KDM5D
Перейти до навігації
Перейти до пошуку
KDM5D(англ.Lysine demethylase 5D) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на Y-хромосомі.[3]Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 1 539амінокислот,амолекулярна маса— 174 073[4].
Послідовність амінокислот
10 | 20 | 30 | 40 | 50 | ||||
---|---|---|---|---|---|---|---|---|
MEPGCDEFLP | PPECPVFEPS | WAEFQDPLGY | IAKIRPIAEK | SGICKIRPPA | ||||
DWQPPFAVEV | DNFRFTPRVQ | RLNELEAQTR | VKLNYLDQIA | KFWEIQGSSL | ||||
KIPNVERKIL | DLYSLSKIVI | EEGGYEAICK | DRRWARVAQR | LHYPPGKNIG | ||||
SLLRSHYERI | IYPYEMFQSG | ANHVQCNTHP | FDNEVKDKEY | KPHSIPLRQS | ||||
VQPSKFSSYS | RRAKRLQPDP | EPTEEDIEKH | PELKKLQIYG | PGPKMMGLGL | ||||
MAKDKDKTVH | KKVTCPPTVT | VKDEQSGGGN | VSSTLLKQHL | SLEPCTKTTM | ||||
QLRKNHSSAQ | FIDSYICQVC | SRGDEDDKLL | FCDGCDDNYH | IFCLLPPLPE | ||||
IPRGIWRCPK | CILAECKQPP | EAFGFEQATQ | EYSLQSFGEM | ADSFKSDYFN | ||||
MPVHMVPTEL | VEKEFWRLVS | SIEEDVTVEY | GADIHSKEFG | SGFPVSNSKQ | ||||
NLSPEEKEYA | TSGWNLNVMP | VLDQSVLCHI | NADISGMKVP | WLYVGMVFSA | ||||
FCWHIEDHWS | YSINYLHWGE | PKTWYGVPSL | AAEHLEEVMK | MLTPELFDSQ | ||||
PDLLHQLVTL | MNPNTLMSHG | VPVVRTNQCA | GEFVITFPRA | YHSGFNQGYN | ||||
FAEAVNFCTA | DWLPAGRQCI | EHYRRLRRYC | VFSHEELICK | MAAFPETLDL | ||||
NLAVAVHKEM | FIMVQEERRL | RKALLEKGVT | EAEREAFELL | PDDERQCIKC | ||||
KTTCFLSALA | CYDCPDGLVC | LSHINDLCKC | SSSRQYLRYR | YTLDELPTML | ||||
HKLKIRAESF | DTWANKVRVA | LEVEDGRKRS | FEELRALESE | ARERRFPNSE | ||||
LLQRLKNCLS | EVEACIAQVL | GLVSGQVARM | DTPQLTLTEL | RVLLEQMGSL | ||||
PCAMHQIGDV | KDVLEQVEAY | QAEAREALAT | LPSSPGLLRS | LLERGQQLGV | ||||
EVPEAHQLQQ | QVEQAQWLDE | VKQALAPSAH | RGSLVIMQGL | LVMGAKIASS | ||||
PSVDKARAEL | QELLTIAERW | EEKAHFCLEA | RQKHPPATLE | AIIRETENIP | ||||
VHLPNIQALK | EALTKAQAWI | ADVDEIQNGD | HYPCLDDLEG | LVAVGRDLPV | ||||
GLEELRQLEL | QVLTAHSWRE | KASKTFLKKN | SCYTLLEVLC | PCADAGSDST | ||||
KRSRWMEKAL | GLYQCDTELL | GLSAQDLRDP | GSVIVAFKEG | EQKEKEGILQ | ||||
LRRTNSAKPS | PLAPSLMASS | PTSICVCGQV | PAGVGVLQCD | LCQDWFHGQC | ||||
VSVPHLLTSP | KPSLTSSPLL | AWWEWDTKFL | CPLCMRSRRP | RLETILALLV | ||||
ALQRLPVRLP | EGEALQCLTE | RAIGWQDRAR | KALASEDVTA | LLRQLAELRQ | ||||
QLQAKPRPEE | ASVYTSATAC | DPIREGSGNN | ISKVQGLLEN | GDSVTSPENM | ||||
APGKGSDLEL | LSSLLPQLTG | PVLELPEAIR | APLEELMMEG | DLLEVTLDEN | ||||
HSIWQLLQAG | QPPDLDRIRT | LLELEKFEHQ | GSRTRSRALE | RRRRRQKVDQ | ||||
GRNVENLVQQ | ELQSKRARSS | GIMSQVGREE | EHYQEKADRE | NMFLTPSTDH | ||||
SPFLKGNQNS | LQHKDSGSSA | ACPSLMPLLQ | LSYSDEQQL |
Кодований геном білок за функціями належить дооксидоредуктаз,регуляторів хроматину. Задіяний у таких біологічних процесах, яктранскрипція,регуляціятранскрипції,альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування з іонами металів, іономцинку,іономзаліза. Локалізований уядрі.
- The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14:2121—2127. 2004.PMID15489334DOI:10.1101/gr.2596504
- Agulnik A.I., Bishop C.E., Lerner J.L., Agulnik S.I., Solovyev V.V. (1997). Analysis of mutation rates in the SMCY/SMCX genes shows that mammalian evolution is male driven.Mamm. Genome.8:134—138.PMID9060413DOI:10.1007/s003359900372
- Lee M.G., Norman J., Shilatifard A., Shiekhattar R. (2007). Physical and functional association of a trimethyl H3K4 demethylase and Ring6a/MBLR, a polycomb-like protein.Cell.128:877—887.PMID17320162DOI:10.1016/j.cell.2007.02.004
- Akimoto C., Kitagawa H., Matsumoto T., Kato S. (2008). Spermatogenesis-specific association of SMCY and MSH5.Genes Cells.13:623—633.PMID18459961DOI:10.1111/j.1365-2443.2008.01193.x
- ↑Human PubMed Reference:.
- ↑Mouse PubMed Reference:.
- ↑HUGO Gene Nomenclature Commitee, HGNC:11115(англ.).Процитовано 13 вересня 2017.
{{cite web}}
:Обслуговування CS1: Сторінки з параметром url-status, але без параметра archive-url (посилання) - ↑UniProt, Q9BY66(англ.). Архіворигіналуза 12 жовтня 2016.Процитовано 13 вересня 2017.
Це незавершена стаття пробілки. Ви можетедопомогтипроєкту,виправивши або дописавши її. |