Матеріал з Вікіпедії — вільної енциклопедії.
STAT1
Ідентифікатори
Символи
STAT1 ,CANDF7, IMD31A, IMD31B, IMD31C, ISGF-3, STAT91, signal transducer and activator of transcription 1
Зовнішні ІД
OMIM :600555 MGI: 103063 HomoloGene: 21428 GeneCards: STAT1
Пов'язані генетичні захворювання
chronic mucocutaneous candidiasis ,susceptibility to viral and mycobacterial infections [ 1]
Онтологія гена
Молекулярна функція
• DNA binding • protein homodimerization activity • GO:0001131, GO:0001151, GO:0001130, GO:0001204 DNA-binding transcription factor activity • GO:0000983 RNA polymerase II general transcription initiation factor activity • signal transducer activity • GO:0000980 RNA polymerase II cis-regulatory region sequence-specific DNA binding • GO:0001948, GO:0016582 protein binding • identical protein binding • enzyme binding • tumor necrosis factor receptor binding • double-stranded DNA binding • RNA polymerase II core promoter sequence-specific DNA binding • cadherin binding • histone acetyltransferase binding • GO:0031493 histone binding • ubiquitin-like protein ligase binding • promoter-specific chromatin binding • sequence-specific DNA binding • GO:0001200, GO:0001133, GO:0001201 DNA-binding transcription factor activity, RNA polymerase II-specific • transcription factor activity, RNA polymerase II core promoter proximal region sequence-specific binding • CCR5 chemokine receptor binding • protein phosphatase 2A binding • GO:0001077, GO:0001212, GO:0001213, GO:0001211, GO:0001205 DNA-binding transcription activator activity, RNA polymerase II-specific
Клітинна компонента
• цитоплазма • нуклеоплазма • ядерце • perinuclear region of cytoplasm • клітинне ядро • гіалоплазма • аксон • дендрит (нейробіологія) • GO:0009327 protein-containing complex
Біологічний процес
• regulation of apoptotic process • metanephric mesenchymal cell proliferation involved in metanephros development • GO:0009373 regulation of transcription, DNA-templated • cellular response to interferon-beta • GO:0044324, GO:0003256, GO:1901213, GO:0046019, GO:0046020, GO:1900094, GO:0061216, GO:0060994, GO:1902064, GO:0003258, GO:0072212 regulation of transcription by RNA polymerase II • negative regulation of mesenchymal to epithelial transition involved in metanephros morphogenesis • metanephric mesenchymal cell differentiation • tumor necrosis factor-mediated signaling pathway • GO:1901227 negative regulation of transcription by RNA polymerase II • renal tubule development • response to interferon-beta • negative regulation of I-kappaB kinase/NF-kappaB signaling • transcription, DNA-templated • negative regulation of endothelial cell proliferation • regulation of type I interferon-mediated signaling pathway • regulation of interferon-gamma-mediated signaling pathway • positive regulation of mesenchymal cell proliferation • negative regulation of metanephric nephron tubule epithelial cell differentiation • negative regulation of angiogenesis • negative regulation by virus of viral protein levels in host cell • GO:0022415 viral process • endothelial cell migration • GO:0003257, GO:0010735, GO:1901228, GO:1900622, GO:1904488 positive regulation of transcription by RNA polymerase II • GO:0072468 сигнальна трансдукція • macrophage derived foam cell differentiation • positive regulation of erythrocyte differentiation • type I interferon signaling pathway • cellular response to interferon-gamma • positive regulation of defense response to virus by host • positive regulation of interferon-alpha production • GO:0060469, GO:0009371 positive regulation of transcription, DNA-templated • defense response to virus • interferon-gamma-mediated signaling pathway • receptor signaling pathway via JAK-STAT • response to nutrient • кровообіг • positive regulation of cell population proliferation • response to mechanical stimulus • GO:1904578 response to organic cyclic compound • cellular response to insulin stimulus • response to cytokine • response to hydrogen peroxide • response to peptide hormone • positive regulation of smooth muscle cell proliferation • response to cAMP • positive regulation of nitric-oxide synthase biosynthetic process • cellular response to cytokine stimulus • GO:1904579 cellular response to organic cyclic compound • positive regulation of transcription of Notch receptor target • cytokine-mediated signaling pathway • interleukin-21-mediated signaling pathway • interleukin-6-mediated signaling pathway • interleukin-27-mediated signaling pathway • interleukin-35-mediated signaling pathway • interleukin-9-mediated signaling pathway • defense response • regulation of cell population proliferation
Джерела:Amigo /QuickGO
Шаблонекспресії
Більше даних
Ортологи
Види
Людина
Миша
Entrez
Ensembl
UniProt
RefSeq (мРНК)
RefSeq (білок)
Локус (UCSC)
Хр. 2: 190.91 – 191.02 Mb
Хр. 1: 52.16 – 52.2 Mb
PubMed search
[ 2]
[ 3] Вікідані
STAT1 (англ. Signal transducer and activator of transcription 1 ) – білок, який кодується однойменним геном, розташованим у людей на короткому плечі 2-ї хромосоми.[ 4] Довжина поліпептидного ланцюга білка становить 750амінокислот ,амолекулярна маса — 87 335[ 5] .
Послідовність амінокислот
10 20 30 40 50
MSQWYELQQL DSKFLEQVHQ LYDDSFPMEI RQYLAQWLEK QDWEHAANDV
SFATIRFHDL LSQLDDQYSR FSLENNFLLQ HNIRKSKRNL QDNFQEDPIQ
MSMIIYSCLK EERKILENAQ RFNQAQSGNI QSTVMLDKQK ELDSKVRNVK
DKVMCIEHEI KSLEDLQDEY DFKCKTLQNR EHETNGVAKS DQKQEQLLLK
KMYLMLDNKR KEVVHKIIEL LNVTELTQNA LINDELVEWK RRQQSACIGG
PPNACLDQLQ NWFTIVAESL QQVRQQLKKL EELEQKYTYE HDPITKNKQV
LWDRTFSLFQ QLIQSSFVVE RQPCMPTHPQ RPLVLKTGVQ FTVKLRLLVK
LQELNYNLKV KVLFDKDVNE RNTVKGFRKF NILGTHTKVM NMEESTNGSL
AAEFRHLQLK EQKNAGTRTN EGPLIVTEEL HSLSFETQLC QPGLVIDLET
TSLPVVVISN VSQLPSGWAS ILWYNMLVAE PRNLSFFLTP PCARWAQLSE
VLSWQFSSVT KRGLNVDQLN MLGEKLLGPN ASPDGLIPWT RFCKENINDK
NFPFWLWIES ILELIKKHLL PLWNDGCIMG FISKERERAL LKDQQPGTFL
LRFSESSREG AITFTWVERS QNGGEPDFHA VEPYTKKELS AVTFPDIIRN
YKVMAAENIP ENPLKYLYPN IDKDHAFGKY YSRPKEAPEP MELDGPKGTG
YIKTELISVS EVHPSRLQTT DNLLPMSPEE FDEVSRIVGS VEFDSMMNTV
Кодований геном білок за функціями належить доактиваторів ,фосфопротеїнів .
Задіяний у таких біологічних процесах як взаємодія хазяїн-вірус ,транскрипція ,регуляціятранскрипції ,антивірусний захист, поліморфізм, ацетиляція,альтернативний сплайсинг .
Білок має сайт для зв'язування зДНК .
Локалізований уцитоплазмі ,ядрі .
Schindler C., Fu X.-Y., Improta T., Aebersold R., Darnell J.E. Jr. (1992). Proteins of transcription factor ISGF-3: one gene encodes the 91- and 84-kDa ISGF-3 proteins that are activated by interferon alpha.Proc. Natl. Acad. Sci. U.S.A .89 :7836—7839. PMID 1502203 DOI :10.1073/pnas.89.16.7836
The status, quality, and expansion of the NIH full-length cDNA project: the Mammalian Gene Collection (MGC).Genome Res .14 :2121—2127. 2004. PMID 15489334 DOI :10.1101/gr.2596504
Yan R., Qureshi S., Zhong Z., Wen Z., Darnell J.E. Jr. (1995). The genomic structure of the STAT genes: multiple exons in coincident sites in Stat1 and Stat2.Nucleic Acids Res .23 :459—463. PMID 7885841 DOI :10.1093/nar/23.3.459
Fu X.Y. (1992). A transcription factor with SH2 and SH3 domains is directly activated by an interferon alpha-induced cytoplasmic protein tyrosine kinase(s).Cell .70 :323—335. PMID 1638633 DOI :10.1016/0092-8674(92)90106-M
Wen Z., Zhong Z., Darnell J.E. Jr. (1995). Maximal activation of transcription by Stat1 and Stat3 requires both tyrosine and serine phosphorylation.Cell .82 :241—250. PMID 7543024 DOI :10.1016/0092-8674(95)90311-9
Li X., Leung S., Kerr I.M., Stark G.R. (1997).Functional subdomains of STAT2 required for preassociation with the alpha interferon receptor and for signaling .Mol. Cell. Biol .17 :2048—2056. PMID 9121453 DOI :10.1128/MCB.17.4.2048
(1) Основні домени
(1.1)Лейцинова застібка (bZIP)(1.2) Спіраль-петля-спіраль (bHLH)(1.3) Спіраль-петля-спіраль / Лейцинова застібка (bHLH-ZIP)(1.4) NF-1 (1.5) RF-X (1.6) Спіраль-інтервал-спіраль (bHSH)
(2) Цинк-координовані домени ДНК
(2.1) Ядерні рецептори з цинковими пальцями(Cys4 )
підродина 1 підродина 2 підродина 3 підродина 4 підродина 5 підродина 6 підродина 0
(2.2) Інші цинкові пальці Cys4 (2.3) Cys2 His2 з доменом цинкових пальців(2.4) Cys6 цистеїн-цинковий кластер(2.5) Цинкові пальці іншого складу (2.6) WRKY
(3) Домени спіраль-поворот-спіраль
(3.1) Гомеобокс (3.2) Парний бокс (3.3) Вилкова головка / Крилата спіраль(3.4) Фактори теплового шоку(3.5) Триптофановий кластер (3.6) Домен транскрипційний енхансер
(4)Бета-складчасті фактори з незначним жолобковим контактом
(4.1) RHR(4.2) STAT(4.3) p53 (4.4) MADS(4.6) TATA(4.7) Високомобільна група (4.9) Grainyhead (4.10) Домен холодового шоку (4.11) Runt
(0) Інші фактори транскрипції
(0.2) HMGI(Y) (0.3) Pocket домен (0.5) AP2/EREBP-подібні(0.6) Інші