Пређи на садржај

KEGG

С Википедије, слободне енциклопедије

KEGG(Kjoto enciklopedija gena i genoma) je kolekcijaonlajn baza podatakakoje obuhvataju oblastigenoma,enzimatskih puteva,i bioloških jedinjenja.PATHWAYbaza podataka sadrži mrežumolekulskih interakcijau ćelijama, i njihovih varijanti u specifičnim organizmima.

Japanski program za ljudski genom je osnovao KEGG,Kjotoenciklopediju gena i genoma,1995.godine[1].Njeni osnivači smatraju KEGG "računarskom reprezentacijom"biološkog sistema[2].KEGG nalazi primenu u modelovanju i simulacijama, kao i u pregledu i pretraživanju podataka. On je komponentasistemsko biološkogpristupa.

KEGG sadrži pet glavnih baza podataka:[3]

  • KEGG Atlas
  • KEGG Put
  • KEGG Geni
  • KEGG Ligand
  • KEGG BRITE
  1. ^Kanehisa M (1997).„A database for post-genome analysis.”.Trends Genet.13(9): 375—6.PMID9287494.
  2. ^Kanehisa M; Goto S; Hattori M; Aoki-Kinoshita KF; Itoh M; Kawashima S; et al. (2006).„From genomics to chemical genomics: new developments in KEGG.”.Nucleic Acids Res.34(Database issue): D354—7.PMC1347464Слободан приступ.PMID16381885.doi:10.1093/nar/gkj102.
  3. ^Kanehisa M, Goto S, Kawashima S, Okuno Y, Hattori M (2004).„The KEGG resource for deciphering the genome.”.Nucleic Acids Res.32(Database issue): D277—80.PMC308797Слободан приступ.PMID14681412.doi:10.1093/nar/gkh063.