Virus

Virus
	SARS-CoV-2,anggota subfamiliCoronavirinae
Klasifikasi virus
(unranked):	Virus
Karajaan
	Adnaviria; Duplodnaviria; Monodnaviria; Riboviria; Ribozyviria; Varidnaviria;

Ieu artikel ngabahas ngeunaan partikel biologis; pikeun istilah komputer, tingalvirus komputer.Pikeun nu séjénna, bacavirus (disambiguasi).

Virus(Lat.racun) atawapirushartina partikelsubmikroskopiknu bisangainféksi sél-sél organisme.Dina hambalan dasarna, pirus téh diwangun kumatéri genetiknu dikandung dina cangkangprotéinnu disebutkapsid,nu jadi pangbéda jeung partikel kawas pirus samodélprionjeungviroid.Ulikan ngeunaan virus katelahnavirologi,sedengkeun nu ngulik virus disebut virolog.

Virus téh sarupa jeungparasit intrasélulér obligatnu pada-pada teu boga alat réproduksi mun aya di luareun sél inang. Tapi, teu kawas parasit nu écés hirupna, pirus mah teu puguh.

Pirus nginféksi rupa-rupa organisme, boheukaryote(kayaningsato,serangga,jeungtutuwuhan) atawaprokaryote(misalnabaktéri). Pirus nu nginféksi baktéri disebutbaktériofag(bacteriophage), atawa sok disebutfag(phage) wungkul.

Kahirupan virus masih haneut dipadungdengkeun, sabab virus teu nedunan sakabéh kritéria/sarat definisihirup,utamana mah alatan euweuhnamémbran séljeungmétabolismenu teu mandiri.

Asal-usul

Asal-usul virus modéren can pati écés, sarta aya kamungkinan datangna ti sababaraha sumber. ku sabab can kungsi aya nu manggihanfosilna,hiji-hijina téhnik nu bisa dipaké nyaétatéhnik molekulér.Danget ieu aya dua tiori anu dianut:

Virus leutik nu ngandung ukur sababarahagénkamungkinan mangrupaasam nukléatanu leupas tigénomhiji organisme. Matéri genetikna bisa jadi diturunkeun tina unsur genetik nu bisa dipindahkeun, kayaningplasmidatawatransposon,nu condong pipindahan.
Virus nu génomna leuwih badag, misalnapoxvirus,bisa jadi asalna tina sél leutik nu marasitan sél inang nu leuwih badag. Gén-gén nu teu dipikabutuh pikeun kahirupan paratitikna lajeng leungit dina prosésretrograde evolution– hartina évolusi malik. BaktériRickettsiajeungChlamydiamangrupa sél hirup nu, kawas virus, bisa baranahan mun aya dina sél inang.

Viroid,satelit,jeungprionmangrupa partikel inféksi lianna nu strukturna leuwih basajan batan virus.

Klasifikasi

Pikeun leuwih jéntré ngeunaan jejer ieu, mangga tingalKlasifikasi virus.

Dinataksonomi,klasifikasi virus geus kabuktian hésé ku sabab euweuhna rékaman fosil, komo deuih statusna salaku mahluk hirup gé masih dipadungdengkeun. Virus teu asup kanadomain klasifikasi biologinu geus aya, antukna ukur dimimitian tina hambalankulawarga.Najan kitu, geus aya nu ngusulkeun ngaran domainAcytota,antukna virus diperenahkeun sajajar jeung domainEubacteria,Archaea,jeungEukarya.Perlu diinget yén kiwari teu sakabéh kulawarga diklasifikasikeun kana ordo, teu sakabéh genera diklasifikasikeun kana kulawarga.

Salaku conto klasifikasi, viruscacar hayamasup kana kulawargaHerpesviridae,subfamiliAlphaherpesvirinaejeung genusVaricellovirus,ari ordona mah can aya. Struktur umumnya mah kawas kieu:

Ordo(-virales)

Kulawarga(-viridae)

Subfamili (-virinae)

Genus(-virus)

Spésiés(-virus)

Sistim klasifikasi nu aya ayeuna dikembangkeun ku Komite Internasional Taksonomi Virus (Internasional Committee on Taxonomy of Viruses, ICTV). Dina lebah ordo, ahli taksonomi kudu nimbang-nimbang tipeu asam nukléat nu aya, naha utas tunggal atawa ganda, sarta aya/henteuna amplop. Sanggeus tilu pasipatan ieu, nu ditimbang téh tipeu inang, bentuk kapsid, pasipatanimunologis,jeung tipeu panyakit nu dibalukarkeunana.

Pikeun tambahan, aya ogé sistimklasifikasi Baltimorenu merenahkeun virus dina hiji ti antara tujuhGolongan,nu misahkeun virus dumasar cara réplikasi jeung tipeu génomna.

Struktur

Partikel virus nu lengkep, katelahvirion,leuwih leutik batan transporter gén, diwangun ku asam nukléat hambalan paling dasar nu dikubeng ku bungkusprotéinnu katelahkapsid.Ieu kapsid diwangun ku protéin nu disandi ku génom virus, bentukna jadi cirimorfologina.Unit protéin nu disandi virus, disebutprotomér,bakal ngabentuk manéh jadi kapsid, tanpa merlukeun asupan ti génom virus - najan kitu, sababaraha virus nyandikeun protéin nu nungtun konstruksi kapsidna. Protéin nu ngabeungkeut asam nukléatna sacara téhnis disebutnukléoprotéin,sedengkeun beungkeutan antara protéin kapsid jeung asam nukléat virus disebutnukléokapsid.

Sacara umum, aya opat tipeu morfologi virus:

	Virus hélik
Diagram kapsid hélik	Kapsid hélik diwangun ku protomér tipeu tunggal nu nyangsang di tengah antukna ngabentuk solobong nu murilit. Susunan ieu ngahasilkeun virion bentuk watang nu pondok-heuras atawa panjang-leuleus, sedengkeun matéri genetikna diwadahan di jero solobong. Panjang kapsid hélik ieu téh patali jeung panjang asam nukléat di jerona, sedengkeun diaméterna mah gumantung kana panjang jeung susunan protomérna. Conto virus modél kieu nyaétavirus mosaik bako.
	Virus ikosahédral
Mikrograf éléktron virion ikosahédral	Simétri kapsid ikosahédral ngahasilkeun virus nu siga buleud, tapi sabenerna mah diwangun ku kapsomér nu disusun dina pola géométri anu rapih. Kapsomér mangrupa struktur bentuk cingcin nu diwangun ku lima atawa genep protomér, nu dibeungkeut kubeungkeut non-kovalénpikeun ngabungkus asam nukléat virusna. Wangunan ikosahédral diciptakeun kuR. Buckminster-Fullerdinakubah géodésikna,sarta mangrupa struktur bungkus pangkuatna nu diwangun ku sababaraha salinan protéin tunggal. Jumlah protéin nu dipikabutuh pikeun ngabentuk virus buleud diitung ku wilangan-T^[1],nu butuh 60×tprotéin. Dina kasus virushépatitis B,wilangan-T-na téh opat, antukna aya 240 protéin nu ngabentuk kapsidna.
	Virus amplop
Diagram amplopHIV	Lian ti kapsid, sababaraha virus bisa ngabajakmémbran sélnu aya di sabudeureun sél nu kainféksi, antukna boga lapisanlipidluar nu katelahamplop virus(viral envelope). Mémbran tambahan ieu dibeungkeut ku protéin nu disandi ku génom virus jeung inang, tapi mémbran lipid katutkarbohidratnamah sagemblengna disandi di inangna. Amplop virus méré sababaraha kapunjulan batan virion "taranjang" nu lian, utamana taméng énzim jeung bahan kimia. Protéin nu ngabeungkeut mémbran bisa mangrupaglikoprotéin molekul reséptor,antukna sél nu walagri teu nganggap deungeun ka virion, nu lajeng bisa diasupkeun ka jero sél. Sababaraha virus gumantung pisan kana ieu amplop, antukna mun kabuka bisa langsung ditarajang ku sistim imun.
	Virus kompléks
Diagram baktériofag	Virus ieu boga kapsid nu teu murni hélik atawa ikosahédral, malah bisa boga struktur tambahan sarupaning buntut protéin atawa pinding luar nu kompléks. Sababarahabaktériofagmibanda struktur kompléks nu diwangun ku hulu ikosahédral nu kabeungkeut kana buntut hélik, disambung ku pelat héksagonal nu boga serat suku/buntut protéin. Pikeun conto,poxvirusnu badag tur kompléks boga morfologi nu ahéng. Génomna kabeungkeut kana protéin di tengah struktur pisin nu katelahnukléoid.Nukléoid ieu dikubeng ku mémbran jeung dua awak lateral nu gunana can kanyahoan. Virus ieu dibungkus ku lapisan protéin nu kandel salaku amplop luar. Partikelna jadipléiomorfik,ti lonyod (ovoid) nepi ka pasagi.

Ukuran

Virus nu geus katalungtik, lolobana boga ukuran kapsid 10 jeung 300nanométer(diaméter). Pikeun babandingan, virion ukuran sedeng dibandingkeun jeung kutu téh sarua jeung ukuran manusa dibandingkeun jeung gunung nu badagna dua kalieun Gunung Everest. Sababarahafiloviruspanjangna bisa nepi ka 1400 nm, tapi diaméter kapsidna mah kira ukur 80 nm. Najan lolobana mah moal katempo kumikroskop cahya,aya ogé virus nu leuwih badag batan baktéri nu pangleutikna antukna bisa katempo mun maképembesarannu cukup. Pikeun nempo partikel virus, nu ilahar dipaké nyaétamikroskop éléktron,boh transmisi atawa skén.

Virus nu anyaran kapanggih,mimivirus,teu galib ti nu séjén, diaméterna 400 nm. Virus pangbadagna ieu ukuran génomna nepi ka 1000 gén (sababaraha baktéri ngan boga 400) nu panjangna 1,2mégabasa.Génomna ieu ngandung loba gén nuhomologjeung gén prokaryote sarta eukaryote^[2].Papanggihan ieu ngajurung para élmuwan mikiran deui kontrovérsi sabudeureun organisme jeung virus, nu saméméhna ukur dianggap unsur genetik nu bisa pundah-pindah.

Matéri genetik

DNAatawaRNAaya dina spésiés virus, tapi tara sakaligus aya duanana. Nu aya duanana téh ukur dinasitomégalovirusmanusa, nu ngandung DNA jeungmRNA.Asam nukléatna bisa utas tunggal, bisa ogé ganda, gumantung spésiésna. Ku kituna, virus ngawengku opat golongan tipeu asam nukléat: DNA lambar ganda, DNA lambar tungggal, RNA lambar ganda, jeung RNA lambar tunggal. Spésiés virus sato geus katalungtik mibanda opat rupa kombinasi di luhur, virus tutuwuhan ilaharna mah boga tipeu RNA lambar tunggal, sedengkeun baktériofag mah lolobana boga tipeu DNA lambar ganda. Asam nukléat dimaksud di luhur téh bisa linéar, bisa ogé sirkular nutup.

Ukuran génom dumasar beuratnukléotidanatéh rupa-rupa gumantung spésiésna. Génom pangleutikna nyandi kira ukur opat protéin kalawan beurat $10^{6}$ dalton,sedengkeun nu pangbadagna kira $10^{8}$ dalton sarta nyandi leuwih ti saratus protéin. Sababaraha spésiés virus mibanda nukléotida nu ahéng, kayaning hidroksimétilsitosin (gagantisitosin) salaku bagian normal génomna.

Pikeun virus nu asam nukléatna dina bentuk RNA, lambaranana téh cenahséns-positip(ogé katelah lambar-pleus,plus-strand) atawaséns-négatip(ogé katelah lambar-mineus,minus-strand), gumantung komplemén/henteuna jeung mRNA virusna. RNA virus séns-positip téh ciples jeung mRNA virus, antukna bisa gancangditranslasikeunku sél inang. RNA virus séns-négatip kompleméntér jeung mRNA antukna kudu dirobah jadi RNA séns-positip kuRNA polimérasesaméméh translasi.

Larapan

Élmu hayat

Virus téh penting pikeun ulikanbiologi molekulérjeungsél,sabab nyadiakeun sistim basajan nu bisa dimanipulasi sarta ditalungtik fungsi sélna. Ulikan jeung dipakéna virus nyadiakeun rupa-rupa émbaran ngeunaan biologi sél. Pikeun conto, virus geus ngabasajankeun ulikangenetikasarta ngabantu urang neuleuman mékanisme dasargenetika molekulér,kayaningréplikasi DNA,transkripsi,olah RNA,translasi,transporprotéin,jeungimunologi.

Para ahligenetikageus ilahar maké virus salakuvéktorpikeun ngasupkeun gén kana sél nu keur diulik, misalna sangkan sélna ngahasilkeun zat asing, atawa pikeun ngulik pangaruh asupna gén anyar kana génom. Dina pola nu sarupa,viroterapingagunakeun véktor virus pikeun natambaan rupa-rupa kasakit, misalna dinaterapi génjeungkangker.

Élmu bahan jeung nanotehnologi

Dina bulan April 2006, para elmuwan MIT (Institut Téhnologi Massachusetts) nyiptakeun kabel logamskala nanongagunakeun virus hasilrékayasa genetik^[3].Kelompok MIT bisa maké éta virus pikeun nyiptakeunbatrénudénsitas énérginatilu kali leuwih gedé batan bahan nu dipaké kiwari. Téhnologi ieu bisa dikembangkeun dina widangkristal cair,sél surya,sél suluh,jeung éléktronik lianna di mangsa nu bakal datang.

Pakarang

Artikel utama:Pakarang biologis.

ku sabab virus bisa ngabalukarkeunépidemi,aya kahariwang ti sabagian pihak yén virus bisa dijadikeunpakarang biologis,komo sanggeus ayana béja yén virus flu spanyol nu mahabu taun 1918 geus bisa dikembangkeun deui di lab^[4].

Étimologi

Kecap "virus" téh asalna dinabasa Latinnu nujul karacunjeung barang pibahyaeun lianna. Dina basa Inggris mah mimiti dipakéna téh taun 1392. Harti "agén nu ngabalukarkeun kasakit inféksi" munggaran kacatet taun 1728, saméméh kapanggihna virus ku ahli biologiRusia-Ukraina Dmitry Ivanovskytaun 1892. Kiwari, kecapvirusdipaké pikeun ngagambarkeun virus biologis sakumaha dipedar di dieu.

Covid-19

Molekul palsu berinteraksi sareng reséptor ACE 2 anu aya dina mémbran sél. Saatos éta, koronavirus Cina "ngadorong" reséptor kana sél sareng nyuntik RNA saatosna. Salajengna, virus balikeun kana sitoplasma sél manusa.^[5]

Sumberdaya séjén

Baca ogé

Tumbu kaluar

Wikimedia Commonsmibanda média séjénna nu patali jeungVirus.

Chart of viral pathogens which contribute to indoor air pollution
Viruses: The new cancer hunters Archived2006-02-13 diWayback Machine- Artikel IsraCast ngeunaan viroterapi
The Big Picture Book of Viruses Archived2006-07-05 diWayback Machine- Gambar jeung émbaran umum ngeunaan rupa-rupa virus

Rujukan

Virus,Wikipédia édisi basa Inggris (5 Juli 2006)
All the Virology on the WWW Archived2008-09-14 diWayback Machine
University of Leicester online notes Archived2006-05-10 diWayback Machine- Virus Structure
Chronic Active Human Herpesvirus-6 (HHV-6) Infection: A New Disease Paradigm
Gelderblom, Hans R. (1996).41. Structure and Classification of VirusesinMedical Microbiology4th ed.Samuel Baron ed. The University of Texas Medical Branch at Galveston.ISBN 0-9631172-1-1
Radetsky, Peter (1994).The Invisible Invaders: Viruses and the Scientists Who Pursue Them.Backbay Books, ISBNs 0316732168 (hc), 0316732176 (pb).
Theiler, Max and Downs, W. G. (1973).The Arthropod-Borne Viruses of Vertebrates: An Account of the Rockefeller Foundation Virus Program 1951-1970.Yale University Press.
Prescott, L. (1993).Microbiology,Wm. C. Brown Publishers,ISBN 0-697-01372-3
Artikel ieu ngandung bahan-bahan tiScience Primernu medal ti NCBI, nu, salaku publikasi pamaréntah AS, aya dinadomain publik (1).

Catetan

[1] ttp://rhino.bocklabs.wisc.edu/cgi-bin/virusworld/htdocs.pl?docname=triangulation.html Archived2006-02-23 diWayback Machine

[2] ttp:// stanford.edu/group/virus/mimi/2005/Genome.htm

[3] ttp://web.mit.edu/newsoffice/2006/virus-battery.html

[4] ttp:// cdc.gov/OD/OC/MEDIA/pressrel/r051005.htm

[5] "Coronavirus Cina.".

[1]

[2]

[3]

[4]

[5]

Virus

SARS-CoV-2,anggota subfamiliCoronavirinae
Klasifikasi virus
(unranked):	Virus
Karajaan
Adnaviria Duplodnaviria Monodnaviria Riboviria Ribozyviria Varidnaviria