STAT1

STAT1
Наявні структури PDB Пошук ортологів:PDBeRCSB Список кодів PDB 3WWT,1BF5,1YVL,2KA6
Ідентифікатори
Символи	STAT1,CANDF7, IMD31A, IMD31B, IMD31C, ISGF-3, STAT91, signal transducer and activator of transcription 1
Зовнішні ІД	OMIM:600555MGI:103063HomoloGene:21428GeneCards:STAT1
Пов'язані генетичні захворювання
chronic mucocutaneous candidiasis,susceptibility to viral and mycobacterial infections
Онтологія гена Молекулярна функція •DNA binding •protein homodimerization activity •GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity •GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity •signal transducer activity •GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding •GO:0001948, GO:0016582 protein binding •identical protein binding •enzyme binding •tumor necrosis factor receptor binding •double-stranded DNA binding •RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding •cadherin binding •histone acetyltransferase binding •GO:0031493 histone binding •ubiquitin-like protein ligase binding •promoter-specific chromatin binding •sequence-specific DNA binding •GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific •transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding •CCR5 chemokine receptor binding •protein phosphatase 2A binding •GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific Клітинна компонента •цитоплазма •нуклеоплазма •ядерце •perinuclear region of cytoplasm •клітинне ядро •гіалоплазма •аксон •дендрит (нейробіологія) •GO:0009327 protein-containing complex Біологічний процес •regulation of apoptotic process •metanephric mesenchymal cell proliferation involved in metanephros development •GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated •cellular response to interferon-beta •GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II •negative regulation of mesenchymal to epithelial transition involved in metanephros morphogenesis •metanephric mesenchymal cell differentiation •tumor necrosis factor-mediated signaling pathway •GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II •renal tubule development •response to interferon-beta •negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling •transcription, DNA-templated •negative regulation of endothelial cell proliferation •regulation of type I interferon-mediated signaling pathway •regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway •positive regulation of mesenchymal cell proliferation •negative regulation of metanephric nephron tubule epithelial cell differentiation •negative regulation of angiogenesis •negative regulation by virus of viral protein levels in host cell •GO:0022415 viral process •endothelial cell migration •GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II •GO:0072468 сигнальна трансдукція •macrophage derived foam cell differentiation •positive regulation of erythrocyte differentiation •type I interferon signaling pathway •cellular response to interferon-gamma •positive regulation of defense response to virus by host •positive regulation of interferon-alpha production •GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated •defense response to virus •interferon-gamma-mediated signaling pathway •receptor signaling pathway via JAK-STAT •response to nutrient •кровообіг •positive regulation of cell population proliferation •response to mechanical stimulus •GO:1904578 response to organic cyclic compound •cellular response to insulin stimulus •response to cytokine •response to hydrogen peroxide •response to peptide hormone •positive regulation of smooth muscle cell proliferation •response to cAMP •positive regulation of nitric-oxide synthase biosynthetic process •cellular response to cytokine stimulus •GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound •positive regulation of transcription of Notch receptor target •cytokine-mediated signaling pathway •interleukin-21-mediated signaling pathway •interleukin-6-mediated signaling pathway •interleukin-27-mediated signaling pathway •interleukin-35-mediated signaling pathway •interleukin-9-mediated signaling pathway •defense response •regulation of cell population proliferation Джерела:Amigo/QuickGO
Шаблонекспресії
Більше даних
Ортологи
Види	Людина	Миша
Entrez	6772	20846
Ensembl	ENSG00000115415	ENSMUSG00000026104
UniProt	P42224	P42225
RefSeq (мРНК)	NM_007315 NM_139266	NM_001205313 NM_001205314 NM_009283 NM_001357627
RefSeq (білок)	NP_009330 NP_644671	н/д
Локус (UCSC)	Хр. 2: 190.91 – 191.02 Mb	Хр. 1: 52.16 – 52.2 Mb
PubMedsearch
Вікідані
Див./Ред. для людей Див./Ред. для мишей

STAT1(англ.Signal transducer and activator of transcription 1) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 750амінокислот,амолекулярна маса— 87 335.

Послідовність амінокислот

10		20		30		40		50
MSQWYELQQL		DSKFLEQVHQ		LYDDSFPMEI		RQYLAQWLEK		QDWEHAANDV
SFATIRFHDL		LSQLDDQYSR		FSLENNFLLQ		HNIRKSKRNL		QDNFQEDPIQ
MSMIIYSCLK		EERKILENAQ		RFNQAQSGNI		QSTVMLDKQK		ELDSKVRNVK
DKVMCIEHEI		KSLEDLQDEY		DFKCKTLQNR		EHETNGVAKS		DQKQEQLLLK
KMYLMLDNKR		KEVVHKIIEL		LNVTELTQNA		LINDELVEWK		RRQQSACIGG
PPNACLDQLQ		NWFTIVAESL		QQVRQQLKKL		EELEQKYTYE		HDPITKNKQV
LWDRTFSLFQ		QLIQSSFVVE		RQPCMPTHPQ		RPLVLKTGVQ		FTVKLRLLVK
LQELNYNLKV		KVLFDKDVNE		RNTVKGFRKF		NILGTHTKVM		NMEESTNGSL
AAEFRHLQLK		EQKNAGTRTN		EGPLIVTEEL		HSLSFETQLC		QPGLVIDLET
TSLPVVVISN		VSQLPSGWAS		ILWYNMLVAE		PRNLSFFLTP		PCARWAQLSE
VLSWQFSSVT		KRGLNVDQLN		MLGEKLLGPN		ASPDGLIPWT		RFCKENINDK
NFPFWLWIES		ILELIKKHLL		PLWNDGCIMG		FISKERERAL		LKDQQPGTFL
LRFSESSREG		AITFTWVERS		QNGGEPDFHA		VEPYTKKELS		AVTFPDIIRN
YKVMAAENIP		ENPLKYLYPN		IDKDHAFGKY		YSRPKEAPEP		MELDGPKGTG
YIKTELISVS		EVHPSRLQTT		DNLLPMSPEE		FDEVSRIVGS		VEFDSMMNTV

A:Аланін
C:Цистеїн
D:Аспарагінова кислота
E:Глутамінова кислота
F:Фенілаланін
G:Гліцин
H:Гістидин
I:Ізолейцин
K:Лізин
L:Лейцин
M:Метіонін
N:Аспарагін
P:Пролін
Q:Глутамін
R:Аргінін
S:Серин
T:Треонін
V:Валін
W:Триптофан

Y:Тирозин

Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів,фосфопротеїнів. Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус,транскрипція,регуляціятранскрипції,антивірусний захист, поліморфізм, ацетиляція,альтернативний сплайсинг. Білок має сайт для зв'язування зДНК. Локалізований уцитоплазмі,ядрі.

Література

• Schindler C., Fu X.-Y., Improta T., Aebersold R., Darnell J.E. Jr. (1992). Proteins of transcription factor ISGF-3: one gene encodes the 91- and 84-kDa ISGF-3 proteins that are activated by interferon alpha.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A.89:7836—7839.PMID1502203DOI:10.1073/pnas.89.16.7836
• The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res.14:2121—2127. 2004.PMID15489334DOI:10.1101/gr.2596504
• Yan R., Qureshi S., Zhong Z., Wen Z., Darnell J.E. Jr. (1995). The genomic structure of the STAT genes: multiple exons in coincident sites in Stat1 and Stat2.Nucleic Acids Res.23:459—463.PMID7885841DOI:10.1093/nar/23.3.459
• Fu X.Y. (1992). A transcription factor with SH2 and SH3 domains is directly activated by an interferon alpha-induced cytoplasmic protein tyrosine kinase(s).Cell.70:323—335.PMID1638633DOI:10.1016/0092-8674(92)90106-M
• Wen Z., Zhong Z., Darnell J.E. Jr. (1995). Maximal activation of transcription by Stat1 and Stat3 requires both tyrosine and serine phosphorylation.Cell.82:241—250.PMID7543024DOI:10.1016/0092-8674(95)90311-9
• Li X., Leung S., Kerr I.M., Stark G.R. (1997).Functional subdomains of STAT2 required for preassociation with the alpha interferon receptor and for signaling.Mol. Cell. Biol.17:2048—2056.PMID9121453DOI:10.1128/MCB.17.4.2048

Див. також

• Хромосома 2