Mali molekul

Glosar dokovanja
•Receptorilidomaćinilibrava– Primajućimolekul,najčešćeproteinili drugibiopolimer.
•Ligandiligostiliključ– Komplementarni partner molekula koji sevezujeza receptor. Ligandi su najčešćemali molekuliali mogu takođe da budu drugi biopolimeri.
•Doking– Računska simulacija kandidata vezivanja liganda za receptor.
•Mod vezivanja– Orijentacija liganda relativno na receptor kao ikonformacijaliganda i receptora kad su vezani jedan za drugi.
•Poze– Kandidat moda vezivanja.
•Vrednovanje– Proces evaluacije pojedine poze uzimajući u obzirintermolekulske interakcijekao što suvodonične vezeihidrofobnekontakte.
•Rangiranje– Proces klasifikovanja liganda.
edit

Umolekularnoj biologijiifarmakologiji,mali molekuljeorgansko jedinjenjemale molekulske težine (<900daltona^[1]) koje se koristi za regulaciju bioloških procesa, sa veličinom reda6991100000000000000♠10⁻⁹m.Većinalekovasu mali molekuli.

Gornja granica molekulske težine za male molekule je približno 900 daltona, što otvara mogućnost za brzu difuziju kroz ćelijske membrane tako da oni mogu da dosegnu do svojihintracelularnihmesta dejstva.^[1]^[2]Dodatno, ovo ograničenje u pogledu molekulske težine je neophodan, ali dovoljan uslov za oralnubioraspoloživost.Konačno, granica molekulske težine od 500 daltona (kao deo „pravila petice“) se preporučuje za razvoj malih molekula kao kandidata za lekove na bazi praćenja kliničke stope neuspeha, koja je znatno umanjena ako se molekulska težina drži ispod 500 daltona.^[3]^[4]

Farmakologijaobično ograničava termin na molekule koji se vezuju za specifičnibiopolimer— kao što jeproteinilinukleinska kiselina— i deluju kaoefektori,menjajući aktivnost ili funkciju biopolimera. Mali molekuli mogu da imaju raznovrsne biološke funkcije, služeći kaoćelijski signalnimolekuli, kaolekoviumedicini,kaopesticidiupoljoprivredi,i mnoštvo drugih uloga. Ta jedinjenja mogu da budu prirodna (kao što susekundarni metaboliti) ili veštačka (kao što suantiviralni lekovi); ona mogu da imaju korisno dejstvo u suzbijanju bolesti (kao što sulekovi) ili mogu da budu detrementalna (kao što suteratogeniikarcinogeni). Biopolimeri kao što sunukleinske kiselineiproteini,ipolisaharidi(poputskrobailiceluloze) nisu mali molekuli — mada se njihovi konstituentni monomeri — ribo- ili dezoksiribonukleotidi,aminokiseline,i monosaharidi, respektivno — normalno smatraju malim molekulima. Veoma malioligomerise isto tako obično smatraju malim molekulima, na primer dinukleotidi,peptidikao što je antioksidantglutation,i disaharidi kao što jesaharoza.

Mali molekuli se isto tako mogu koristiti kao istraživačka oruđa za ispitivanjebiološke funkcije,kao ivodeća jedinjenjau razvoju novihterapeutskih agenasa.Neki od njih mogu da inhibiraju specifičnu funkciju multifunkcionalnog proteina ili da onemogućavajuprotein–protein interakcije.^[5]

Vidi još

Reference

^^а ^бMacielag MJ (2012).„Chemical properties of antibacterials and their uniqueness”.Ур.: Dougherty TJ, Pucci MJ.Antibiotic Discovery and Development.стр. 801—2.ISBN 978-1-4614-1400-1.„The majority of [oral] drugs from the general reference set have molecular weights below 550. In contrast the molecular weight distribution of oral antibacterial agents is bimodal—between 340 and 450 Da but with another group in the 700–900 molecular weight range.”
^Veber DF, Johnson SR, Cheng HY, Smith BR, Ward KW, Kopple KD (jun 2002). „Molecular properties that influence the oral bioavailability of drug candidates”.J. Med. Chem.45(12): 2615—23.PMID 12036371.doi:10.1021/jm020017n.
^Lipinski CA (decembar 2004). „Lead-and drug-like compounds: the rule-of-five revolution”.Drug Discovery Today: Technologies.1(4): 337—341.doi:10.1016/j.ddtec.2004.11.007.
^Leeson PD, Springthorpe B (novembar 2007). „The influence of drug-like concepts on decision-making in medicinal chemistry”.Nature Reviews Drug Discovery.6(11): 881—90.PMID 17971784.doi:10.1038/nrd2445.
^Arkin MR, Wells JA (april 2004). „Small-molecule inhibitors of protein-protein interactions: progressing towards the dream”.Nature Reviews Drug Discovery.3(4): 301—17.PMID 15060526.doi:10.1038/nrd1343.

Spoljašnje veze

Small+Molecule+LibrariesнаUS National Library of Medicine Medical Subject Headings(MeSH)

[Dougherty_Pucci_2012-1] а ^бMacielag MJ (2012).„Chemical properties of antibacterials and their uniqueness”.Ур.: Dougherty TJ, Pucci MJ.Antibiotic Discovery and Development.стр. 801—2.ISBN 978-1-4614-1400-1.„The majority of [oral] drugs from the general reference set have molecular weights below 550. In contrast the molecular weight distribution of oral antibacterial agents is bimodal—between 340 and 450 Da but with another group in the 700–900 molecular weight range.”

[pmid12036371-2] Veber DF, Johnson SR, Cheng HY, Smith BR, Ward KW, Kopple KD (jun 2002). „Molecular properties that influence the oral bioavailability of drug candidates”.J. Med. Chem.45(12): 2615—23.PMID 12036371.doi:10.1021/jm020017n.

[3] Lipinski CA (decembar 2004). „Lead-and drug-like compounds: the rule-of-five revolution”.Drug Discovery Today: Technologies.1(4): 337—341.doi:10.1016/j.ddtec.2004.11.007.

[pmid17971784-4] Leeson PD, Springthorpe B (novembar 2007). „The influence of drug-like concepts on decision-making in medicinal chemistry”.Nature Reviews Drug Discovery.6(11): 881—90.PMID 17971784.doi:10.1038/nrd2445.

[pmid15060526-5] Arkin MR, Wells JA (april 2004). „Small-molecule inhibitors of protein-protein interactions: progressing towards the dream”.Nature Reviews Drug Discovery.3(4): 301—17.PMID 15060526.doi:10.1038/nrd1343.

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]