Coronavirus
Coronavirus | |
![]() Elektronmikroskopbild med virioner avaviärt infektiöst bronkitvirus,där man tydligt ser den kronliknande profilen. | |
Systematik | |
---|---|
Ordning | Nidovirales |
Familj | Coronaviridae |
Underfamilj | Orthocoronavirinae |
Släkten | |
Synonymer | |
Coronavirinae |
![](https://upload.wikimedia.org/wikipedia/commons/thumb/e/eb/3D_medical_animation_corona_virus.jpg/250px-3D_medical_animation_corona_virus.jpg)
Coronavirusär envirusfamiljsom bland annat orsakar sjukdomar hosfåglarochdäggdjur,inklusive människor. Hos människor orsakar deförkylningmed halsont och hosta, och iblandlunginflammation.Vanligtvis är symptomen lindriga, men sjukdomarna kan i ovanliga fall vara dödliga. Hos kor och grisar orsakar dediarré,medan hönsfåglar kan drabbas av lungsjukdomar. Virusfamiljen har fått sitt namn eftersom det vid elektronmikroskopi ser ut som att viruset har enkorona.
Det finns ingaantivirala medicinermot de coronavirus som smittar människor, som godkänts för skydd eller bot. Motsars-cov-2,det virus som orsakarcovid-19-pandemin,finns dock flera godkändavacciner.
Det första coronaviruset upptäcktes och beskrevs 1937[4],vilket identifierades hos fåglar. De första som infekterat människan upptäcktes 1967 och var tre olika virus som återfanns i näshålan på patienter med vanlig förkylning[5][6].Andra virus inom gruppen har senare identifierats, somSARS-CoVsom orsakadesarsår 2003,HCoV NL63år 2004,HKU1år 2005,MERS-CoVår 2012 ochsars-cov-2år 2019. De flesta av dessa virus har orsakatluftvägsinfektioner.
Forskningshistorik
[redigera|redigera wikitext]Det första coronaviruset upptäcktes och beskrevs på 1930-talet, vilket varaviärt infektiöst bronkitvirus(IBV) som återfanns hos kycklingar. De första som infekterade människan upptäcktes i början av 1960-talet och var två olika virus som återfanns i näshålan på patienter med vanlig förkylning. De båda virusen identifierades och beskrevs på ett forskningscentrum iSalisburyi södra England, där man studerade vanlig förkylning under namnetCommon Cold Research Unit,och de fick namnenhumant coronavirus 229Eochhumant coronavirus OC43.[7].Från 1957 hade arbetet där letts avDavid Tyrell.[8]Till sin hjälp för att kunna odla coronavirusen samarbetade de med den svenska läkarenBertil Hoorn,som lyckats skapa enorgankultur,det vill säga en laboratoriemiljö, där de nya virusen kunde växa.[8]1967 publiceradeCommon Cold Research Unitden första bilden av ett coronavirus taget avJune Almeida[8],som myntade termencoronaviruspå grund avglykoproteinutskottensom fick viruset att kunna liknas vid solenskorona.
I och med utbrottet avsarsår 2003 växte intresset för coronavirus och forskningen intensifierades.[8]Sedan dess har ytterligare fyra coronavirus som infekterar människan identifierats.
Systematik
[redigera|redigera wikitext]Coronavirus är en grupp virus inom underfamiljenOrthocoronavirinaei familjenCoronaviridae,inom ordningenNidovirales.[9][10]
Morfologi
[redigera|redigera wikitext]Coronavirus har enkelsträngat positivtRNA-genomoch består av ett antal proteiner som skapar dess struktur. Dessa är taggarna, de så kalladepeplomerna(S),lipidhöljet(E), membranet (M) och ett spiralformat omgivande proteinskal som kallasnukleokapsid(N).[11]Vissa coronavirus, speciellt de som tillhörBetacoronavirussubgrupp A, har även kortare tagglika protein som kallashaemagglutininesteras(HE).[9]
Genomens storlek varierar mellan 26 och 32kilobaspar(kbp); coronavirus är de största av allaRNA-virus.Vironerna är fullständiga viruspartiklar med en diameter av 120–160nm.
Namn
[redigera|redigera wikitext]Namnet "coronavirus" härstammar frånlatinetscoronaoch grekiskans κορώνη (korṓnē) som betyderkronaellerkorona.Detta refererar till vironets karaktäristiska form (den infekterande formen) betraktat i ettelektronmikroskop,då de har en kant av stora svällande utskott på ytan som vid elektronmikroskopi skapar en bild påminnande omsolenskorona. Dennamorfologiberor på de virala taggar (S) som förekommer på ytan av viruset och som bestämmer vilken värdorganism som kan infekteras.
Släkten
[redigera|redigera wikitext]- Släkte:Alphacoronavirus;typart:Alphacoronavirus 1[12][13]
- Exempel: Alpaca coronavirus, Alphacoronavirus 1,Humant coronavirus 229E,Humant coronavirus NL63,Miniopterus-fladdermus-coronavirus 1,Miniopterus-fladdermus-coronavirus HKU8,Svinepidemi-diarrévirus(PEDV),Rhinolophus-fladdermus-coronavirus HKU2,Scotophilus-fladdermus-coronavirus 512
- SläkteBetacoronavirus;typart:Mushepatitvirus
- Exempel: Humant coronavirus HKU1, Mushepatitvirus,Pipistrellus-fladdermus-coronavirus HKU5,Rousettus-fladdermus-coronavirus HKU9,SARS-CoV,Tylonycteris-fladdermus-coronavirus HKU4,MERS-CoV,Humant coronavirus OC43, Igelkott-coronavirus 1 (EriCoV),sars-cov-2
- SläkteGammacoronavirus;typart:Aviärt infektiöst bronkitvirus(IBV)
- Exempel: Avi coronavirus, Vitval-coronavirus SW1, Ank-coronavirus, Aviärt infektiöst bronkitvirus
- SläkteDeltacoronavirus;typart: Bulbyl-coronavirus HKU11
- Exempel: Bulbul-coronavirus HKU11, Munia-coronavirus HKU13, Trast-coronavirus HKU12
Evolution
[redigera|redigera wikitext]Den senaste gemensamma genetiska anfadern (MRCA) för alla coronavirus, har daterats till cirka 8000 f.Kr.[14][15]MRCA för Alphacoronavirus, Betacoronavirus, Gammacoronavirus och Deltacoronavirus har i sin tur daterats till cirka 2400 f.Kr, 3300 f.Kr, 2800 f.Kr och 3000 f.Kr. Indikationer tyder på attfåglarochfladdermössär ideala värdar för coronavirus.
Coronavirus som infekterar nötkreatur, kontra de som infekterar hunddjur divergerade först 1951.[16]Medan humant coronavirus OC43 divergerade från nötkreaturscoronavirus på 1890-talet.[17]
Middle East respiratory syndrome-relaterat coronavirus(MERS-CoV) är besläktat med flera fladdermus-coronavirus men verkar ha divergerat från dessa för flera hundra år sedan.[18] Humant coronavirus NL63 och fladdermus-coronavirus delade en MRCA för 563–822 år sedan.[19]
Det mest närbesläktade fladdermus-coronaviruset och SARS coronaviruset divergerade 1986.[20][21][22]
Coronavirus hos människan
[redigera|redigera wikitext]Det finns sju kända coronavirus som smittar människor och som ger varierande symtom. Några av dem är mycket vanliga och orsakar vanlig förkylning med exempelvis hosta och feber, medan exempelvisSARS- ochMERS-coronaviruskan orsaka allvarligare luftvägssjukdom.[23]Coronavirus kan orsaka mer eller mindre allvarliga luftvägsinfektioner med spektrum från mycket ringa symtom tillbronkitochlunginflammation,det senare en så kallad pneumonit eller följas av en sekundär sekundär bakteriellinflammation.[24]I svåra sjukdomsfall kan den sjuke avlida.[25]Oavsett vilken coronatyp det rör sig om sker smittspridningen mellan människor via luftrörssekret som droppar vid en hosta, nysning och liknande. Direkt kontaktsmitta framför allt via händer är en alternativ smittväg - "mun/näsa → hand till hand → mun/näsa".
De sju kända coronavirusen hos människan:
- Humant coronavirus 229E(HCoV-229E)
- Humant coronavirus OC43(HCoV-OC43)
- SARS-CoVsom orsakat sjukdomen sars
- Humant coronavirus NL63(HCoV-NL63)
- Humant coronavirus HKU1(HCov-HKU1)
- Middle East respiratory syndrome coronavirus(MERS-CoV), tidigare kallatNovel coronavirus 2012ochHCoV-EMC.
- Severe acute respiratory syndrome coronavirus 2, förkortatsars-cov-2[26][27],tidigare kallatNovel coronavirus 2019 (2019-nCoV) och Wuhan-coronavirus.[28]('Novel' i det här fallet betyder "nyligen upptäckt".)[26]
Coronavirusen HCoV-229E, -NL63, -OC43 och -HKU1 cirkulerar kontinuerligt inom den mänskliga populationen och orsakar luftvägsinfektioner hos vuxna och barn över hela världen.[29]
SARS-CoV
[redigera|redigera wikitext]Åren 2003–2004 utbröt enepidemiav ett nytt coronavirus, benämntSARS-CoV,som orsakade sjukdomensars(Severe acute respiratory syndrome/ "Svår akut respiratorisk sjukdom" ). Utbrottet omfattade mer än 8000 sjukdomsfall där över 750 personer avled i sviterna.[23]Smittan upptäcktes i Kina men spreds till ett flertal andra länder via resenärer. Smittan tros härstamma frånfladdermösssom smittat andra djurarter och slutligen människan.[23]Viruset hade relativt låg smittsamhet mellan människor vilket, tillsammans med internationellt smittskyddsarbete förmodligen, var orsak till att smittspridningen upphörde.[23]I förhållande till de andra coronavirusen var SARS-CoV ovanligt eftersom det kunde orsaka bådeakut övre- ochakut nedre luftvägsinfektion.[24]Forskarna började utveckla ett vaccin. De hann inte längre än till fas 1, alltså ett första försök på människor, innan epidemin dog ut av sig själv.[30]
MERS-CoV
[redigera|redigera wikitext]År 2012 upptäcktes ett nytt coronavirus påArabiska halvön,benämntMERS-CoV(Middle Eastern Respiratory Syndrome corona virus), som orsakar sjukdomenmers.[23]Viruset kan orsaka svårlunginflammation,men även komplikationer på andra organ - framföralltnjursvikt.[23]Samtliga kända fall har haft koppling till länder på denArabiska halvön,men det förekommer även enstaka personer som smittats av personer som vårdats iSydkorea,Storbritannien,FrankrikeochItalien.[23]Smittan tros härstamma från ett djur men den faktiska smittkällan är ännu okänd, även om det finns indikationer på att viruset kan härstamma fråndromedar.[23]Viruset har relativt låg smittsamhet mellan människor och de flesta dödlig fall har haft underliggande sjukdomar.[23]Spridning av viruset pågår fortfarande.[23]
Sars-cov-2
[redigera|redigera wikitext]I slutet av 2019 upptäcktes ett nytt coronavirus iWuhansom den 11 februari 2020 fick det officiella namnetsars-cov-2,[27]och som orsakade sjukdomencovid-19.Under januari 2020 bekräftades smittspridning mellan människor och mänskliga dödsfall på grund av sjukdomencovid-19som viruset orsakar.[27][31]Under perioden fram till sista januari 2020 ökade antalet rapporterade smittade till över 20 000 personer. Genom resenärer spred sig smittan till andra länder iAsien,Nordamerikaoch ett antal länder iEuropa.[32]I början av februari hade cirka 400 personer avlidit främst iFastlandskinamen också iFilippinernaochHongkong.I slutet av februari fanns det bekräftade fall i alla världsdelar utomAntarktis.Den 6 mars passerade det totala antalet kända infekterade 100 000 individer och tjugo dagar senare, den 26 mars fanns det en halv miljon kända individer i världen som smittas av viruset.[33]
Referenser
[redigera|redigera wikitext]Noter
[redigera|redigera wikitext]- ^”Virus Taxonomy: 2018b Release”(på engelska) (html).International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV).March 2019.https://talk.ictvonline.org/taxonomy/.Läst 24 januari 2020.
- ^”2017.012-015S”(på engelska) (xlsx).International Committee on Taxonomy of Viruses (ICTV).October 2018.https://talk.ictvonline.org/ictv/proposals/2017.012_015S.A.v1.Nidovirales.zip.Läst 24 januari 2020.
- ^Beaudette, Fred; Hudson, Charles (1937).” Cultivation of the virus of infectious bronchitis” (på engelska).Journal of the American Veterinary Medical Association(90): sid. 51-58.
- ^Almeida, June D.; Tyrrell, David A. J. (1967).”The Morphology of Three Previously Uncharacterized Human Respiratory Viruses that Grow in Organ Culture”(på engelska).Journal of General Virology(London, England: Microbiology Society) 1 (2): sid. 175-8.https:// microbiologyresearch.org/content/journal/jgv/10.1099/0022-1317-1-2-175.
- ^Estola, T. (1970).”Coronaviruses, a New Group of Animal RNA Viruses”.Avian Diseases14 (2): sid. 330–336.doi: .ISSN0005-2086.http:// jstor.org/stable/1588476.
- ^”Human coronaviruses: insights into environmental resistance and its influence on the development of new antiseptic strategies”.Viruses4 (11): sid. 3044–3068. November 2012.doi: .ISSN1999-4915.PMID 23202515.
- ^ [abcd]Joel Tivemo (2020-04-26)Okände svensken gjorde upptäckten av coronavirusen möjlig,Göteborgs-Posten,sid:14-15
- ^ [ab]AMQ King, red (2011).” FamilyCoronaviridae”.Ninth Report of the International Committee on Taxonomy of Viruses.Elsevier, Oxford. Sid. 806–828.ISBN 978-0-12-384684-6.
- ^International Committee on Taxonomy of Viruses (24 August 2010).”ICTV Master Species List 2009 – v10”(xls).ICTV Master Species List 2009 – v10.http://talk.ictvonline.org/files/ictv_documents/m/msl/1231/download.aspx.
- ^”Structure of SARS coronavirus spike receptor-binding domain complexed with receptor”.Science309 (5742): sid. 1864–1868. September 2005.doi: .PMID 16166518.Bibcode:2005Sci...309.1864L.https://semanticscholar.org/paper/bbedaafec1ea70e9ae405d1f2ac4c143951630bc.
- ^”Coronavirus gene 7 counteracts host defenses and modulates virus virulence”.PLoS Pathogens7 (6): sid. e1002090. June 2011.doi: .PMID 21695242.
- ^”Alphacoronavirus protein 7 modulates host innate immune response”.Journal of Virology87 (17): sid. 9754–67. September 2013.doi: .PMID 23824792.
- ^”A case for the ancient origin of coronaviruses”.Journal of Virology87 (12): sid. 7039–7045. June 2013.doi: .PMID 23596293.
- ^”Discovery of seven novel Mammalian and avian coronaviruses in the genus deltacoronavirus supports bat coronaviruses as the gene source of Alpha coronavirus and betacoronavirus and avian coronaviruses as the gene source of gammacoronavirus and deltacoronavirus”.Journal of Virology86 (7): sid. 3995–4008. April 2012.doi: .PMID 22278237.
- ^”Evolutionary dynamics of bovine coronaviruses: natural selection pattern of the spike gene implies adaptive evolution of the strains”.The Journal of General Virology94 (Pt 9): sid. 2036–2049. September 2013.doi: .PMID 23804565.https://semanticscholar.org/paper/cd52428d528903edd0fdd3ae09f1cb1bddfc8c2d.
- ^”Complete genomic sequence of human coronavirus OC43: molecular clock analysis suggests a relatively recent zoonotic coronavirus transmission event”.Journal of Virology79 (3): sid. 1595–1604. February 2005.doi: .PMID 15650185.
- ^”Genetic characterization of Betacoronavirus lineage C viruses in bats reveals marked sequence divergence in the spike protein of pipistrellus bat coronavirus HKU5 in Japanese pipistrelle: implications for the origin of the novel Middle East respiratory syndrome coronavirus”.Journal of Virology87 (15): sid. 8638–8650. August 2013.doi: .PMID 23720729.
- ^”Evidence supporting a zoonotic origin of human coronavirus strain NL63”.Journal of Virology86 (23): sid. 12816–12825. December 2012.doi: .PMID 22993147.
- ^”Evolutionary insights into the ecology of coronaviruses”.Journal of Virology81 (8): sid. 4012–4020. April 2007.doi: .PMID 17267506.
- ^”SARS-Coronavirus ancestor's foot-prints in South-East Asian bat colonies and the refuge theory”.Infection, Genetics and Evolution11 (7): sid. 1690–702. October 2011.doi: .PMID 21763784.
- ^”Evolutionary relationships between bat coronaviruses and their hosts”.Emerging Infectious Diseases13 (10): sid. 1526–1532. October 2007.doi: .PMID 18258002.
- ^ [abcdefghij]Folkhälsomyndigheten(2020-01-21)Sjukdomsinformation om coronavirus inklusive sars och mers,läst 2020-01-31
- ^ [ab]”Healthcare-associated atypical pneumonia”.Seminars in Respiratory and Critical Care Medicine30 (1): sid. 67–85. February 2009.doi: .PMID 19199189.
- ^”Coronavirus death reported in France”.bbc.co.uk, på engelska.http:// bbc.co.uk/news/health-22691699.Läst 10 juni 2013.
- ^ [ab]”Novel Coronavirus 2019, Wuhan, China | CDC”.cdc.gov.23 January 2020.https:// cdc.gov/coronavirus/2019-ncov/index.html.
- ^ [abc]Global Biodefense (2020-02-11)WHO Names Disease Caused by New Coronavirus: COVID-19,läst 2020-02-13
- ^”Pneumonia of unknown cause – China”.Pneumonia of unknown cause – China.World Health Organization. 5 January 2020.https:// who.int/csr/don/05-january-2020-pneumonia-of-unkown-cause-china/en/.
- ^”Hosts and Sources of Endemic Human Coronaviruses”.Advances in Virus Research100: sid. 163–188. 2018.doi: .ISBN 978-0-12-815201-0.PMID 29551135.
- ^”Jakten på vaccin mot Coronavirus”.forskning.se.25 februari 2020.https:// forskning.se/2020/02/25/jakten-pa-vaccin-mot-coronavirus/.Läst 27 februari 2020.
- ^”Novel Coronavirus (2019-nCoV) SITUATION REPORT - 1 21 JANUARY 2020”.https:// who.int/docs/default-source/coronaviruse/situation-reports/20200121-sitrep-1-2019-ncov.pdf.Läst 23 januari 2020.
- ^”Novel Coronavirus (2019-nCoV) SITUATION REPORT - 12”.https:// who.int/docs/default-source/coronaviruse/situation-reports/20200201-sitrep-12-ncov.pdf?sfvrsn=273c5d35_2.Läst 1 februari 2020.
- ^”COVID Live - Coronavirus Statistics - Worldometer”.worldometers.info.https:// worldometers.info/coronavirus/.Läst 20 maj 2022.
Webbkällor
[redigera|redigera wikitext]Europeiska smittskyddsmyndigheten,läst 2013-05-30
Översättning
[redigera|redigera wikitext]- Delar av texten bygger på en översättning av engelskspråkiga Wikipedias artikelCoronavirus,läst 2020-01-28
|
|