Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
HOXC12
Ідентифікатори
Символи
HOXC12 ,HOC3F, HOX3, HOX3F, homeobox C12
Зовнішні ІД
OMIM :142975 MGI: 96194 HomoloGene: 7769 GeneCards: HOXC12
Онтологія гена
Молекулярна функція
• sequence-specific DNA binding • DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• клітинне ядро
Біологічний процес
• multicellular organism development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • transcription, DNA-templated • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II
Джерела:Amigo /QuickGO
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 12: 53.95 – 53.96 Mb
Хр. 15: 102.85 – 102.85 Mb
PubMed search
[ 1]
[ 2] Вікідані
HOXC12 (англ. Homeobox C12 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 12-ї хромосоми.[ 3] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 282амінокислот ,амолекулярна маса — 30 171[ 4] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MGEHNLLNPG FVGPLVNIHT GDTFYFPNFR ASGAQLPGLP SLSYPRRDNV
CSLSWPSAEP CNGYPQPYLG SPVSLNPPFG RTCELARVED GKGYYREPCA
EGGGGGLKRE ERGRDPGAGP GAALLPLEPS GPPALGFKYD YAAGGGGGDG
GGGAGPPHDP PSCQSLESDS SSSLLNEGNK GAGAGDPGSL VSPLNPGGGL
SASGAPWYPI NSRSRKKRKP YSKLQLAELE GEFLVNEFIT RQRRRELSDR
LNLSDQQVKI WFQNRRMKKK RLLLREQALS FF
Кодований геном білок за функцією належить добілків розвитку .
Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція ,регуляціятранскрипції .
Білок має сайт для зв'язування зДНК .
Локалізований уядрі .
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші