北京胡亚美儿童医学研究院是以中国著名儿科专家、中国小儿内科领域唯一的工程院院士胡亚美而命名，由中国工程院院士胡亚美和我国小儿外科主要创始人之一，国际小儿外科最高奖项“丹尼斯·布朗”金奖获得者，中国小儿外科唯一的工程院院士张金哲两位院士任院长。