CTCF
Перейти до навігації
Перейти до пошуку
CTCF(англ.CCCTC-binding factor) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 16-ї хромосоми.[4]Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 727амінокислот,амолекулярна маса— 82 785[5].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MEGDAVEAIV | EESETFIKGK | ERKTYQRRRE | GGQEEDACHL | PQNQTDGGEV | ||||
VQDVNSSVQM | VMMEQLDPTL | LQMKTEVMEG | TVAPEAEAAV | DDTQIITLQV | ||||
VNMEEQPINI | GELQLVQVPV | PVTVPVATTS | VEELQGAYEN | EVSKEGLAES | ||||
EPMICHTLPL | PEGFQVVKVG | ANGEVETLEQ | GELPPQEDPS | WQKDPDYQPP | ||||
AKKTKKTKKS | KLRYTEEGKD | VDVSVYDFEE | EQQEGLLSEV | NAEKVVGNMK | ||||
PPKPTKIKKK | GVKKTFQCEL | CSYTCPRRSN | LDRHMKSHTD | ERPHKCHLCG | ||||
RAFRTVTLLR | NHLNTHTGTR | PHKCPDCDMA | FVTSGELVRH | RRYKHTHEKP | ||||
FKCSMCDYAS | VEVSKLKRHI | RSHTGERPFQ | CSLCSYASRD | TYKLKRHMRT | ||||
HSGEKPYECY | ICHARFTQSG | TMKMHILQKH | TENVAKFHCP | HCDTVIARKS | ||||
DLGVHLRKQH | SYIEQGKKCR | YCDAVFHERY | ALIQHQKSHK | NEKRFKCDQC | ||||
DYACRQERHM | IMHKRTHTGE | KPYACSHCDK | TFRQKQLLDM | HFKRYHDPNF | ||||
VPAAFVCSKC | GKTFTRRNTM | ARHADNCAGP | DGVEGENGGE | TKKSKRGRKR | ||||
KMRSKKEDSS | DSENAEPDLD | DNEDEEEPAV | EIEPEPEPQP | VTPAPPPAKK | ||||
RRGRPPGRTN | QPKQNQPTAI | IQVEDQNTGA | IENIIVEVKK | EPDAEPAEGE | ||||
EEEAQPAATD | APNGDLTPEM | ILSMMDR |
Кодований геном білок за функціями належить дорепресорів,активаторів,регуляторів хроматину,фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція,регуляціятранскрипції,розходження хромосом,ацетилювання,альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку,ДНК. Локалізований уядрі,хромосомах,центромерах.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14:2121—2127. 2004.PMID15489334DOI:10.1101/gr.2596504
- Vostrov A.A., Quitschke W.W. (1997). The zinc finger protein CTCF binds to the APBbeta domain of the amyloid beta-protein precursor promoter. Evidence for a role in transcriptional activation.J. Biol. Chem.272:33353—33359.PMID9407128DOI:10.1074/jbc.272.52.33353
- Klenova E.M., Morse H.C. III, Ohlsson R., Lobanenkov V.V. (2002). The novel BORIS + CTCF gene family is uniquely involved in the epigenetics of normal biology and cancer.Semin. Cancer Biol.12:399—414.PMID12191639DOI:10.1016/S1044-579X(02)00060-3
- Chao W., Huynh K.D., Spencer R.J., Davidow L.S., Lee J.T. (2002). CTCF, a candidate trans-acting factor for X-inactivation choice.Science.295:345—347.PMID11743158DOI:10.1126/science.1065982
- Ishihara K., Oshimura M., Nakao M. (2006). CTCF-dependent chromatin insulator is linked to epigenetic remodeling.Mol. Cell.23:733—742.PMID16949368DOI:10.1016/j.molcel.2006.08.008
- Majumder P., Gomez J.A., Chadwick B.P., Boss J.M. (2008). The insulator factor CTCF controls MHC class II gene expression and is required for the formation of long-distance chromatin interactions.J. Exp. Med.205:785—798.PMID18347100DOI:10.1084/jem.20071843
- ↑Захворювання, генетично пов'язані з CTCF переглянути/редагувати посилання на ВікіДаних.
- ↑Human PubMed Reference:.
- ↑Mouse PubMed Reference:.
- ↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:13723(англ.). Архіворигіналуза 12 жовтня 2018.Процитовано 11 вересня 2017.
- ↑UniProt, P49711(англ.). Архіворигіналуза 2 вересня 2017.Процитовано 11 вересня 2017.
![]() |
Це незавершена стаття пробілки. Ви можетедопомогтипроєкту,виправивши або дописавши її. |