kingdoms?”.American Biology Teacher(în engleză). pp. 472–477.Accesat în.
  12. ^Palmer, E. Laurence; Fowler, Seymour H (ianuarie 1975).Fieldbook of Natural HistoryNecesită înregistrare gratuită(ed. 2nd). McGraw-Hill.ISBN978-0-070-48425-2.
  13. ^Balch, W.E.; Magrum, L.J.; Fox, G.E.; Wolfe, C.R.; Woese, C.R. (august 1977). „An ancient divergence among the bacteria”.J. Mol. Evol.9(4): 305–11.Bibcode:1977JMolE...9..305B.doi:10.1007/BF01796092.PMID408502.
  14. ^„The Six Kingdoms”.www.ric.edu.Rhode Island College. Arhivat dinoriginalla.Accesat în.
  15. ^abcRuggiero, Michael A.; Gordon, Dennis P.; Orrell, Thomas M.; Bailly, Nicolas; Bourgoin, Thierry; Brusca, Richard C.; Cavalier-Smith, Thomas; Guiry, Michael D.; Kirk, Paul M.; Thuesen, Erik V. ().„A higher level classification of all living organisms”.PLOS ONE.10(4): e0119248.Bibcode:2015PLoSO..1019248R.doi:10.1371/journal.pone.0119248.PMC4418965Accesibil gratuit.PMID25923521.
  16. ^Cavalier-Smith, Thomas (). „Eucaryotes with no mitochondria”.Nature.326(6111): 332–333.Bibcode:1987Natur.326..332C.doi:10.1038/326332a0Accesibil gratuit.PMID3561476.
  17. ^Poole, Anthony; Penny, David ().„Engulfed by speculation”(PDF).Nature.447(7147): 913.doi:10.1038/447913a.PMID17581566.Arhivat dinoriginal(PDF)la.Accesat în.
  18. ^Cavalier-Smith, Thomas ().„Kingdoms Protozoa and Chromista and the eozoan root of the eukaryotic tree”.Biology Letters.6(3): 342–345.doi:10.1098/rsbl.2009.0948.PMC2880060Accesibil gratuit.PMID20031978.
  19. ^Cavalier-Smith, T. ().„Only six kingdoms of life”(PDF).Proceedings of the Royal Society of London B.271(1545): 1251–1262.doi:10.1098/rspb.2004.2705.PMC1691724Accesibil gratuit.PMID15306349.Accesat în.
  20. ^Dagan, T.; Roettger, M.; Bryant; Martin, W. ().„Genome Networks Root the Tree of Life between Prokaryotic Domains”.Genome Biology and Evolution.2:379–92.doi:10.1093/gbe/evq025.PMC2997548Accesibil gratuit.PMID20624742.
  21. ^Linnaeus, C. ().Systemae Naturae, sive regna tria naturae, systematics proposita per classes, ordines, genera & species.
  22. ^Haeckel, E. ().Generelle Morphologie der Organismen.Reimer, Berlin.
  23. ^Chatton, É. (). „Pansporella perplexa.Réflexions sur la biologie et la phylogénie des protozoaires”.Annales des Sciences Naturelles - Zoologie et Biologie Animale.10-VII: 1–84.
  24. ^Chatton, É. ().Titres et Travaux Scientifiques (1906–1937).Sette, Sottano, Italy.
  25. ^Copeland, H. (). „The kingdoms of organisms”.Quarterly Review of Biology.13:383–420.doi:10.1086/394568.
  26. ^Copeland, H. F. ().The Classification of Lower Organisms.Palo Alto: Pacific Books. p. 6.doi:10.5962/bhl.title.4474.
  27. ^Whittaker, R. H. (ianuarie 1969). „New concepts of kingdoms of organisms”.Science.163(3863): 150–60.Bibcode:1969Sci...163..150W.doi:10.1126/science.163.3863.150.PMID5762760.
  28. ^Woese, C. R.; Balch, W. E.; Magrum, L. J.; Fox, G. E.; Wolfe, R. S. (august 1977). „An ancient divergence among the bacteria”.Journal of Molecular Evolution.9(4): 305–311.Bibcode:1977JMolE...9..305B.doi:10.1007/BF01796092.PMID408502.
  29. ^Woese, C. R.; Fox, G. E. (noiembrie 1977).„Phylogenetic structure of the prokaryotic domain: the primary kingdoms”.Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America.74(11): 5088–90.Bibcode:1977PNAS...74.5088W.doi:10.1073/pnas.74.11.5088.PMC432104Accesibil gratuit.PMID270744.
  30. ^Woese, C.; Kandler, O.; Wheelis, M. ().„Towards a natural system of organisms: proposal for the domains Archaea, Bacteria, and Eucarya”.Proceedings of the National Academy of Sciences of the United States of America.87(12): 4576–9.Bibcode:1990PNAS...87.4576W.doi:10.1073/pnas.87.12.4576.PMC54159Accesibil gratuit.PMID2112744.
  31. ^Cavalier-Smith, T. (). „Eukaryote kingdoms: seven or nine?”.Bio Systems.14(3–4): 461–481.doi:10.1016/0303-2647(81)90050-2.PMID7337818.
  32. ^Cavalier-Smith, T. (). „Origins of secondary metabolism”.Ciba Foundation symposium.171:64–80; discussion 80–7.PMID1302186.
  33. ^Cavalier-Smith, T. ().„Kingdom protozoa and its 18 phyla”.Microbiological reviews.57(4): 953–994.doi:10.1128/mmbr.57.4.953-994.1993.PMC372943Accesibil gratuit.PMID8302218.
  34. ^Cavalier-Smith, T. (),„A revised six-kingdom system of life”,Biological Reviews,73(03): 203–66,doi:10.1111/j.1469-185X.1998.tb00030.x,PMID9809012
  35. ^Cavalier-Smith, T. (),„Only six kingdoms of life”(PDF),Proceedings of the Royal Society B: Biological Sciences,271:1251–62,doi:10.1098/rspb.2004.2705,PMC1691724Accesibil gratuit,PMID15306349,accesat în
  36. ^Cavalier-Smith T (iunie 2010).„Kingdoms Protozoa and Chromista and the eozoan root of the eukaryotic tree”.Biol. Lett.6(3): 342–5.doi:10.1098/rsbl.2009.0948.PMC2880060Accesibil gratuit.PMID20031978.
  37. ^Ruggiero, Michael A.; Gordon, Dennis P.; Orrell, Thomas M.; Bailly, Nicolas; Bourgoin, Thierry; Brusca, Richard C.; Cavalier-Smith, Thomas; Guiry, Michael D.; Kirk, Paul M.; Thuesen, Erik V. ().„A higher level classification of all living organisms”.PLOS ONE.10(4): e0119248.Bibcode:2015PLoSO..1019248R.doi:10.1371/journal.pone.0119248.PMC4418965Accesibil gratuit.PMID25923521.
  38. ^Roger, A.J.; Simpson, A.G.B. (). „Evolution: Revisiting the Root of the Eukaryote Tree”.Current Biology.19(4): R165–7.doi:10.1016/j.cub.2008.12.032.PMID19243692.

Legături externe

[modificare|modificare sursă]