Aragonés började sin karriär iCD Getafe1957innan han året därefter skrev på förReal Madrid.Där lyckades han aldrig ta sig in i seniorlaget utan tillbringade större delen av sin tid som lån till andra klubbar, såsomRecreativo de HuelvaochHércules CF,när han inte spelade förAD Plus Ultra(Real Madrids reservlag). År1960gick han tillReal Oviedooch gjorde sinLa Liga-debut. Mellan1961och1964spelade han förReal Betisdär han gjorde sammanlagt 86 ligamatcher och 33 mål.
Hos Atlético Madrid fick Aragonés smeknamnenZapatones(ungefär "stora stövlar" ) och blev känd somfrisparksspecialist.Han förekom ofta som målskytt och1970delade hanPichichi(skyttekungspokalen) med lagkamratenJosé Eulogio GárateochAmancio.1974gjorde han 1–1-målet motBayern Münchenpå hemmaplan ieuropacupsfinalenmen laget förlorade med 0–4 i returmötet iTyskland.Han fick snart ännu ett smeknamn –El Sabio de la Hortaleza(ungefär "Hortalezas vise man" ).
Händelsen orsakade stor uppståndelse ibrittiskamediaoch många krävde omedelbart hans avgång som förbundskapten. Trots det han kallade Henry har Aragonés försvarats av spanska landslagsspelare som menar att han inte ärrasist.Efter en undersökning bestraffadesspanska fotbollsförbundetmed böter på 87 000amerikanska dollaravUefaoch varnades för att framtida incidenter skulle bestraffas mycket strängare. UEFA påpekade att möjliga straff skulle kunna vara avstängning från stora internationella turneringar eller förbud för supportrar att närvara vid hemmamatcher för Spanien.