Metabolism

Ämnesomsättningen
Denna artikel är en del i serienÄmnesomsättningenmed följande delar:
Metabolism·Katabolism·Anabolism
Katabolism
Matspjälkning·Glykolys·Beta-oxidation·Trans-/Deaminering·Citronsyracykeln·Elektrontransportkedjan·Oxidativ fosforylering·Ureacykeln
Anabolism
Glukoneogenes·Proteinsyntes·Fettsyrasyntes
Se även
Fotosyntes·Cellandning·Malat-aspartatskytteln

Översikt av citronsyracykeln, klicka för att se mer detaljer.

Metabolism,även kallatämnesomsättning,är ett sammanfattande namn på de processer därnäringsämnenochläkemedeltas upp, omvandlas, bryts ner i kroppen, omsätts tillenergioch/eller avlägsnas urkroppen.Här ingår ett mycket stort antalkemiska reaktioner.Dessa processer utgör grundvalen för självalivet.De gör det möjligt förcellernaatt växa och föröka sig, att underhålla de strukturer som cellerna är uppbyggda av och att anpassa sig till förändringar i deras livsmiljö.

Metabolismen styrs av flera överordnade och samordnade organsystem och processer.Sköldkörtelnbildarämnesomsättningshormonernatyroxinochtrijodtyroninvilka reglerar ämnesomsättningens hastighet. Näringsämnena måste spjälkas loss från födan för att kunna upptas av blodet, vilket sker imatspjälkningen,varefter ämnena cirkulerar i blodomloppet tills de når målcellerna.Hjärt- och kärlsystemetsjälvt förser cellerna dels med ämnesomsättningshormoner, dels medsyre.Viautsöndringenochmag- och tarmsystemetlämnar slaggprodukter kroppen och ämnen absorberas.

Många av ämnesomsättningenskemiskareaktioner samverkar i välorganiserade kedjor, där enmolekylmodifieras i flera steg från en form till en annan, med ett specifiktenzymför varje steg. Enzymerna är centrala för dessa processer, för de gör det möjligt för cellen att utföratermodynamisktofördelaktiga processer genom att dessa processer kopplas till processer som är termodynamiskt fördelaktiga. Detta kallasintermediär metabolism.Enzymerna gör också att cellen kan reglera processerna, det vill säga styra hur stor mängd molekyler som förändras, så att olika mängder produceras när förhållandena i omgivningen förändras.

Processerna delas in i två typer:

• Katabolism,sönderdelning avmolekylerför att utvinna energi och byggstenar till andra processer. Ett exempel på detta ärcellandning.Ett annat är denmatsmältningsom sker redan i munhålan och huvudsakligen består av mekanisk och kemisk bearbetning. Närmatenhar processats och näringsämnena har brutits ner från storamolekylertill mindre tas de upp i blodet och transporteras ut till cellerna, antingen för att brytas ner ytterligare och/eller användas avanabolismen.Oanvändbara ämnen kan antingen passera rakt igenom matsmältningskanalen eller utsöndras ur kroppen genom särskilda utsöndringssystem, till exempelnjurarochsvettkörtlar.

• Anabolism,uppbyggnad av stora molekyler, till exempelproteinerochaminosyrorgenom sammansättning av flera mindre molekyler. Den tar vid när näringsämnena har brutits ner till hanterbara molekyler.

Levernär viktig i ämnesomsättningen och både producerar enzymer och hanterar ämnen på cellnivå. Här omvandlas för kroppen svårhanterbara ämnen till något användbart eller något som är mera lättlösligt och därmed lättare att bli av med. (Dessa processer kan gå fel, till exempel nedbrytning av alkohol där etanol blir ättiksyra, naturligt förekommande i kroppen, metanol blir i samma process myrsyra som är mycket giftigt.)

Inomfarmakokinetikanvänds termen metabolism i betydelsen omvandling avläkemedeli kroppen. Där innebär exempelvis begreppetförstapassagemetabolismatt ett läkemedel som intas via munnen förändras innan det nårblodomloppet,och begreppetfas II-metabolismatt kroppen konjugerar ämnet med någon syra, till exempelfosfatellerglukuronsyra,så att det därigenom blir mer lättlösligt.

Vad kroppen upplever som näring respektive gift beror på vilka processer den har tillgång till i sitt metaboliska system. En delprokaryoterlever påvätesulfidoch utvinner sin energi ur den. Men för alladjurär vätesulfid ett gift. Metabolismens snabbhet påverkar starkt hur mycket näring cellen behöver.

Ett slående förhållande med metabolismen är att det finns så stora likheter mellan olika organismer som inte alls är närbesläktade. Så har man till exempel funnit sammakarboxylsyrorbåde ibakterienEscherichia colioch ielefantensalla celler. Dessa likheter beror troligen på att processerna fanns i en gemensam förfader i evolutionshistorien.

De ämnen som metaboliserats utsöndras vianjurarnaiurinen.Fettlösliga ämnen (steroider) utsöndras via gallan. Ibland kan dessa tas upp av tarmarna nedanför gallblåsan och åter transporteras till levern i det så kalladeenterohepatiska kretsloppet.

De viktigaste biologiska molekylerna

Triacylglycerol,en lipid.

De strukturer som djur, växter och mikroorganismer består av byggs upp av ett stort antal olika molekyler. Men man brukar dela in dem i klasser som har stora likheter inbördes. De tre största av dessa grupper är:

1. Aminosyror
2. Kolhydrater
3. Lipider(som också kan kallas förfetter)

Metabolismen består av processer som tillverkar de molekyler som cellens strukturer byggs upp av och processer för att dela upp molekyler så att cellen kan utvinna energi ur dem. De molekyler som sönderdelas för att ge energi kan komma direkt från födan eller tas från cellens egna strukturer. En del av de små molekyler som blir resultatet vid energiutvinning blir byggstenar som används av de uppbyggande processerna.

Många viktiga biologiska molekyler byggs upp genom att ett stort antal små molekyler ur en ganska liten grupp fogas samman i långa rader. Ett ord för sådana sammansatta molekyler i allmänhet ärpolymeroch de enkla beståndsdelarna kallas följdriktigt förmonomerer.De viktigaste av polymererna ärDNAochproteiner.Nedan följer en tabell med dessa och några till.

Molekyltyp	Gemensamt namn för de monomerer som ingår	Gemensamt namn för polymerer av denna typ	Exempel på specifika polymerer av denna typ
Aminosyra	Aminosyra	Protein,polypeptid	Fiberprotein,globulärt protein
Kolhydrat	Monosackarid	Polysackarid	Stärkelse,glykogen,cellulosa
Nukleinsyra	Nukleotid	Polynukleotid	DNA,RNA

Aminosyror och proteiner

Proteinerbestår avaminosyrorsom är fästade i varandra i långa kedjor, varje aminosyra är fäst vid två andra, utom de i ändarna. Den bindning som bygger upp proteinerna kallaspeptidbindning.Många av proteinerna ärenzym,somkatalyserarde kemiska processer som metabolismen består av. Andra proteiner utgör den mekaniska stommen,cytoskeletteti cellen, eller har mekaniska funktioner. Proteiner är också viktiga som signalsubstanser för kommunikation mellan celler, somantikroppariimmunförsvaret,för att hålla ihop celler som utgör vävnad tillsammans och för att utföra aktiv transport av vissa molekyler mellan cellens insida och utsida övercellmembranet.

Lipider

Lipiderär en samlingsbeteckning för många olika molekyler. Deras viktigaste funktioner är som isolerande skikt icellmembranetmellan cellens inre och ämnena utanför, och som energilager. Oftast definieras lipiderna som de biologiska molekyler som ärhydrofobaelleramfipatiskaoch som kan lösas iorganiskalösningsmedel(till exempelbensen).

Fetternaär en stor grupp av lipider som består avfettsyrorochglycerol.Triacylglycerolär en molekyl som kan bildas av tre fettsyreestrar som binds samman av en glycerolmolekyl.

Kolhydrater

Glukosfinns i två former, som en ring och som en linjär kedja.

Kolhydrater är kedjor i formen avaldehyderellerketonermed mångahydroxylgrupper.De kan vara enkelt linjära, hänga ihop i en ring, eller vara glest grenade. Kolhydraterna är de allra vanligaste molekylerna i den biologiska världen och de har många olika funktioner, till exempel lagring och transport av energi (stärkelse, glykogen) och att ge mekanisk stadga och form åt cellen (cellulosai växter,kitini många djur). De grundläggande byggstenarna för kolhydrater kallas monosackarider. Kolhydrater kan också kallas polysackarider. Den mest förekommande heterglukos,men det finns många andra varianter, till exempelgalaktosochfruktos.Det stora antalet varianter av monosackarider och möjligheten att införa förgreningar gör att kolhydraterna förekommer i oerhört många varianter.

Arvsmassan - nukleotider

PolymerernaDNAochRNAär långa kedjor av nukleotider. Dessa molekyler innehåller och långtidslagrar all genetisk information i levande organismer. Den definierar vilka proteiner som ska bildas genomtranskriptionföljd avproteinsyntes.Informationen i DNA skyddas av särskilda reparationsmekanismer och mångfaldigas avreplikationsprocessen.Ett fåtalvirustyper,till exempelHIV,långtidslagrar sin genetiska information i RNA. Dessa använder omvänd transkription för att skapa DNA utifrån sin RNA. Medan de flesta RNA-molekylerna används endast som specifikation för protein som ska tillverkas, finns ett relativt fåtal RNA-molekyler som används direkt som de är, till exempel iribosomer.

Koenzym Asstruktur. Den överförbaraacetylgruppenär bunden tillsvavelatomenlängst till vänster.

Koenzym

Metabolismen innefattar ett mycket stort antal kemiska reaktioner. Men de flesta kan grupperas i någon av ett fåtal grundläggande reaktionstyper som överför en funktionell grupp mellan två molekyler. Denna gemensamma kemi gör att cellerna kan klara sig med förhållandevis få typer av överföringsmolekyler, som förmedlar funktionella grupper mellan olika reaktioner. De här överföringsmolekylerna kallaskoenzym.Man brukar säga att de kemiska reaktioner som överför funktionella grupper med hjälp av samma koenzym hör till samma klass. Lägg märke till att koenzymet här utgör substrat för enzymerna. En del av enzymerna tillverkar koenzymet medan andra tar isär det igen.

Adenosintrifosfat(ATP) är ett mycket viktigt koenzym. Det är helt dominerande i funktionen att överföra energi mellan olika processer. (Det är också en nukleotid.) Nästan alla processer i cellen som behöver energi får energin genom att ATP tillförs. Det gäller till exempel anaboliska processer och muskelarbete. ATP tillverkas av kataboliska processer. Vid varje given tidpunkt finns endast ett relativt fåtal ATP-molekyler. Men det förbrukas och återbildas i mycket hög takt. Under ett dygn producerar (och förbrukar) en människokropp ungefär sin egen vikt av ATP. ATP används också för att placera fosfatgrupper på olika molekyler (fosforylering).

Mineraler och kofaktorer

Proteinethemoglobin,som innehåller fyra så kallade hemgrupper, färgade gröna i bilden. De innehållerjärnoch är nödvändiga för dess funktion att transportera syre.

Oorganiska ämnen har också viktiga funktioner i metabolismen. En del förekommer i stora mängder i cellen, till exempelnatriumochkalium.Andra förekommer endast i mycket små koncentrationer, till exempelselen.I en däggdjurscell utgörs 99% av hela massan av grundämnenakol,kväve,kalcium,natrium,klor,kalium,väte,syreochsvavel.De organiska molekylerna (proteiner, kolhydrater och lipider) innehåller huvuddelen av kolet och kvävet medan det mesta av syret och vätet finns i vattenmolekyler. De oorganiska grundämnen som förekommer rikligt fungerar somjoniskaelektrolyter.De viktigaste jonerna är natrium, kalium, kalcium,magnesium,klor,fosfatoch den organiska jonenbikarbonat.Cellerna upprätthåller precis rättosmotiskt tryckochpH-skillnad övercellmembranetgenom att reglera koncentrationerna av joner på insidan och utsidan. De gör det genom att aktivt transportera väl valda joner genom membranet. Jonerna är också viktiga förnervernasochmusklernasfunktion. Aktiviteten i dessa vävnader sätts igång när joner flödar snabbt över membrangränsen. Elektrolyterna kommer in i och lämnar cellen genom särskilda proteiner som ligger inbäddade i cellmembranet.

Övergångsmetallernai organismer finns oftast endast somspårämnen.Av dessa harzinkochjärnde högsta koncentrationerna. Dessa metaller samverkar med vissa proteiner somkofaktoreroch är nödvändiga för dessa enzyms funktion. Exempel ärkatalasoch det syre-transporterande proteinethemoglobin.Dessa kofaktorer binds starkt, men intekovalenttill de proteiner de samverkar med. Under den process som kofaktorn deltar i kan det hända att den modifieras, men därefter återställs den alltid till sin normalform. Cellen har särskilda proteiner som lagrar och transporterar dessa ämnen, till exempelferritin.

Katabolism

Katabolismär de metaboliska processer som delar upp molekyler i mindre delar och därmed frigör energi. Här ingår de reaktioner som bryter ned och oxiderar födan. Syftet med de kataboliska reaktionerna är bland annat att förse de anaboliska reaktionerna med energi och byggstenar. Den lägsta formen av katabolism (nedbrytning) ger koldioxid och vatten som biprodukter.

De vanligaste kataboliska reaktionerna i djur kan delas in i tre steg.

1. Stora organiska molekyler, till exempel proteiner, polysackarider eller lipider sönderdelas till mindre beståndsdelar utanför cellen.
2. De mindre molekylerna tas in i cellen och delas upp i ännu mindre molekyler, vanligtvis acetyl-koenzym A, vilket frigör en ganska liten mängd energi.
3. Acetylgruppen i acetyl-koenzym A oxideras till vatten och koldioxid icitronsyracykelnochelektrontransportkedjan.Detta frigör den stora andelen energi, genom att reducerade vätebärare oxideras för att bilda ATP.

Matspjälkning

Mycket stora molekyler, som stärkelse och proteiner, kan inte tas upp snabbt av cellerna. Så för att de ska kunna användas i cellens metabolism måste dessa molekyler förstspjälkas,det vill säga delas upp i mindre delar. Flera vanligt förekommande klasser av enzym spjälkar dessa polymerer. Här ingår till exempelproteaser,som spjälkar proteiner till aminosyror, ochglukosidhydrolaser,som spjälkar polysackarider till monosackarider.

Mikroorganismer och svampar utsöndrar helt enkelt de spjälkande enzymerna till sin omgivning, medan djur endast utsöndrar dessa enzymer från särskilda celler i matsmältningskanalen. De aminosyror och enkla sockermolekyler som på detta sätt blir tillgängliga pumpas därefter in i cellerna av särskilda transportproteiner som är fästade i cellmembranet.

Utvinning av energi från organiska molekyler

Molekylmodell avadenosintrifosfat,den allra vanligaste av de molekyler som bär energi mellan olika reaktioner.

Nedbrytandet av kolhydrater till mindre molekyler kallas kolhydratkatabolism. Vanligtvis tas kolhydrater in i cellerna i form av monosackarider, efter att de delats upp utanför cellen.

Huvudspåret för nedbrytningen inne i cellen ärglykolys,där monosackarider, till exempel glukos, omvandlas tillpyruvatsamtidigt som ATP bildas. Pyruvat är ett mellansteg längs flera olika metaboliska vägar, men de flesta omvandlas tillacetylkoenzym Aoch används därefter icitronsyracykeln.Citronsyracykeln är den i särklass största energiproducenten i de flesta eukaryota celler. En del av denna energi levereras i form av ATP. Men den viktigaste produkten är NADH, som tillverkas av NAD⁺när acetylkoenzym A oxideras. Denna oxidation producerar också koldioxid, som cellen vanligtvis inte har någon användning för, utan återför till omgivningen. Under anaeroba förhållanden producerar glykolysenmjölksyra,genom att enzymet laktatdehydrogenas (LDH) återoxiderar NADH till NAD+, så att det kan återanvändas i glykolys. Med andra enzymer kan glukos brytas ned till pentoser, till exempel ribos, som är en komponent i DNA och RNA. Fetter kataboliseras genom hydrolys till fria fettsyror och glycerol. Glycerolen går vidare till glykolys och fettsyrorna bryts ner till acetylkoenzym A genom beta-oxidation. Acetylkoenzym A går sedan vidare till citronsyracykeln. Fettsyror ger mer energi vid oxidering än kolhydrater ger, för fettsyrorna innehåller mycket färre syreatomer.

Aminosyror kan användas antingen som byggstenar vid tillverkning av proteiner och en del andra biologiska molekyler eller som en energikälla genom att de oxideras tillureaoch koldioxid. En majoritet av aminosyrorna kan omvandlas till glukos, genomglukoneogenes.

Energiomvandlingar

Oxidativ fosforylering

Vidoxidativ fosforyleringflyttas elektroner från molekylerna i maten till syre, via metaboliska omvandlingsvägar som citronsyracykeln. Den energi som då frigörs används till att tillverka ATP. I eukaryota celler utförs denna process av en uppsättning proteiner som befinner sig i och omkring det inre membranet imitokondrierna.Dessa proteiner kallaselektrontransportkedjan.I prokaryoter sitter elektrontranportkedjan i ett inre membran. I båda fallen använder proteinerna den energi som frigjorts av att elektroner överförts från reducerade molekyler som NADH till syre, till att pumpaprotonergenomcellmembranet.

När protoner pumpas ut ur det inre av mitokondrien blir protonkoncentrationen lägre längst in och högre i det mellersta utrymmet. Man kallar detta för att det har uppstått en koncentrationsgradient.Gradienten gör att protoner tenderar att röra sig tillbaka till det inre. När enzymetATPsyntassläpper tillbaka protoner till det inre kan det använda deras rörelse till att fosforylera (lägga till en fosfatgrupp till) enadenosindifosfat,och därmed tillverka en ATP.

Utvinning av energi från ljus

Växter, vissa bakterier (till exempel vissa cyanobakterier) och vissa protister (till exempel mångaeuglena) kan utvinna energi ur ljus. Den här processen är ofta kopplad till en omvandling av koldioxid till organiska substanser, som en del av fotosyntesen, som kommenteras vidare längre ned i artikeln. I prokaryoter kan energiutvinningen och kolfixeringen arbeta helt åtskilda. Principerna för den process som växterna använder för att utvinna solenergi liknar oxidativ fosforylering. Båda processerna

1. Lagrar energi i form av en skillnad i protonkoncentration över ett membran
2. Åstadkommer skillnaden i protonkoncentration genom att använda en elektrontransportkedja
3. Tillverkar ATP genom att använda protonkoncentrationsskillnaden

De elektroner som behövs för att driva elektrontransportkedjan kommer ifotosyntesenfrån ljusinsamlande proteinkomplex som kallasfotosyntetiska reaktionscentra.De brukar delas in i två huvudklasser som har delvis olika roller i elektrontransporten. De innehåller också något olika varianter av klorofyll som är känsliga för något olika ljusfrekvenser, 680 respektive 700 nanometer. Ibland benämns de enligt detta P680 respektive P700. I växter använder fotosystem II (P680) energin i fotoner till att ta bort elektroner från vattenmolekyler. Närmast som en bieffekt bildas då syremolekyler. Elektronerna passerar sedan ett cytokromkomplex som använder elektronens potentiella energi till att pumpa protoner genom tylakoidmembranet i kloroplasten. Dessa protoner kommer tillbaka genom membranet genom proteinkomplexet ATPsyntas och ger samtidigt den energi som behövs för att ATPsyntas ska kunna tillverka ATP. Elektronerna rör sig sedan genom fotosystem I (P700). Observera att elektroner som kommer till fotosystem I, tidigare har varit i fotosystem II. I detta avseende kommer alltså fotosystem II före fotosystem I. I fotosystem I kan elektronen antingen användas till att reduceraNADP+,som sedan används iCalvincykeln,eller återanvändas i ATP-tillverkningen.

Anabolism

Anabolism är de metaboliska processer som gör molekyler större och bygger upp komplexa molekyler. För detta behövs ett tillskott av energi. De stora molekyler som celler och vävnader består av har vanligtvis byggts upp genom att cellen stegvis lagt till en liten molekyldel i taget. Man kan säga att anabolismen består av tre steg:

1. Tillverkning av byggstenar, till exempel aminosyror, monosackarider och nukleotider.
2. Aktivering av en byggsten så att den blir kemiskt reaktiv. Detta innebär att den modifieras så att den får hög potentiell energi, till exempel genom att en fostatgrupp tillförs från en ATP-molekyl.
3. Byggstenen läggs till en stor molekyl som därmed blir ännu större, till exempel ett protein, en polysackarid eller en nukleinsyra.

En del organismer kan bygga upp alla sina molekyler från de enklaste och vanligaste molekylerna i omvärlden. Sådana organismer kallasautotrofa.Hit hör växterna, som förutom små mängder av några grundämnen använder koldioxid och vatten som utgångsmaterial för att bygga upp sina strukturer.Heterotrofaorganismer, å andra sidan, behöver tillgång till komplexa molekyler utifrån, till exempel aminosyror och monosackarider, för att kunna bygga upp sina strukturer. Till denna senare grupp organismer hör människan.

Se även

• Basalmetabolism
• Citronsyracykeln
• Fysiologi
• Metaboliskt syndrom
• Metabolit