NCS1

NCS1
Наявні структури PDB Пошук ортологів:PDBeRCSB Список кодів PDB 4GUK,1G8I,2LCP,5AER,5AFP,5AEQ
Ідентифікатори
Символи	NCS1,FLUP, FREQ, neuronal calcium sensor 1
Зовнішні ІД	OMIM:603315MGI:109166HomoloGene:5719GeneCards:NCS1
Пов'язані генетичні захворювання
хвороба Альцгеймера
Онтологія гена Молекулярна функція •calcium ion binding •voltage-gated calcium channel activity •зв'язування з іоном металу •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •magnesium ion binding •protein kinase binding •voltage-gated calcium channel activity involved in regulation of presynaptic cytosolic calcium levels Клітинна компонента •цитоплазма •гіалоплазма •postsynaptic membrane •комплекс Ґольджі •мембрана •GO:0097483, GO:0097481 постсинаптичне ущільнення •внутрішньоклітинна мембранна органела •клітинна мембрана •синапс •аксон •міжклітинні контакти •дендрит (нейробіологія) •perinuclear region of cytoplasm •dense core granule •GO:0016023 cytoplasmic vesicle •calyx of Held •postsynapse •glutamatergic synapse •presynaptic cytosol •postsynaptic cytosol Біологічний процес •regulation of neuron projection development •calcium ion transmembrane transport •positive regulation of exocytosis •phosphatidylinositol-mediated signaling •regulation of synaptic vesicle exocytosis •regulation of presynaptic cytosolic calcium ion concentration Джерела:Amigo/QuickGO
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	23413	14299
Ensembl	ENSG00000107130	ENSMUSG00000062661
UniProt	P62166	Q8BNY6
RefSeq (мРНК)	NM_014286 NM_001128826	NM_019681
RefSeq (білок)	NP_001122298 NP_055101	NP_062655
Локус (UCSC)	Хр. 9: 130.17 – 130.24 Mb	Хр. 2: 31.14 – 31.19 Mb
PubMedsearch
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

NCS1(англ.Neuronal calcium sensor 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 9-ї хромосоми.Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 190амінокислот,амолекулярна маса— 21 879.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MGKSNSKLKP		EVVEELTRKT		YFTEKEVQQW		YKGFIKDCPS		GQLDAAGFQK
IYKQFFPFGD		PTKFATFVFN		VFDENKDGRI		EFSEFIQALS		VTSRGTLDEK
LRWAFKLYDL		DNDGYITRNE		MLDIVDAIYQ		MVGNTVELPE		EENTPEKRVD
RIFAMMDKNA		DGKLTLQEFQ		EGSKADPSIV		QALSLYDGLV

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Задіяний у такому біологічному процесі, якальтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономкальцію. Локалізований уклітинній мембрані,цитоплазмі,мембрані, клітинних контактах,апараті гольджі,синапсах.

Література

• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14:2121—2127. 2004.PMID15489334DOI:10.1101/gr.2596504
• Haynes L.P., Sherwood M.W., Dolman N.J., Burgoyne R.D. (2007). Specificity, promiscuity and localization of ARF protein interactions with NCS-1 and phosphatidylinositol-4 kinase-III beta.Traffic.8:1080—1092.PMID17555535DOI:10.1111/j.1600-0854.2007.00594.x
• Bourne Y., Dannenberg J., Pollmann V., Marchot P., Pongs O. (2001). Immunocytochemical localization and crystal structure of human frequenin (neuronal calcium sensor 1).J. Biol. Chem.276:11949—11955.PMID11092894DOI:10.1074/jbc.M009373200

Див. також

• Хромосома 9