Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
FOXD3
Ідентифікатори
Символи
FOXD3 ,AIS1, Genesis, HFH2, VAMAS2, forkhead box D3
Зовнішні ІД
OMIM :611539 MGI: 1347473 HomoloGene: 49239 GeneCards: FOXD3
Онтологія гена
Молекулярна функція
• GO:0001948, GO:0016582 protein binding • GO:0001078, GO:0001214, GO:0001206 DNA-binding transcription repressor activity, RNA polymerase II-specific • sequence-specific DNA binding • RNA polymerase II transcription regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• нуклеоплазма • клітинне ядро
Біологічний процес
• GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • multicellular organism development • somatic stem cell population maintenance • in utero embryonic development • transcription, DNA-templated • anatomical structure morphogenesis • диференціація клітин • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo /QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 1: 63.32 – 63.33 Mb
Хр. 4: 99.54 – 99.55 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
FOXD3 (англ. Forkhead box D3 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 1-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 478амінокислот ,амолекулярна маса — 47 630[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MTLSGGGSAS DMSGQTVLTA EDVDIDVVGE GDDGLEEKDS DAGCDSPAGP
PELRLDEADE VPPAAPHHGQ PQPPHQQPLT LPKEAAGAGA GPGGDVGAPE
ADGCKGGVGG EEGGASGGGP GAGSGSAGGL APSKPKNSLV KPPYSYIALI
TMAILQSPQK KLTLSGICEF ISNRFPYYRE KFPAWQNSIR HNLSLNDCFV
KIPREPGNPG KGNYWTLDPQ SEDMFDNGSF LRRRKRFKRH QQEHLREQTA
LMMQSFGAYS LAAAAGAAGP YGRPYGLHPA AAAGAYSHPA AAAAAAAAAA
LQYPYALPPV APVLPPAVPL LPSGELGRKA AAFGSQLGPG LQLQLNSLGA
AAAAAGTAGA AGTTASLIKS EPSARPSFSI ENIIGGGPAA PGGSAVGAGV
AGGTGGSGGG STAQSFLRPP GTVQSAALMA THQPLSLSRT TATIAPILSV
PLSGQFLQPA ASAAAAAAAA AQAKWPAQ
Кодований геном білок за функціями належить дорепресорів ,активаторів ,білків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах яктранскрипція ,регуляціятранскрипції .
Білок має сайт для зв'язування зДНК .
Локалізований уядрі .
Alkhateeb A., Fain P.R., Spritz R.A. (2005). Candidate functional promoter variant in the FOXD3 melanoblast developmental regulator gene in autosomal dominant vitiligo.J. Invest. Dermatol .125 :388—391. PMID 16098053 DOI :10.1111/j.0022-202X.2005.23822.x
Hromas R., Moore J., Johnston T., Socha C., Klemsz M. (1993). Drosophila forkhead homologues are expressed in a lineage-restricted manner in human hematopoietic cells.Blood .81 :2854—2859. PMID 8499623
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші